RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W SIR1P21691 654 aa4.19□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W MSH2P25847 964 aa4.19□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W URA7P28274 579 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W BEM3P32873 1128 aa4.19□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W SWE1P32944 819 aa4.19□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W MAK5P38112 773 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W YSW1P38280 609 aa4.19□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W STN1P38960 494 aa4.19□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W PEX8P53248 589 aa4.19□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W YGR127WP53275 312 aa4.19□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W YNR063WP53749 607 aa4.19□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W KTR5P53966 522 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W BET4Q00618 327 aa4.19□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W ARP9Q05123 467 aa4.19□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W YDR278CQ05612 105 aa4.19□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W NUT2Q06213 157 aa4.19□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data4.19□□□□□ -1.74not detected
SPC105YGL093W PEX11Q12462 236 aa4.19□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W ILS1P09436 1072 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W SCH9P11792 824 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W INO1P11986 533 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W HOM2P13663 365 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W HEM15P16622 393 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W STE13P33894 931 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W SMF2P38778 549 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W RMD8P43620 662 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W PET130P47065 347 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W FAA4P47912 694 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W TRM112P53738 135 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W TEP1P53916 434 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W YHM2Q04013 314 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W STE23Q06010 1027 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W YPR114WQ06107 315 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W YLR046CQ12253 270 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W RPS14AP06367 137 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W URA10P30402 227 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W MRS6P32864 603 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W SPT23P35210 1082 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W URA8P38627 578 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W RPS14BP39516 138 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W MEP1P40260 492 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W ATM1P40416 690 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W ERG10P41338 398 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W YNL320WP42840 284 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W NMD5P46970 1048 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W RSM7P47150 247 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data4.18□□□□□ -1.74not detected
SPC105YGL093W BIO5P53744 561 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W PPN1Q04119 674 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W FRA1Q07825 749 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W GTT2Q12390 233 aa4.18□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W AMS1P22855 1083 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W YSP3P25036 478 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W PHO84P25297 587 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W GEX1P25596 615 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W TPS2P31688 896 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W YKL097CP34245 136 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W STB6P36085 766 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W GEX2P36173 615 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W DMA1P38823 416 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W MKT1P40850 830 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W BLS1Q06071 122 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W YCS4Q06156 1176 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W RSC2Q06488 889 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W MCD1Q12158 566 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W SEM1O94742 89 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data4.17□□□□□ -1.74not detected
SPC105YGL093W HCM1P25364 564 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W YJU3P28321 313 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W HXT3P32466 567 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W SLD2P34252 453 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W CNN1P43618 361 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W TAH11P47112 604 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W YJR124CP47159 448 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W SPC105P53148 917 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W YNL143CP53908 130 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W DOS2P54858 310 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W RRB1Q04225 511 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W MCP2Q06567 569 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W OCA6Q12454 224 aa4.17□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W COX5AP00424 153 aa4.16□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W APA1P16550 321 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W CLN1P20437 546 aa4.16□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W MGT1P26188 188 aa4.16□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W MRP21P38175 177 aa4.16□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W HXT5P38695 592 aa4.16□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W CCT6P39079 546 aa4.16□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W MNN1P39106 762 aa4.16□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W RGI2P40188 164 aa4.16□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W YJR061WP40355 935 aa4.16□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W MIC19P43594 170 aa4.16□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W RCF2P53721 224 aa4.16□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W YNR061CP53747 219 aa4.16□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W SPP2Q02521 185 aa4.16□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W PET117Q02771 107 aa4.16□□□□□ -1.74
SPC105YGL093W INA17Q02888 182 aa4.16□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.8 ms