RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569982.3

TMX3-211, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMX3, Length 582 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-211ENST00000569982 ATMQ13315 3056 aa0.48□□□□□ -2.33
TMX3-211ENST00000569982 XIRP2A4UGR9 3374 aa0.48□□□□□ -2.33
TMX3-211ENST00000569982 ZZEF1O43149 2961 aa0.48□□□□□ -2.33
TMX3-211ENST00000569982 TACC2O95359 2948 aa0.48□□□□□ -2.33
TMX3-211ENST00000569982 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
TMX3-211ENST00000569982 HTTP42858 3142 aa0.47□□□□□ -2.33
TMX3-211ENST00000569982 TRIOO75962 3097 aa0.47□□□□□ -2.33
TMX3-211ENST00000569982 BDP1A6H8Y1 2624 aa0.47□□□□□ -2.33
TMX3-211ENST00000569982 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
TMX3-211ENST00000569982 APCP25054 2843 aa0.47□□□□□ -2.33
TMX3-211ENST00000569982 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa0.47□□□□□ -2.33
TMX3-211ENST00000569982 FLNCQ14315 2725 aa0.47□□□□□ -2.33
TMX3-211ENST00000569982 CMYA5Q8N3K9 4069 aa0.47□□□□□ -2.33
TMX3-211ENST00000569982 FAT1Q14517 4588 aa0.47□□□□□ -2.33
TMX3-211ENST00000569982 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa0.46□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa0.46□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 LINC01556Q5JQF7 62 aa0.46□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa0.46□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 SPEGQ15772 3267 aa0.46□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 NCOR2Q9Y618 2525 aa0.45□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.45□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 LRBAP50851 2863 aa0.45□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 ACANP16112 2415 aa0.45□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 CEP250Q9BV73 2442 aa0.45□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 DNAH12Q6ZR08 3092 aa0.45□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 DMXL1Q9Y485 3027 aa0.45□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 NOTCH1P46531 2555 aa0.45□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 DEFB133Q30KQ1 61 aa0.45□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 LPAP08519 4548 aa0.45□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 CHD8Q9HCK8 2581 aa0.45□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 MUC3AQ02505 3323 aa0.44□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 LRRK2Q5S007 2527 aa0.44□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 PKHD1P08F94 4074 aa0.44□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 LRP1BQ9NZR2 4599 aa0.44□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 FREM2Q5SZK8 3169 aa0.44□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 LAMA3Q16787 3333 aa0.44□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 DMDP11532 3685 aa0.44□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 CSMD2Q7Z408 3487 aa0.44□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 SPRR2DP22532 72 aa0.44□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 RPS29P62273 56 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 ACACBO00763 2458 aa0.44□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 FAM186AA6NE01 2351 aa0.43□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 NEBP20929 6669 aa0.43□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP0.43□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa0.43□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 EPG5Q9HCE0 2579 aa0.43□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.43□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 Q9Y3F1 56 aa0.43□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa0.43□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 ZANQ9Y493 2812 aa0.43□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa0.43□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 SPG11Q96JI7 2443 aa0.43□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 HIVEP1P15822 2718 aa0.43□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 SVEP1Q4LDE5 3571 aa0.42□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 MTORP42345 2549 aa0.42□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 LOC400499M0QZD8 3231 aa0.42□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 ITPR1Q14643 2758 aa0.42□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 VPS13AQ96RL7 3174 aa0.42□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 SONP18583 2426 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 SPRR2BP35325 72 aa0.42□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.42□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 MUC17Q685J3 4493 aa0.42□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 MUC5ACP98088 5654 aa0.42□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 TENM3Q9P273 2699 aa0.41□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 MT1AP04731 61 aa0.41□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.41□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 WDFY4Q6ZS81 3184 aa0.41□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa0.41□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
TMX3-211ENST00000569982 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
TMX3-211ENST00000569982 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
TMX3-211ENST00000569982 KALRNO60229 2985 aa0.4□□□□□ -2.35
TMX3-211ENST00000569982 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.4□□□□□ -2.35
TMX3-211ENST00000569982 USP34Q70CQ2 3546 aa0.39□□□□□ -2.35
TMX3-211ENST00000569982 TLN2Q9Y4G6 2542 aa0.39□□□□□ -2.35
TMX3-211ENST00000569982 MXRA5Q9NR99 2828 aa0.39□□□□□ -2.35
TMX3-211ENST00000569982 UTRNP46939 3433 aa0.39□□□□□ -2.35
TMX3-211ENST00000569982 TGP01266 2768 aa0.39□□□□□ -2.35
TMX3-211ENST00000569982 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
TMX3-211ENST00000569982 SPRR2AP35326 72 aa0.39□□□□□ -2.35
TMX3-211ENST00000569982 HERC1Q15751 4861 aa0.38□□□□□ -2.35
TMX3-211ENST00000569982 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
TMX3-211ENST00000569982 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
TMX3-211ENST00000569982 MYO15AQ9UKN7 3530 aa0.37□□□□□ -2.35
TMX3-211ENST00000569982 HTN3P15516 51 aa0.37□□□□□ -2.35
TMX3-211ENST00000569982 SPRR2FQ96RM1 72 aa0.37□□□□□ -2.35
TMX3-211ENST00000569982 LAMA1P25391 3075 aa0.37□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 150.4 ms