RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.85□□□□□ -0.99
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LPAP08519 4548 aa8.84□□□□□ -0.99
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.83□□□□□ -1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 S4R3F8 94 aa8.81□□□□□ -1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.77□□□□□ -1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCA10Q71F78 164 aa8.76□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UQCR11O14957 56 aa8.73□□□□□ -1.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.71□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SVIPQ8NHG7 77 aa8.68□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 A8MU10 97 aa8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.64□□□□□ -1.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.63□□□□□ -1.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MUC17Q685J3 4493 aa8.62□□□□□ -1.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.6□□□□□ -1.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 A0A1B0GU33 70 aa8.59□□□□□ -1.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CSAG1Q6PB30 78 aa8.58□□□□□ -1.04
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PMAIP1Q13794 54 aa8.49□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.47□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-201ENST00000456943 H0YAA0 97 aa8.47□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HERC1Q15751 4861 aa8.46□□□□□ -1.05
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.46□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.43□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.4□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-201ENST00000456943 A6NN06 94 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 P0C880 135 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.28□□□□□ -1.08
GMDS-AS1-201ENST00000456943 K7ERS5 55 aa8.26□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 M0QZ58 72 aa8.25□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.22□□□□□ -1.09
GMDS-AS1-201ENST00000456943 A0A0D9SG42 100 aa8.19□□□□□ -1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MUC2Q02817 5179 aa8.17□□□□□ -1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 R4GN34 69 aa8.14□□□□□ -1.11
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCE2CQ5TA81 110 aa8.12□□□□□ -1.11
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RNF213Q63HN8 5207 aa8.04□□□□□ -1.12
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.01□□□□□ -1.13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UBR4Q5T4S7 5183 aa8□□□□□ -1.13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP12-1P59990 96 aa8□□□□□ -1.13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 M0R2T5 61 aa7.99□□□□□ -1.13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP12-2P59991 146 aa7.98□□□□□ -1.13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LINC01554Q52M75 96 aa7.98□□□□□ -1.13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CRIPTQ9P021 101 aa7.98□□□□□ -1.13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MT1HP80294 61 aa7.97□□□□□ -1.13
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ROMO1P60602 79 aa7.91□□□□□ -1.14
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRAC1Q96KF2 57 aa7.9□□□□□ -1.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.85□□□□□ -1.15
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MT2AP02795 61 aa7.71□□□□□ -1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.7□□□□□ -1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP10-10P60014 251 aa7.69□□□□□ -1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.69□□□□□ -1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.68□□□□□ -1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MT1FP04733 61 aa7.67□□□□□ -1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.66□□□□□ -1.18
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.62□□□□□ -1.19
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLAC4Q8WY50 150 aa7.56□□□□□ -1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.55□□□□□ -1.2
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.45□□□□□ -1.22
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.41□□□□□ -1.22
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TNP1P09430 55 aa7.33□□□□□ -1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MT1BP07438 61 aa7.31□□□□□ -1.24
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PP632Q6XCG6 107 aa7.27□□□□□ -1.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.17□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCE2BO14633 110 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MT1XP80297 61 aa7.13□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP10-5P60370 271 aa7.13□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.11□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCE3AQ5TA76 89 aa6.93□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.9□□□□□ -1.3
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP10-12P60413 245 aa6.9□□□□□ -1.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 USH2AO75445 5202 aa6.84□□□□□ -1.31
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.83□□□□□ -1.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.8□□□□□ -1.32
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.68□□□□□ -1.34
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP12-3P60328 96 aa6.66□□□□□ -1.34
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SSPOA2VEC9 5147 aa6.64□□□□□ -1.35
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.61□□□□□ -1.35
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.58□□□□□ -1.36
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.51□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.51□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.51□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.48□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LUZP6Q538Z0 58 aa6.47□□□□□ -1.37
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NDUFAF8A1L188 74 aa6.43□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KMT2DO14686 5537 aa6.39□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.38□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.36□□□□□ -1.39
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MT1EP04732 61 aa6.25□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.24□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.23□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MT1LQ93083 61 aa6.16□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
GMDS-AS1-201ENST00000456943 H3BS24 57 aa6.04□□□□□ -1.44
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms