RNA–Protein interactions for RNA: YDR107C

TMN2, Transcript of Protein with a role in cellular adhesion and filamentous growth, yeast

Gene TMN2, Length 2,019 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMN2	YDR107C	ZAP1	P47043	880 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMN2	YDR107C	GPI8	P49018	411 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMN2	YDR107C	NCS6	P53088	359 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMN2	YDR107C	SGF73	P53165	657 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMN2	YDR107C	RMT2	Q03305	412 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMN2	YDR107C	PLB2	Q03674	706 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMN2	YDR107C	YPL191C	Q08930	360 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMN2	YDR107C	VCX1	Q99385	411 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TMN2	YDR107C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	KIN82	P25341	720 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	BRF1	P29056	596 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	UBP13	P38187	747 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	LYS9	P38999	446 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	MET12	P46151	657 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	VPS4	P52917	437 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	INN1	P53901	409 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	TMA16	Q08687	178 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	TGL5	Q12043	749 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	SWM1	Q12379	170 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	POL1	P13382	1468 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	BPT1	P14772	1559 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	GPI10	P30777	616 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	YKL100C	P34248	587 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	COS12	P53053	380 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	THI22	Q06490	572 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	ISA2	Q12425	185 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	ECM5	Q03214	1411 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	YPK9	Q12697	1472 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	CBS1	P14066	229 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	APE1	P14904	514 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	SAS3	P34218	831 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	ALY1	P36117	915 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	APT2	P36973	181 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	YIL166C	P40445	542 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	AAD10	P47182	288 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	YML119W	Q03208	357 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	ARR3	Q06598	404 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	RCN2	Q12044	265 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	MNE1	P24720	663 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	OCA4	P25366	362 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	PEP3	P27801	918 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	GCS1	P35197	352 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	SAF1	P38352	637 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	AIM41	Q12032	185 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	PEP1	P32319	1579 aa		5	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	DCG1	P32460	244 aa		5	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	YBL029W	P38201	376 aa		5	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	RPP1	P38786	293 aa		5	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
TMN2	YDR107C	CHA4	P43634	648 aa		5	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	MTL1	P53214	551 aa		5	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	CTF4	Q01454	927 aa		5	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	FDC1	Q03034	503 aa		5	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	MDS3	P53094	1487 aa		5	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	RKR1	Q04781	1562 aa		5	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	PEX1	P24004	1043 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	STE50	P25344	346 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	YCR015C	P25616	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	JHD1	P40034	492 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	RGI2	P40188	164 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	LRO1	P40345	661 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	MET18	P40469	1032 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	JJJ1	P53863	590 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	MUB1	Q03162	620 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	AIM32	Q04689	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	SPE4	Q12455	300 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	CTT1	P06115	562 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	HIS5	P07172	385 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	CDC6	P09119	513 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	VPS33	P20795	691 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	MDL1	P33310	695 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	COS111	P38308	924 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	TDP1	P38319	544 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	SMF1	P38925	575 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	BUD16	P39988	312 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	LCB2	P40970	561 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TMN2	YDR107C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.5 ms