RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.69□□□□□ -1.02
USP20-204ENST00000472108 SPINK7P58062 85 aa8.66□□□□□ -1.02
USP20-204ENST00000472108 SEC61GP60059 68 aa8.66□□□□□ -1.02
USP20-204ENST00000472108 A0A1B0GU69 56 aa8.63□□□□□ -1.03
USP20-204ENST00000472108 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.58□□□□□ -1.04
USP20-204ENST00000472108 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.57□□□□□ -1.04
USP20-204ENST00000472108 LPAP08519 4548 aa8.56□□□□□ -1.04
USP20-204ENST00000472108 UQCR11O14957 56 aa8.55□□□□□ -1.04
USP20-204ENST00000472108 LRP2P98164 4655 aa8.52□□□□□ -1.05
USP20-204ENST00000472108 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
USP20-204ENST00000472108 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.46□□□□□ -1.06
USP20-204ENST00000472108 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.42□□□□□ -1.06
USP20-204ENST00000472108 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.42□□□□□ -1.06
USP20-204ENST00000472108 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.41□□□□□ -1.06
USP20-204ENST00000472108 HERC1Q15751 4861 aa8.38□□□□□ -1.07
USP20-204ENST00000472108 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.29□□□□□ -1.08
USP20-204ENST00000472108 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.28□□□□□ -1.08
USP20-204ENST00000472108 MUC17Q685J3 4493 aa8.26□□□□□ -1.09
USP20-204ENST00000472108 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.22□□□□□ -1.09
USP20-204ENST00000472108 A0A1B0GU33 70 aa8.16□□□□□ -1.1
USP20-204ENST00000472108 S4R3F8 94 aa8.14□□□□□ -1.11
USP20-204ENST00000472108 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.12□□□□□ -1.11
USP20-204ENST00000472108 H0YAA0 97 aa8.1□□□□□ -1.11
USP20-204ENST00000472108 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.08□□□□□ -1.12
USP20-204ENST00000472108 PRAC1Q96KF2 57 aa8.08□□□□□ -1.12
USP20-204ENST00000472108 LINC01554Q52M75 96 aa8.06□□□□□ -1.12
USP20-204ENST00000472108 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.04□□□□□ -1.12
USP20-204ENST00000472108 K7ERS5 55 aa8.03□□□□□ -1.12
USP20-204ENST00000472108 MUC2Q02817 5179 aa8.02□□□□□ -1.13
USP20-204ENST00000472108 CSAG1Q6PB30 78 aa7.98□□□□□ -1.13
USP20-204ENST00000472108 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.91□□□□□ -1.14
USP20-204ENST00000472108 LCE2CQ5TA81 110 aa7.88□□□□□ -1.15
USP20-204ENST00000472108 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.85□□□□□ -1.15
USP20-204ENST00000472108 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
USP20-204ENST00000472108 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.83□□□□□ -1.16
USP20-204ENST00000472108 RNF213Q63HN8 5207 aa7.83□□□□□ -1.16
USP20-204ENST00000472108 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
USP20-204ENST00000472108 P0C880 135 aa7.75□□□□□ -1.17
USP20-204ENST00000472108 ROMO1P60602 79 aa7.75□□□□□ -1.17
USP20-204ENST00000472108 MT1HP80294 61 aa7.71□□□□□ -1.17
USP20-204ENST00000472108 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.66□□□□□ -1.18
USP20-204ENST00000472108 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.65□□□□□ -1.18
USP20-204ENST00000472108 M0R2T5 61 aa7.64□□□□□ -1.19
USP20-204ENST00000472108 M0QZ58 72 aa7.63□□□□□ -1.19
USP20-204ENST00000472108 A0A0D9SG42 100 aa7.55□□□□□ -1.2
USP20-204ENST00000472108 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
USP20-204ENST00000472108 R4GN34 69 aa7.52□□□□□ -1.21
USP20-204ENST00000472108 KRTAP12-1P59990 96 aa7.47□□□□□ -1.21
USP20-204ENST00000472108 CRIPTQ9P021 101 aa7.46□□□□□ -1.21
USP20-204ENST00000472108 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.45□□□□□ -1.22
USP20-204ENST00000472108 KRTAP12-2P59991 146 aa7.44□□□□□ -1.22
USP20-204ENST00000472108 MT2AP02795 61 aa7.41□□□□□ -1.22
USP20-204ENST00000472108 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
USP20-204ENST00000472108 MT1FP04733 61 aa7.37□□□□□ -1.23
USP20-204ENST00000472108 KRTAP10-10P60014 251 aa7.36□□□□□ -1.23
USP20-204ENST00000472108 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.36□□□□□ -1.23
USP20-204ENST00000472108 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.3□□□□□ -1.24
USP20-204ENST00000472108 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.27□□□□□ -1.25
USP20-204ENST00000472108 H3BS24 57 aa7.21□□□□□ -1.26
USP20-204ENST00000472108 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.21□□□□□ -1.26
USP20-204ENST00000472108 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.17□□□□□ -1.26
USP20-204ENST00000472108 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.15□□□□□ -1.26
USP20-204ENST00000472108 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.09□□□□□ -1.27
USP20-204ENST00000472108 PLAC4Q8WY50 150 aa7.06□□□□□ -1.28
USP20-204ENST00000472108 PP632Q6XCG6 107 aa7.04□□□□□ -1.28
USP20-204ENST00000472108 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.04□□□□□ -1.28
USP20-204ENST00000472108 MT1BP07438 61 aa6.99□□□□□ -1.29
USP20-204ENST00000472108 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.99□□□□□ -1.29
USP20-204ENST00000472108 LCE2BO14633 110 aa6.97□□□□□ -1.29
USP20-204ENST00000472108 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.9□□□□□ -1.3
USP20-204ENST00000472108 NDUFAF8A1L188 74 aa6.85□□□□□ -1.31
USP20-204ENST00000472108 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.83□□□□□ -1.32
USP20-204ENST00000472108 MT1XP80297 61 aa6.77□□□□□ -1.33
USP20-204ENST00000472108 KRTAP10-5P60370 271 aa6.76□□□□□ -1.33
USP20-204ENST00000472108 TNP1P09430 55 aa6.73□□□□□ -1.33
USP20-204ENST00000472108 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
USP20-204ENST00000472108 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.7□□□□□ -1.34
USP20-204ENST00000472108 USH2AO75445 5202 aa6.68□□□□□ -1.34
USP20-204ENST00000472108 LUZP6Q538Z0 58 aa6.62□□□□□ -1.35
USP20-204ENST00000472108 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.58□□□□□ -1.36
USP20-204ENST00000472108 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.53□□□□□ -1.36
USP20-204ENST00000472108 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP20-204ENST00000472108 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.49□□□□□ -1.37
USP20-204ENST00000472108 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.48□□□□□ -1.37
USP20-204ENST00000472108 SSPOA2VEC9 5147 aa6.44□□□□□ -1.38
USP20-204ENST00000472108 KRTAP10-12P60413 245 aa6.43□□□□□ -1.38
USP20-204ENST00000472108 LCE3AQ5TA76 89 aa6.41□□□□□ -1.38
USP20-204ENST00000472108 A0A0A0MQY5 61 aa6.32□□□□□ -1.4
USP20-204ENST00000472108 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.3□□□□□ -1.4
USP20-204ENST00000472108 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.25□□□□□ -1.41
USP20-204ENST00000472108 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.25□□□□□ -1.41
USP20-204ENST00000472108 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
USP20-204ENST00000472108 KRTAP12-3P60328 96 aa6.16□□□□□ -1.42
USP20-204ENST00000472108 KMT2DO14686 5537 aa6.14□□□□□ -1.43
USP20-204ENST00000472108 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
USP20-204ENST00000472108 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.12□□□□□ -1.43
USP20-204ENST00000472108 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.11□□□□□ -1.43
USP20-204ENST00000472108 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.04□□□□□ -1.44
USP20-204ENST00000472108 MT1EP04732 61 aa5.93□□□□□ -1.46
USP20-204ENST00000472108 INE1O15225 51 aa5.83□□□□□ -1.48
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