RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap15-1Q9QZU5 150 aa6.75□□□□□ -1.33
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Herc1E9PZP8 4859 aa6.68□□□□□ -1.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap28-13A0A087WQP5 138 aa6.68□□□□□ -1.34
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cox6b2Q80ZN9 88 aa6.66□□□□□ -1.34
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A030005K14RikA0A1Y7VNY1 122 aa6.64□□□□□ -1.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CriptO70333 101 aa6.64□□□□□ -1.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnase13Q5GAM7 153 aa6.55□□□□□ -1.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl37Q9D823 97 aa6.55□□□□□ -1.36
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17606F6ZL36 78 aa6.43□□□□□ -1.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce1mQ9CR91 182 aa6.4□□□□□ -1.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Romo1P60603 79 aa6.37□□□□□ -1.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ubr4A2AN08 5180 aa6.35□□□□□ -1.39
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17416Q30KP4 66 aa6.27□□□□□ -1.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec61bQ9CQS8 96 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21887J3QQ04 176 aa6.24□□□□□ -1.41
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ZanO88799 5376 aa6.18□□□□□ -1.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap13-1Q8K198 168 aa6.17□□□□□ -1.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2210017I01RikA0A0A6YVV1 95 aa6.15□□□□□ -1.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap16-3Q8C1I6 86 aa6.12□□□□□ -1.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4932415D10RikA0A1W2P6U8 4986 aa6.11□□□□□ -1.43
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fat4Q2PZL6 4981 aa6.06□□□□□ -1.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa6.05□□□□□ -1.44
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap1-5A2A590 122 aa5.96□□□□□ -1.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf213E9Q555 5152 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LorP18165 486 aa5.93□□□□□ -1.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm19402J3QJV4 266 aa5.93□□□□□ -1.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7735D3YX18 52 aa5.9□□□□□ -1.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufaf8A2AMZ4 74 aa5.9□□□□□ -1.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap7-1Q9D3I6 87 aa5.9□□□□□ -1.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prm1P02319 51 aa5.89□□□□□ -1.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A030003K21RikA0A1Y7VIM3 128 aa5.87□□□□□ -1.47
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17402F6Z0L5 76 aa5.72□□□□□ -1.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A0A1Y7VJ07 166 aa5.68□□□□□ -1.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap1-4Q3V2D6 188 aa5.68□□□□□ -1.5
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sprr2a1Q9CQK8 83 aa5.67□□□□□ -1.5
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap17-1A2A5X6 109 aa5.58□□□□□ -1.52
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap12-1Q9Z287 130 aa5.51□□□□□ -1.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SspoQ8CG65 4998 aa5.5□□□□□ -1.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Camk2n1Q6QWF9 78 aa5.49□□□□□ -1.53
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10061D3Z714 54 aa5.39□□□□□ -1.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap9-5A2A5X3 358 aa5.38□□□□□ -1.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap19-2Q925I0 141 aa5.37□□□□□ -1.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm9112A2AI92 75 aa5.33□□□□□ -1.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa5.3□□□□□ -1.56
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce1a2Q9D1K4 149 aa5.21□□□□□ -1.58
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Muc5bE9Q5I3 4800 aa5.17□□□□□ -1.58
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2310046K23RikA0A0A6YVW6 87 aa4.85□□□□□ -1.63
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11555B1AQ89 175 aa4.8□□□□□ -1.64
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap4-6Q3V4B7 195 aa4.77□□□□□ -1.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap4-2B1AQ85 167 aa4.73□□□□□ -1.65
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap4-7Q9D732 168 aa4.73□□□□□ -1.65
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce1gQ9D195 139 aa4.7□□□□□ -1.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap22-2J3QNX6 67 aa4.67□□□□□ -1.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syne2Q6ZWQ0 6874 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce1dQ9D731 133 aa4.62□□□□□ -1.67
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fsip2A2ARZ3 6995 aa4.61□□□□□ -1.67
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11595B1AQA7 289 aa4.49□□□□□ -1.69
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