RNA–Protein interactions for RNA: YHR106W

TRR2, Transcript of Mitochondrial thioredoxin reductase, yeast

Gene TRR2, Length 1,029 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRR2	YHR106W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	YDR278C	Q05612	105 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	PEX15	Q08215	383 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	YDR018C	Q12185	396 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	RAD10	P06838	210 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	SEC63	P14906	663 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	PPE1	P38796	400 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	END3	P39013	349 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	FLC2	P39719	783 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	MET14	Q02196	202 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	SWC7	Q06707	132 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	AAD15	Q08361	143 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	PGC1	Q08959	321 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	CSF1	Q12150	2958 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	YLL056C	Q12177	298 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	NUM1	Q00402	2748 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	MNE1	P24720	663 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	TFB1	P32776	642 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	PMT1	P33775	817 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	YKL151C	P36059	337 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	SRX1	P36077	127 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	DCW1	P36091	449 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	MMS21	P38632	267 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	WSC4	P38739	605 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	GIP4	P39732	760 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	ELO3	P40319	345 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	ATM1	P40416	690 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	YML6	P51998	286 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	YGL140C	P53120	1219 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.28	□□□□□ -1.24	not detected
TRR2	YHR106W	BOP3	P53958	396 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	SMA1	Q02651	245 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	MSH6	Q03834	1242 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	YLR001C	Q07895	862 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	SFI1	Q12369	946 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	YOR338W	Q99326	363 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	UBR1	P19812	1950 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TRR2	YHR106W	AIM26	P32858	118 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	YHR078W	P38799	552 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	CAJ1	P39101	391 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	SEC9	P40357	651 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	GLG2	P47011	380 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	COQ5	P49017	307 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	YPR003C	P53394	754 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	INA17	Q02888	182 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	VAC14	Q06708	880 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	NRT1	Q08485	598 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	OCA6	Q12454	224 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	AVL9	Q12500	764 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	IRA1	P18963	3092 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	HSF1	P10961	833 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	CLC1	P17891	233 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	TGL4	P36165	910 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	SAW1	P39735	261 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	SER33	P40510	469 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	SIP4	P46954	829 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	IML2	P47031	731 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	DAN4	P47179	1161 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	MNT2	P53059	558 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	YGR127W	P53275	312 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	YPR114W	Q06107	315 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	FRT1	Q99332	602 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	COX5A	P00424	153 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	RAD3	P06839	778 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	SRP101	P32916	621 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	ALY1	P36117	915 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	YAT2	P40017	923 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	RAD26	P40352	1085 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	YJR124C	P47159	448 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	TEP1	P53916	434 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	YDR131C	Q03899	556 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	PPN1	Q04119	674 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	EAF1	Q06337	982 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	YDL129W	Q07555	291 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	LDB18	Q07887	179 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TRR2	YHR106W	OPI10	Q08202	246 aa		7.25	□□□□□ -1.25

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