RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	STP3	Q05937	343 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	BSC6	Q08280	497 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	MRC1	P25588	1096 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SPR1	P32603	445 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	NIP100	P33420	868 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SMF1	P38925	575 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	TMA108	P40462	946 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SNZ3	P43545	298 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YGL260W	P53056	76 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SPC105	P53148	917 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SNZ2	P53824	298 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	REG1	Q00816	1014 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SND1	Q04007	877 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	ARG7	Q04728	441 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.5	□□□□□ -1.69	not detected
YNL057W	YNL057W	AFI1	Q99222	893 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	INH1	P01097	85 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	BI2	P03873	423 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	GPA1	P08539	472 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	RBK1	P25332	333 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	RRN6	P32786	894 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	ALY1	P36117	915 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	EXO5	P38289	585 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	EFM2	P38347	419 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YER130C	P39959	443 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YEL028W	P39989	153 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	FAU1	P40099	211 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YIL054W	P40524	105 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SPG5	P42933	373 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YPT11	P48559	417 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SWC4	P53201	476 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	ESBP6	P53918	673 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	TRE2	Q08693	809 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	GUP2	Q08929	609 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	THI21	Q08975	551 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	TRM8	Q12009	286 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YPR089W	O13585	888 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	RPC31	P17890	251 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	MSH3	P25336	1018 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SPC110	P32380	944 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.48	□□□□□ -1.69	not detected
YNL057W	YNL057W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SPT8	P38915	602 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YAL037W	P39728	267 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	CSN12	P47130	423 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	IPI3	P53877	555 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	TEP1	P53916	434 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	TRS23	Q03784	219 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	DIC1	Q06143	298 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	CDA2	Q06703	312 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SWC7	Q06707	132 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	CLC1	P17891	233 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	RNQ1	P25367	405 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	LDB16	P25587	256 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	SCD5	P34758	872 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YKL050C	P35736	922 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	ARA1	P38115	344 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	FUI1	P38196	639 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	MSR1	P38714	643 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	TDA3	P38758	523 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	MGS1	P40151	587 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	UBX6	P47049	396 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	RPA14	P50106	137 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	TIM13	P53299	105 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.47	□□□□□ -1.69	not detected
YNL057W	YNL057W	YNL143C	P53908	130 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	EMI1	Q04406	187 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	GRX8	Q05926	109 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	VPS68	Q12016	184 aa		4.47	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.8 ms