RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438141.5

TTLL3-215, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 1,743 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-215ENST00000438141 SPINK7P58062 85 aa6.92□□□□□ -1.3
TTLL3-215ENST00000438141 J3QL48 77 aa6.9□□□□□ -1.3
TTLL3-215ENST00000438141 TPRXLQ17RH7 258 aa6.87□□□□□ -1.31
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.85□□□□□ -1.31
TTLL3-215ENST00000438141 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.85□□□□□ -1.31
TTLL3-215ENST00000438141 A0A1B0GU69 56 aa6.84□□□□□ -1.31
TTLL3-215ENST00000438141 LRP2P98164 4655 aa6.83□□□□□ -1.32
TTLL3-215ENST00000438141 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.82□□□□□ -1.32
TTLL3-215ENST00000438141 LPAP08519 4548 aa6.8□□□□□ -1.32
TTLL3-215ENST00000438141 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.79□□□□□ -1.32
TTLL3-215ENST00000438141 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.78□□□□□ -1.32
TTLL3-215ENST00000438141 UQCR11O14957 56 aa6.76□□□□□ -1.33
TTLL3-215ENST00000438141 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.72□□□□□ -1.33
TTLL3-215ENST00000438141 MUC17Q685J3 4493 aa6.6□□□□□ -1.35
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.59□□□□□ -1.35
TTLL3-215ENST00000438141 HERC1Q15751 4861 aa6.58□□□□□ -1.36
TTLL3-215ENST00000438141 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TTLL3-215ENST00000438141 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.55□□□□□ -1.36
TTLL3-215ENST00000438141 PRAC1Q96KF2 57 aa6.55□□□□□ -1.36
TTLL3-215ENST00000438141 S4R3F8 94 aa6.54□□□□□ -1.36
TTLL3-215ENST00000438141 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.52□□□□□ -1.37
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.51□□□□□ -1.37
TTLL3-215ENST00000438141 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.5□□□□□ -1.37
TTLL3-215ENST00000438141 LINC01554Q52M75 96 aa6.5□□□□□ -1.37
TTLL3-215ENST00000438141 A0A1B0GU33 70 aa6.42□□□□□ -1.38
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TTLL3-215ENST00000438141 H0YAA0 97 aa6.41□□□□□ -1.38
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.41□□□□□ -1.38
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.41□□□□□ -1.38
TTLL3-215ENST00000438141 CSAG1Q6PB30 78 aa6.4□□□□□ -1.38
TTLL3-215ENST00000438141 K7ERS5 55 aa6.35□□□□□ -1.39
TTLL3-215ENST00000438141 MUC2Q02817 5179 aa6.34□□□□□ -1.4
TTLL3-215ENST00000438141 P0C880 135 aa6.31□□□□□ -1.4
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.28□□□□□ -1.4
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.28□□□□□ -1.4
TTLL3-215ENST00000438141 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
TTLL3-215ENST00000438141 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.24□□□□□ -1.41
TTLL3-215ENST00000438141 RNF213Q63HN8 5207 aa6.16□□□□□ -1.42
TTLL3-215ENST00000438141 ROMO1P60602 79 aa6.15□□□□□ -1.42
TTLL3-215ENST00000438141 LCE2CQ5TA81 110 aa6.15□□□□□ -1.42
TTLL3-215ENST00000438141 M0QZ58 72 aa6.13□□□□□ -1.43
TTLL3-215ENST00000438141 A0A0D9SG42 100 aa6.11□□□□□ -1.43
TTLL3-215ENST00000438141 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.11□□□□□ -1.43
TTLL3-215ENST00000438141 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP12-1P59990 96 aa6.02□□□□□ -1.45
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP12-2P59991 146 aa6.02□□□□□ -1.45
TTLL3-215ENST00000438141 R4GN34 69 aa6.02□□□□□ -1.45
TTLL3-215ENST00000438141 H3BS24 57 aa5.99□□□□□ -1.45
TTLL3-215ENST00000438141 MT1HP80294 61 aa5.99□□□□□ -1.45
TTLL3-215ENST00000438141 CRIPTQ9P021 101 aa5.98□□□□□ -1.45
TTLL3-215ENST00000438141 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.94□□□□□ -1.46
TTLL3-215ENST00000438141 M0R2T5 61 aa5.87□□□□□ -1.47
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.81□□□□□ -1.48
TTLL3-215ENST00000438141 MT2AP02795 61 aa5.8□□□□□ -1.48
TTLL3-215ENST00000438141 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.79□□□□□ -1.48
TTLL3-215ENST00000438141 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.79□□□□□ -1.48
TTLL3-215ENST00000438141 MT1FP04733 61 aa5.78□□□□□ -1.48
TTLL3-215ENST00000438141 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.77□□□□□ -1.49
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.73□□□□□ -1.49
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP10-10P60014 251 aa5.71□□□□□ -1.49
TTLL3-215ENST00000438141 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.65□□□□□ -1.5
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.61□□□□□ -1.51
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.59□□□□□ -1.51
TTLL3-215ENST00000438141 NDUFAF8A1L188 74 aa5.58□□□□□ -1.52
TTLL3-215ENST00000438141 PLAC4Q8WY50 150 aa5.56□□□□□ -1.52
TTLL3-215ENST00000438141 MT1BP07438 61 aa5.53□□□□□ -1.52
TTLL3-215ENST00000438141 PP632Q6XCG6 107 aa5.5□□□□□ -1.53
TTLL3-215ENST00000438141 TNP1P09430 55 aa5.43□□□□□ -1.54
TTLL3-215ENST00000438141 LCE2BO14633 110 aa5.4□□□□□ -1.54
TTLL3-215ENST00000438141 MT1XP80297 61 aa5.39□□□□□ -1.55
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP10-5P60370 271 aa5.38□□□□□ -1.55
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.35□□□□□ -1.55
TTLL3-215ENST00000438141 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
TTLL3-215ENST00000438141 LUZP6Q538Z0 58 aa5.28□□□□□ -1.56
TTLL3-215ENST00000438141 USH2AO75445 5202 aa5.27□□□□□ -1.57
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.25□□□□□ -1.57
TTLL3-215ENST00000438141 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.22□□□□□ -1.57
TTLL3-215ENST00000438141 LCE3AQ5TA76 89 aa5.2□□□□□ -1.58
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
TTLL3-215ENST00000438141 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.17□□□□□ -1.58
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP10-12P60413 245 aa5.14□□□□□ -1.59
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.12□□□□□ -1.59
TTLL3-215ENST00000438141 A0A0A0MQY5 61 aa5.11□□□□□ -1.59
TTLL3-215ENST00000438141 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.09□□□□□ -1.59
TTLL3-215ENST00000438141 SSPOA2VEC9 5147 aa5.08□□□□□ -1.6
TTLL3-215ENST00000438141 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.03□□□□□ -1.6
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.01□□□□□ -1.61
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP12-3P60328 96 aa4.97□□□□□ -1.61
TTLL3-215ENST00000438141 KMT2DO14686 5537 aa4.95□□□□□ -1.62
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.93□□□□□ -1.62
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.93□□□□□ -1.62
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.92□□□□□ -1.62
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.89□□□□□ -1.63
TTLL3-215ENST00000438141 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.82□□□□□ -1.64
TTLL3-215ENST00000438141 MT1EP04732 61 aa4.7□□□□□ -1.66
TTLL3-215ENST00000438141 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TTLL3-215ENST00000438141 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.66□□□□□ -1.66
TTLL3-215ENST00000438141 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms