RNA–Protein interactions for RNA: YPL166W

ATG29, Transcript of Autophagy-specific protein, yeast

Gene ATG29, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG29	YPL166W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	ATP23	P53722	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	UBP16	Q02863	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	YML119W	Q03208	357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	RAD33	Q04231	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	IRC3	Q06683	689 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG29	YPL166W	MBR1	P23493	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	GSY2	P27472	705 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	APM3	P38153	483 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	RAD26	P40352	1085 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	HIM1	Q06674	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	AIM6	Q07716	390 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	BI2	P03873	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	SIR1	P21691	654 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	MSH1	P25846	959 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	SAE2	P46946	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	MPS1	P54199	764 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	AAT1	Q01802	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	HRD3	Q05787	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	MSS18	P08593	268 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	VPS8	P39702	1274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	CAB2	P40506	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	SCS3	P53012	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	YML053C	Q04978	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	BSP1	Q06604	576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	CYK3	Q07533	885 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	ICL2	Q12031	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	LCB4	Q12246	624 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	PIF1	P07271	859 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	POL3	P15436	1097 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	BEM3	P32873	1128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	CIR1	P42940	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	BST1	P43571	1029 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	YNL058C	P53947	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	ARA2	Q04212	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	PLM2	Q04383	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	PDE1	P22434	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	RIT1	P23796	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	YHL041W	P38730	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	STP1	Q00947	519 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	FRE7	Q12333	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	SWC3	P31376	625 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	SIP1	P32578	815 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	NMD5	P46970	1048 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	ATG21	Q02887	496 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	PHO81	P17442	1178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	SPC72	P39723	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	YJR008W	P47085	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	TPO3	Q06451	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG29	YPL166W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	SNO3	P43544	222 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	IOC4	Q04213	475 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	CIR2	Q08822	631 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	GEP3	Q08622	556 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	YUR1	P26725	428 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	FTH1	P38310	465 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	ERC1	P38767	581 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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