RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LUZP6	Q538Z0	58 aa		5.61	□□□□□ -1.51
AFG3L1P-208	ENST00000427658	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		5.58	□□□□□ -1.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A0D9SG42	100 aa		5.57	□□□□□ -1.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		5.55	□□□□□ -1.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		5.54	□□□□□ -1.52
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		5.52	□□□□□ -1.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAT1	Q14517	4588 aa		5.51	□□□□□ -1.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		5.49	□□□□□ -1.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RYR1	P21817	5038 aa		5.48	□□□□□ -1.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSPG2	P98160	4391 aa		5.46	□□□□□ -1.53
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
AFG3L1P-208	ENST00000427658		S4R3F8	94 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HERC2	O95714	4834 aa		5.41	□□□□□ -1.54
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		5.4	□□□□□ -1.54
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP12-2	P59991	146 aa		5.4	□□□□□ -1.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C9orf92	A6NGG3	77 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	XP32	Q5T750	250 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		5.35	□□□□□ -1.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q5VSD8	79 aa		5.34	□□□□□ -1.55
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		5.33	□□□□□ -1.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYCBP2	O75592	4640 aa		5.33	□□□□□ -1.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP12-1	P59990	96 aa		5.3	□□□□□ -1.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLAC4	Q8WY50	150 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNXB	P22105	4242 aa		5.25	□□□□□ -1.57
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP10-8	P60410	259 aa		5.21	□□□□□ -1.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		5.21	□□□□□ -1.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MT1HL1	P0DM35	61 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		5.1	□□□□□ -1.59
AFG3L1P-208	ENST00000427658		M0QZ58	72 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LPA	P08519	4548 aa		5.01	□□□□□ -1.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HERC1	Q15751	4861 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658		J3QL48	77 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRP2	P98164	4655 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MUC2	Q02817	5179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658		R4GN34	69 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.73	□□□□□ -1.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	INE1	O15225	51 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNP1	P09430	55 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.45	□□□□□ -1.7
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MT1H	P80294	61 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.27	□□□□□ -1.73
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
AFG3L1P-208	ENST00000427658		M0R2T5	61 aa		4.2	□□□□□ -1.74
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.18	□□□□□ -1.74
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.18	□□□□□ -1.74
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MT2A	P02795	61 aa		4.15	□□□□□ -1.74
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USH2A	O75445	5202 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MT1F	P04733	61 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		3.93	□□□□□ -1.78
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCE2B	O14633	110 aa		3.92	□□□□□ -1.78
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MT1B	P07438	61 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KMT2D	O14686	5537 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MT1X	P80297	61 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SSPO	A2VEC9	5147 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms