RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA THI3Q07471 609 aa3.31□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA SWT1Q12104 458 aa3.31□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA ATP2P00830 511 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA YML003WP0CF16 290 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA MSS51P32335 436 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA EXO84P38261 753 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA ERV46P39727 415 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA UBP7P40453 1071 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA SMK1P41808 388 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA ASE1P50275 885 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA COP1P53622 1201 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA TPK1P06244 397 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA YAP1P19880 650 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA RFA2P26754 273 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA RAD16P31244 790 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA RGT1P32862 1170 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA GEX2P36173 615 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA JHD1P40034 492 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA ASG1P40467 964 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA MNT3P40549 630 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA MEP2P41948 499 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA CTF18P49956 741 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA YGR021WP53212 290 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA DCP2P53550 970 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA VTC3Q02725 835 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA TFC6Q06339 672 aa3.3□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA SSM4P40318 1319 aa3.29□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA PCT1P13259 424 aa3.29□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA PSY4P38193 441 aa3.29□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA ARN1P38731 627 aa3.29□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA TOM71P38825 639 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA SPC97P38863 823 aa3.29□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA TPA1P40032 644 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA YIL024CP40543 189 aa3.29□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA CDC1P40986 491 aa3.29□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA YJL107CP42947 387 aa3.29□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA ADE16P54113 591 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA STP3Q05937 343 aa3.29□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA COX17Q12287 69 aa3.29□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA TY2A-LR1P0C2J4 438 aa3.28□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA TY2A-FP0CX61 438 aa3.28□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA TY2A-GR2P0CX62 438 aa3.28□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA TY2A-CP25383 438 aa3.28□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA DPB3P27344 201 aa3.28□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA IFA38P38286 347 aa3.28□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA COG1P53079 417 aa3.28□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA YPR003CP53394 754 aa3.28□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA TY2A-DR2Q03483 438 aa3.28□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA TY2A-BQ12260 438 aa3.28□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA TY2A-OR2Q12293 438 aa3.28□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA TY2A-DR1Q12392 438 aa3.28□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA TY2A-OR1Q12439 438 aa3.28□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA TY2A-DR3Q99303 438 aa3.28□□□□□ -1.88
15S_rRNA15S_rRNA SUI3P09064 285 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA MRP2P10663 115 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data3.27□□□□□ -1.89not detected
15S_rRNA15S_rRNA YSP3P25036 478 aa3.27□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA OCT1P35999 772 aa3.27□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA TEF4P36008 412 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA FUI1P38196 639 aa3.27□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA UME6P39001 836 aa3.27□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA PCI8P40512 444 aa3.27□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA IST3P40565 148 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA IRC8P47046 822 aa3.27□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA GTR1Q00582 310 aa3.27□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA MRPL1Q04599 285 aa3.27□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA SWA2Q06677 668 aa3.27□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA YPR089WO13585 888 aa3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA RPT3P33298 428 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA TFC3P34111 1160 aa3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA PSP1P50896 841 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA PDR8Q06149 701 aa3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA TMA16Q08687 178 aa3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA PFA4Q12006 378 aa3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA ERG27Q12452 347 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA PCD1Q12524 340 aa3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA YER190C-BP0CX94 160 aa3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA YEL077W-AP0CX95 160 aa3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA YGR296C-BP0CX96 160 aa3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA YPL283W-BP0CX97 160 aa3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA YPR204C-AP0CX98 160 aa3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA CNA1P23287 553 aa3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA ASK1P35734 292 aa3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA YMR124WP39523 943 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA MRX1P40050 688 aa3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA IML2P47031 731 aa3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA MCH4Q08268 501 aa3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA RRI1Q12468 440 aa3.26□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA GAL4P04386 881 aa3.25□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA SRP54P20424 541 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA SRB5P32585 307 aa3.25□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA LHS1P36016 881 aa3.25□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA AAP1P37898 856 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA KAP123P40069 1113 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA RIC1P40395 1056 aa3.25□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA RPN11P43588 306 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA UBP8P50102 471 aa3.25□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA SCW4P53334 386 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA EAF7P53911 425 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
15S_rRNA15S_rRNA ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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