RNA–Protein interactions for RNA: YMR267W

PPA2, Transcript of Mitochondrial inorganic pyrophosphatase, yeast

Gene PPA2, Length 933 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPA2	YMR267W	VPS8	P39702	1274 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	COQ6	P53318	479 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	STP3	Q05937	343 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	YDL121C	Q07541	149 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	AAC1	P04710	309 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	PET122	P10355	254 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	AMD2	P22580	549 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	LOT5	P34234	306 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	CPR8	P53728	308 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	COX17	Q12287	69 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	WHI2	P12611	486 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	SSH4	P32343	579 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	MUP3	P38734	546 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	UBP16	Q02863	499 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	GIS1	Q03833	894 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	ARG7	Q04728	441 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	PCL8	Q08966	492 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	URK1	P27515	501 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	GDA1	P32621	518 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	RRN3	P36070	627 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	NPR3	P38742	1146 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	AXL2	P38928	823 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	CTF18	P49956	741 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	VID22	Q05934	901 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	YMC1	P32331	307 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	MCM10	P32354	571 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	MTG2	P38860	518 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	YFL015C	P43578	164 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	ZAP1	P47043	880 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	SLC1	P33333	303 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	LNP1	P38878	278 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	BUD16	P39988	312 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	YEL020C	P39994	560 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	IMO32	P53219	342 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	MEP3	P53390	489 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	WAR1	Q03631	944 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	YML053C	Q04978	212 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	VAM6	Q07468	1049 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	YDL242W	Q07746	117 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	NKP1	Q12493	238 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PPA2	YMR267W	PMA2	P19657	947 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	AAD3	P25612	363 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	MRPL9	P31334	269 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	MRPL36	P36531	177 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	RAD33	Q04231	177 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	TPK1	P06244	397 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	GEX2	P36173	615 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	RAD26	P40352	1085 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	COG1	P53079	417 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	CRT10	Q08226	957 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	MAM1	P40065	302 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	STU2	P46675	888 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	YGR079W	P53249	370 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	ULA1	Q12059	462 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	LCB4	Q12246	624 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.61	□□□□□ -1.51	not detected
PPA2	YMR267W	PDE1	P22434	369 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	TY2A-C	P25383	438 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	RER1	P25560	188 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	RAD16	P31244	790 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	UME6	P39001	836 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	PSD1	P39006	500 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	YER010C	P40011	234 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	YIL166C	P40445	542 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	SKP2	P42843	763 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	NPA3	P47122	385 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PPA2	YMR267W	SNO4	Q04902	237 aa		5.61	□□□□□ -1.51

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 78.4 ms