RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-202ENST00000542324 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CS-202ENST00000542324 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CS-202ENST00000542324 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-202ENST00000542324 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-202ENST00000542324 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-202ENST00000542324 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
CS-202ENST00000542324 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-202ENST00000542324 CRIPTQ9P021 101 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-202ENST00000542324 S4R3F8 94 aa5.4□□□□□ -1.55
CS-202ENST00000542324 A0A1B0GVY2 172 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-202ENST00000542324 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-202ENST00000542324 PKHD1P08F94 4074 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-202ENST00000542324 P0C880 135 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-202ENST00000542324 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CS-202ENST00000542324 TPRXLQ17RH7 258 aa5.36□□□□□ -1.55
CS-202ENST00000542324 A0A0D9SG42 100 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-202ENST00000542324 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-202ENST00000542324 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
CS-202ENST00000542324 HERC1Q15751 4861 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-202ENST00000542324 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-202ENST00000542324 KRTAP10-8P60410 259 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-202ENST00000542324 XP32Q5T750 250 aa5.29□□□□□ -1.56
CS-202ENST00000542324 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CS-202ENST00000542324 KRTAP12-2P59991 146 aa5.25□□□□□ -1.57
CS-202ENST00000542324 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.25□□□□□ -1.57
CS-202ENST00000542324 KRTAP12-1P59990 96 aa5.24□□□□□ -1.57
CS-202ENST00000542324 M0QZ58 72 aa5.24□□□□□ -1.57
CS-202ENST00000542324 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.24□□□□□ -1.57
CS-202ENST00000542324 MUC2Q02817 5179 aa5.22□□□□□ -1.57
CS-202ENST00000542324 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.21□□□□□ -1.58
CS-202ENST00000542324 TNXBP22105 4242 aa5.2□□□□□ -1.58
CS-202ENST00000542324 FAT1Q14517 4588 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-202ENST00000542324 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
CS-202ENST00000542324 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CS-202ENST00000542324 Q5VSD8 79 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-202ENST00000542324 HSPG2P98160 4391 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-202ENST00000542324 NDUFAF8A1L188 74 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-202ENST00000542324 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-202ENST00000542324 MT1HL1P0DM35 61 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-202ENST00000542324 R4GN34 69 aa4.98□□□□□ -1.61
CS-202ENST00000542324 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.97□□□□□ -1.61
CS-202ENST00000542324 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.94□□□□□ -1.62
CS-202ENST00000542324 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.94□□□□□ -1.62
CS-202ENST00000542324 PLAC4Q8WY50 150 aa4.92□□□□□ -1.62
CS-202ENST00000542324 PP632Q6XCG6 107 aa4.91□□□□□ -1.62
CS-202ENST00000542324 MYCBP2O75592 4640 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-202ENST00000542324 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CS-202ENST00000542324 RNF213Q63HN8 5207 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-202ENST00000542324 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CS-202ENST00000542324 LUZP6Q538Z0 58 aa4.77□□□□□ -1.65
CS-202ENST00000542324 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-202ENST00000542324 J3QL48 77 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-202ENST00000542324 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-202ENST00000542324 LRP2P98164 4655 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-202ENST00000542324 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-202ENST00000542324 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-202ENST00000542324 LPAP08519 4548 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-202ENST00000542324 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-202ENST00000542324 LCE2BO14633 110 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-202ENST00000542324 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-202ENST00000542324 A0A0A0MQY5 61 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-202ENST00000542324 MUC17Q685J3 4493 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-202ENST00000542324 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
CS-202ENST00000542324 TNP1P09430 55 aa4.65□□□□□ -1.66
CS-202ENST00000542324 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-202ENST00000542324 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.51□□□□□ -1.69
CS-202ENST00000542324 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.51□□□□□ -1.69
CS-202ENST00000542324 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CS-202ENST00000542324 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.45□□□□□ -1.7
CS-202ENST00000542324 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
CS-202ENST00000542324 SSPOA2VEC9 5147 aa4.41□□□□□ -1.7
CS-202ENST00000542324 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-202ENST00000542324 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-202ENST00000542324 NEBP20929 6669 aa4.33□□□□□ -1.72
CS-202ENST00000542324 LCE3AQ5TA76 89 aa4.32□□□□□ -1.72
CS-202ENST00000542324 LCE2CQ5TA81 110 aa4.32□□□□□ -1.72
CS-202ENST00000542324 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.3□□□□□ -1.72
CS-202ENST00000542324 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.28□□□□□ -1.72
CS-202ENST00000542324 INE1O15225 51 aa4.27□□□□□ -1.73
CS-202ENST00000542324 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.27□□□□□ -1.73
CS-202ENST00000542324 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.24□□□□□ -1.73
CS-202ENST00000542324 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
CS-202ENST00000542324 M0R2T5 61 aa4.19□□□□□ -1.74
CS-202ENST00000542324 MT2AP02795 61 aa4.19□□□□□ -1.74
CS-202ENST00000542324 MT1HP80294 61 aa4.19□□□□□ -1.74
CS-202ENST00000542324 MT1FP04733 61 aa4.18□□□□□ -1.74
CS-202ENST00000542324 KRTAP10-10P60014 251 aa4.17□□□□□ -1.74
CS-202ENST00000542324 KRTAP12-3P60328 96 aa4.13□□□□□ -1.75
CS-202ENST00000542324 KRTAP10-5P60370 271 aa4.13□□□□□ -1.75
CS-202ENST00000542324 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.13□□□□□ -1.75
CS-202ENST00000542324 KRTAP10-12P60413 245 aa4.12□□□□□ -1.75
CS-202ENST00000542324 MT1XP80297 61 aa4.12□□□□□ -1.75
CS-202ENST00000542324 MT1BP07438 61 aa4.11□□□□□ -1.75
CS-202ENST00000542324 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.06□□□□□ -1.76
CS-202ENST00000542324 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CS-202ENST00000542324 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CS-202ENST00000542324 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.97□□□□□ -1.77
CS-202ENST00000542324 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.96□□□□□ -1.78
CS-202ENST00000542324 USH2AO75445 5202 aa3.93□□□□□ -1.78
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