RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa15.05■□□□□ -0
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krtap11-1E9Q2E9 183 aa15.04■□□□□ -0
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klk12B2RVZ0 247 aa15.03■□□□□ -0
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10845Q3UNY9 185 aa15.03■□□□□ -0
Trafd1-201ENSMUST00000042312 A830031A19RikQ8BNT5 113 aa15.03■□□□□ -0
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klk11Q9QYN3 276 aa15.03■□□□□ -0
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smim20D3Z7Q2 69 aa15.03■□□□□ -0
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Defa25Q5G864 92 aa15.03■□□□□ -0
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv2-109A0A075B5K6 120 aa15.02□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10518F6UQQ9 182 aa15.01□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10320E9PW43 113 aa15□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv8-16A0A0G2JDG9 121 aa14.99□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv8-24A0A140T8P5 121 aa14.99□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SmcpP15265 143 aa14.99□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Defa20Q45VN2 95 aa14.99□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm867A0A1W2P7T4 151 aa14.98□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tcl1b3P56842 122 aa14.98□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klk9Q32M27 251 aa14.98□□□□□ -0.01
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tenm1Q9WTS4 2731 aa14.96□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CicQ924A2 2510 aa14.95□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4930535I16RikQ9CUI2 172 aa14.95□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Reg3dQ9QUS9 175 aa14.95□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv4-58A0A0G2JGI6 119 aa14.94□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cmc4Q61908 68 aa14.94□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CnbpP53996 178 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q9DAA7 145 aa14.94□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 P01819 144 aa14.93□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 D130052B06RikQ3UW13 202 aa14.93□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Csdc2Q91YQ3 154 aa14.93□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4930556J24RikQ9D4U7 146 aa14.92□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cystm1Q8K353 104 aa14.92□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cox7bP56393 80 aa14.91□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Defa2P28309 93 aa14.9□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 EnhoQ8K1D8 76 aa14.9□□□□□ -0.02
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ighv2-9A0A075B5Q5 116 aa14.89□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 7530416G11RikJ3QJX6 159 aa14.89□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rpl18aP62717 176 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hist1h4aP62806 103 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv3-1A0A075B5P1 119 aa14.88□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm9805F6YK59 57 aa14.88□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm9903Q8C9Y8 129 aa14.88□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ighv10-3A0A075B5T6 119 aa14.86□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ntn5Q3UQ22 452 aa14.86□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 E130208F15RikQ3UPV3 143 aa14.85□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ighv8-13A0A075B5Y0 101 aa14.84□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm11213A0A1B0GR83 88 aa14.84□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 A0A286YCN5 57 aa14.84□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ighv13-2A0A0A6YWN3 119 aa14.84□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm20726G3UX18 150 aa14.84□□□□□ -0.03
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ScxQ64124 207 aa14.83□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv8-27A0A0G2JF28 120 aa14.83□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 E130218I03RikA0A0U1RNU5 63 aa14.83□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv8-30A0A140T8M3 121 aa14.83□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ube2d4D3YUH6 135 aa14.83□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tcl1b5P56845 121 aa14.82□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm3618D3Z4P5 127 aa14.81□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm2916Q9D9B9 127 aa14.81□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Snhg11Q4G0K9 87 aa14.8□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PolqQ8CGS6 2544 aa14.8□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem254aP0DN89 123 aa14.8□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem254bP0DN90 123 aa14.8□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem254cP0DN91 123 aa14.8□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AY074887Q8R5F9 132 aa14.8□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv8-26A0A075B5N5 123 aa14.79□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv8-21A0A140T8P7 120 aa14.79□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ighv10-1A0A0B4J1J6 119 aa14.78□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ApcQ61315 2845 aa14.78□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Naa38Q9D2U5 125 aa14.77□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Itpr2Q9Z329 2701 aa14.77□□□□□ -0.04
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Msrb1Q9JLC3 116 aa14.77□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Defa7P50705 93 aa14.76□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ormdl1Q921I0 153 aa14.76□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AtrQ9JKK8 2635 aa14.76□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10770F7D043 238 aa14.75□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MplkipQ9D011 178 aa14.75□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mrpl52Q9D0Y8 121 aa14.75□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 A730009L09RikA0A1B0GS82 72 aa14.74□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam19a1Q7TPG8 133 aa14.74□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10308Q9CVR5 141 aa14.74□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ufsp1Q9CZP0 217 aa14.74□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm7138L7N2C3 230 aa14.74□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lamtor3O88653 124 aa14.74□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm3238W4VSP7 230 aa14.74□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm17509Q9CZ61 145 aa14.73□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv1-88A0A140T8N1 120 aa14.72□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Notch2O35516 2470 aa14.71□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 2310034G01RikA0A286YDL3 209 aa14.71□□□□□ -0.05
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SvipQ3UZP4 77 aa14.7□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv8-34A0A0G2JDU0 121 aa14.7□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Reg3bP35230 175 aa14.7□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4930518I15RikQ3V2W7 57 aa14.69□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 9530003J23RikQ8BM26 151 aa14.69□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cox7b2Q9D2H1 82 aa14.68□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv4-92A0A0B4J1I2 117 aa14.68□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm17577J3QNF7 156 aa14.67□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Defa21Q8C1P2 93 aa14.67□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ubl5Q9EPV8 73 aa14.67□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 9430015G10RikA2ASP7 199 aa14.67□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Serp2Q6TAW2 65 aa14.67□□□□□ -0.06
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Defb37Q7TMD2 62 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 125.9 ms