RNA–Protein interactions for RNA: YFR009W

GCN20, Transcript of Positive regulator of the Gcn2p kinase activity, yeast

Gene GCN20, Length 2,259 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GCN20	YFR009W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	ECM29	P38737	1868 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	VPS3	P23643	1011 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	GAC1	P28006	793 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	YDR089W	P38966	869 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	PRM9	P39551	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	YAT2	P40017	923 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	FIR1	P40020	876 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	SUM1	P46676	1062 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	RTP1	Q12751	981 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	INO1	P11986	533 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	YCL068C	P25593	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	NDI1	P32340	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	ASH1	P34233	588 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	AST1	P35183	429 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	RRN3	P36070	627 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	RRN7	P40992	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	VTC4	P47075	721 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	YGR127W	P53275	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	SLG1	P54867	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	YKU80	Q04437	629 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	AAD4	Q07747	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	STE6	P12866	1290 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	YAK1	P14680	807 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	VPH2	P32341	215 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	TFC1	P32367	649 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	YBR259W	P38338	688 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	PPE1	P38796	400 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	MAM33	P40513	266 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	IAH1	P41734	238 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	YFL012W	P43580	148 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	COG2	P53271	262 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	MET14	Q02196	202 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
GCN20	YFR009W	NKP1	Q12493	238 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GCN20	YFR009W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	UTR2	P32623	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	GIP1	P38229	639 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	TDA11	P38854	504 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	RAD55	P38953	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	GRX8	Q05926	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	CST9	Q06032	482 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ATG17	Q06410	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	TPK1	P06244	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	RHO2	P06781	192 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	VAC17	P25591	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	SRP101	P32916	621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	SHU2	P38957	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	BEM4	P39011	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	MEF2	P39677	819 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ALT2	P52892	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YGR016W	P53209	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	BUD32	P53323	261 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	KTR6	P54070	446 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	AIM32	Q04689	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	GAL80	P04387	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ATP12	P22135	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	SLA2	P33338	968 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	FUI1	P38196	639 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YBR053C	P38235	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ATG12	P38316	186 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YHR182W	P38870	785 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	STP1	Q00947	519 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	MUK1	Q02866	612 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	MCH5	Q08777	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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