RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRAC1Q96KF2 57 aa12.87□□□□□ -0.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADM2Q7Z4H4 148 aa12.86□□□□□ -0.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa12.8□□□□□ -0.36
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa12.77□□□□□ -0.36
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 XP32Q5T750 250 aa12.69□□□□□ -0.38
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPL37P61927 97 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H0YAA0 97 aa12.65□□□□□ -0.38
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCA13Q86UQ4 5058 aa12.54□□□□□ -0.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1B0GU33 70 aa12.54□□□□□ -0.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa12.51□□□□□ -0.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COX6B2Q6YFQ2 88 aa12.51□□□□□ -0.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CSAG1Q6PB30 78 aa12.47□□□□□ -0.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC01554Q52M75 96 aa12.47□□□□□ -0.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TPRXLQ17RH7 258 aa12.45□□□□□ -0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BIRC6Q9NR09 4857 aa12.41□□□□□ -0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HERC2O95714 4834 aa12.4□□□□□ -0.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LPAP08519 4548 aa12.38□□□□□ -0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRP2P98164 4655 aa12.38□□□□□ -0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 J3QL48 77 aa12.37□□□□□ -0.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa12.25□□□□□ -0.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa12.15□□□□□ -0.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa12.1□□□□□ -0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 K7ERS5 55 aa12.09□□□□□ -0.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa12.07□□□□□ -0.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 S4R3F8 94 aa12.06□□□□□ -0.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCLOQ9Y6V0 5065 aa11.93□□□□□ -0.5
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CRIPTQ9P021 101 aa11.91□□□□□ -0.5
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ROMO1P60602 79 aa11.91□□□□□ -0.5
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A0D9SG42 100 aa11.9□□□□□ -0.51
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 P0C880 135 aa11.9□□□□□ -0.51
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MUC17Q685J3 4493 aa11.85□□□□□ -0.51
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa11.85□□□□□ -0.51
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HERC1Q15751 4861 aa11.82□□□□□ -0.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HMCN2Q8NDA2 5059 aa11.68□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP12-2P59991 146 aa11.67□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MUC2Q02817 5179 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP12-1P59990 96 aa11.59□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa11.52□□□□□ -0.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C10orf95Q9H7T3 257 aa11.51□□□□□ -0.57
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 M0QZ58 72 aa11.48□□□□□ -0.57
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPINT4Q6UDR6 99 aa11.48□□□□□ -0.57
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H3BS24 57 aa11.43□□□□□ -0.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBR4Q5T4S7 5183 aa11.19□□□□□ -0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 R4GN34 69 aa11.16□□□□□ -0.62
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LORP23490 312 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa11.13□□□□□ -0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF213Q63HN8 5207 aa11.13□□□□□ -0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE2CQ5TA81 110 aa11.09□□□□□ -0.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAT4Q6V0I7 4981 aa11.08□□□□□ -0.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 M0R2T5 61 aa10.87□□□□□ -0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MT1HP80294 61 aa10.86□□□□□ -0.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NDUFAF8A1L188 74 aa10.81□□□□□ -0.68
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa10.58□□□□□ -0.72
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLAC4Q8WY50 150 aa10.56□□□□□ -0.72
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MT2AP02795 61 aa10.53□□□□□ -0.72
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MT1FP04733 61 aa10.52□□□□□ -0.73
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP10-10P60014 251 aa10.5□□□□□ -0.73
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PP632Q6XCG6 107 aa10.5□□□□□ -0.73
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa10.5□□□□□ -0.73
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPRR2GQ9BYE4 73 aa10.48□□□□□ -0.73
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa10.46□□□□□ -0.73
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNP1P09430 55 aa10.23□□□□□ -0.77
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP23-1A1A580 65 aa10.18□□□□□ -0.78
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa10.11□□□□□ -0.79
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa10.09□□□□□ -0.79
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LUZP6Q538Z0 58 aa10.03□□□□□ -0.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MT1BP07438 61 aa10.02□□□□□ -0.81
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa9.91□□□□□ -0.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP10-5P60370 271 aa9.8□□□□□ -0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MT1XP80297 61 aa9.8□□□□□ -0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE2BO14633 110 aa9.79□□□□□ -0.84
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE3AQ5TA76 89 aa9.72□□□□□ -0.85
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USH2AO75445 5202 aa9.62□□□□□ -0.87
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A0A0MQY5 61 aa9.57□□□□□ -0.88
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRO2289Q9P1D8 64 aa9.57□□□□□ -0.88
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa9.51□□□□□ -0.89
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP10-12P60413 245 aa9.44□□□□□ -0.9
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP12-3P60328 96 aa9.24□□□□□ -0.93
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SSPOA2VEC9 5147 aa9.16□□□□□ -0.94
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KMT2DO14686 5537 aa9.13□□□□□ -0.95
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FSIP2Q5CZC0 6907 aa9.09□□□□□ -0.95
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa8.99□□□□□ -0.97
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.99□□□□□ -0.97
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa8.74□□□□□ -1.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE3CQ5T5A8 94 aa8.72□□□□□ -1.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 INE1O15225 51 aa8.71□□□□□ -1.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MT1EP04732 61 aa8.54□□□□□ -1.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa8.47□□□□□ -1.05
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MT1LQ93083 61 aa8.44□□□□□ -1.06
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.42□□□□□ -1.06
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.5 ms