RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CS-202ENST00000542324 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CS-202ENST00000542324 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-202ENST00000542324 WIZO95785 1651 aa16.27■□□□□ 0.2
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CS-202ENST00000542324 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CS-202ENST00000542324 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
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CS-202ENST00000542324 MYT1Q01538 1121 aa16.08■□□□□ 0.16
CS-202ENST00000542324 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
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CS-202ENST00000542324 CEP162Q5TB80 1403 aa16.03■□□□□ 0.16
CS-202ENST00000542324 NEUROD1Q13562 356 aa16.02■□□□□ 0.16
CS-202ENST00000542324 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
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CS-202ENST00000542324 SMARCA4P51532 1647 aa16.01■□□□□ 0.15
CS-202ENST00000542324 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16■□□□□ 0.15
CS-202ENST00000542324 ABCC8Q09428 1581 aa15.97■□□□□ 0.15
CS-202ENST00000542324 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.96■□□□□ 0.15
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CS-202ENST00000542324 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-202ENST00000542324 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CS-202ENST00000542324 SOGA1O94964 1423 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-202ENST00000542324 KIF21BO75037 1637 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-202ENST00000542324 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.83■□□□□ 0.12
CS-202ENST00000542324 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-202ENST00000542324 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.78■□□□□ 0.12
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CS-202ENST00000542324 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CS-202ENST00000542324 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.74■□□□□ 0.11
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CS-202ENST00000542324 CLIP1P30622 1438 aa15.66■□□□□ 0.1
CS-202ENST00000542324 SYNJ1O43426 1573 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-202ENST00000542324 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.65■□□□□ 0.1
CS-202ENST00000542324 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CS-202ENST00000542324 MIER1Q8N108 512 aa15.58■□□□□ 0.08
CS-202ENST00000542324 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.56■□□□□ 0.08
CS-202ENST00000542324 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.53■□□□□ 0.08
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CS-202ENST00000542324 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CS-202ENST00000542324 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CS-202ENST00000542324 TOP2BQ02880 1626 aa15.51■□□□□ 0.07
CS-202ENST00000542324 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.5■□□□□ 0.07
CS-202ENST00000542324 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.5■□□□□ 0.07
CS-202ENST00000542324 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.45■□□□□ 0.06
CS-202ENST00000542324 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CS-202ENST00000542324 CUX2O14529 1486 aa15.44■□□□□ 0.06
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CS-202ENST00000542324 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
CS-202ENST00000542324 ARAP1Q96P48 1450 aa15.4■□□□□ 0.06
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CS-202ENST00000542324 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.24■□□□□ 0.03
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CS-202ENST00000542324 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.19■□□□□ 0.02
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CS-202ENST00000542324 TIAM1Q13009 1591 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-202ENST00000542324 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.14■□□□□ 0.01
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CS-202ENST00000542324 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-202ENST00000542324 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CS-202ENST00000542324 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.1■□□□□ 0.01
CS-202ENST00000542324 CFTRP13569 1480 aa15.09■□□□□ 0.01
CS-202ENST00000542324 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.09■□□□□ 0.01
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