RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
RPS1B	YML063W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	RCN2	Q12044	265 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	ELG1	Q12050	791 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	REX3	Q12090	404 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	PCD1	Q12524	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	RIM15	P43565	1770 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	COQ4	O13525	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	PRC1	P00729	532 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	PRE8	P23639	250 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	POA1	P38218	177 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	SPO22	P40511	975 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	DSE4	P53753	1117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YNR071C	P53757	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	RCM1	P53972	490 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	ARP4	P80428	489 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
RPS1B	YML063W	TGL5	Q12043	749 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	OSW2	Q12202	724 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	GPI10	P30777	616 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	MGM1	P32266	881 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	LRG1	P35688	1017 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	TOS1	P38288	455 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	AKR1	P39010	764 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	CAB2	P40506	365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	IRC24	P40580	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YJL055W	P47044	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YJL045W	P47052	634 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	CTH1	P47976	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	EXG2	P52911	562 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	SHE10	P53075	577 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	JJJ1	P53863	590 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	HOT1	Q03213	719 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	ARP9	Q05123	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	HOS1	Q12214	470 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	GRX6	Q12438	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	TPK1	P06244	397 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	PCK1	P10963	549 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	IME2	P32581	645 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	SET3	P36124	751 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YBL029W	P38201	376 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	APN2	P38207	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	RTT105	P40063	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	GID8	P40208	455 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	CEP3	P40969	608 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YNR061C	P53747	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YSA1	Q01976	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	ATG21	Q02887	496 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	PPN1	Q04119	674 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
RPS1B	YML063W	NFI1	Q12216	726 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	RIT1	P23796	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	POL4	P25615	582 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
RPS1B	YML063W	PET127	P32606	800 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YHR131C	P38835	850 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	SPT8	P38915	602 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	MET18	P40469	1032 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	MRX6	P48564	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	VPS4	P52917	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	SGF73	P53165	657 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	PUS2	P53167	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	YGR130C	P53278	816 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS1B	YML063W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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