Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl18aP62717 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl18aP62717 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl18aP62717 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl18aP62717 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl18aP62717 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpl18aP62717 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpl18aP62717 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpl18aP62717 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl18aP62717 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl18aP62717 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl18aP62717 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl18aP62717 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl18aP62717 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl18aP62717 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl18aP62717 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl18aP62717 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpl18aP62717 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpl18aP62717 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpl18aP62717 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpl18aP62717 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpl18aP62717 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpl18aP62717 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl18aP62717 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpl18aP62717 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl18aP62717 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpl18aP62717 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpl18aP62717 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpl18aP62717 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl18aP62717 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl18aP62717 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl18aP62717 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl18aP62717 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl18aP62717 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl18aP62717 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl18aP62717 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl18aP62717 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl18aP62717 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl18aP62717 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl18aP62717 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl18aP62717 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl18aP62717 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl18aP62717 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpl18aP62717 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl18aP62717 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl18aP62717 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl18aP62717 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl18aP62717 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl18aP62717 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl18aP62717 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl18aP62717 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl18aP62717 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl18aP62717 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl18aP62717 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl18aP62717 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl18aP62717 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl18aP62717 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl18aP62717 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl18aP62717 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl18aP62717 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl18aP62717 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl18aP62717 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl18aP62717 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl18aP62717 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl18aP62717 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl18aP62717 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl18aP62717 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl18aP62717 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl18aP62717 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl18aP62717 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl18aP62717 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl18aP62717 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl18aP62717 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl18aP62717 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl18aP62717 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl18aP62717 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl18aP62717 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl18aP62717 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl18aP62717 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl18aP62717 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl18aP62717 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl18aP62717 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl18aP62717 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl18aP62717 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl18aP62717 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl18aP62717 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl18aP62717 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl18aP62717 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl18aP62717 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl18aP62717 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl18aP62717 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl18aP62717 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl18aP62717 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl18aP62717 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl18aP62717 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl18aP62717 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl18aP62717 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl18aP62717 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl18aP62717 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl18aP62717 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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