RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP10-10P60014 251 aa6.6□□□□□ -1.35
CTIF-202ENST00000382998 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.57□□□□□ -1.36
CTIF-202ENST00000382998 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.56□□□□□ -1.36
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.55□□□□□ -1.36
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTIF-202ENST00000382998 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.49□□□□□ -1.37
CTIF-202ENST00000382998 LYSTQ99698 3801 aa6.48□□□□□ -1.37
CTIF-202ENST00000382998 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.48□□□□□ -1.37
CTIF-202ENST00000382998 KMT2AQ03164 3969 aa6.44□□□□□ -1.38
CTIF-202ENST00000382998 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.41□□□□□ -1.38
CTIF-202ENST00000382998 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.4□□□□□ -1.39
CTIF-202ENST00000382998 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.4□□□□□ -1.39
CTIF-202ENST00000382998 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.38□□□□□ -1.39
CTIF-202ENST00000382998 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.37□□□□□ -1.39
CTIF-202ENST00000382998 RYR1P21817 5038 aa6.37□□□□□ -1.39
CTIF-202ENST00000382998 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.36□□□□□ -1.39
CTIF-202ENST00000382998 FAT1Q14517 4588 aa6.35□□□□□ -1.39
CTIF-202ENST00000382998 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.35□□□□□ -1.39
CTIF-202ENST00000382998 DNAH2Q9P225 4427 aa6.34□□□□□ -1.39
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.34□□□□□ -1.39
CTIF-202ENST00000382998 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CTIF-202ENST00000382998 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.3□□□□□ -1.4
CTIF-202ENST00000382998 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.27□□□□□ -1.41
CTIF-202ENST00000382998 RYR3Q15413 4870 aa6.24□□□□□ -1.41
CTIF-202ENST00000382998 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CTIF-202ENST00000382998 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.2□□□□□ -1.42
CTIF-202ENST00000382998 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.17□□□□□ -1.42
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.15□□□□□ -1.42
CTIF-202ENST00000382998 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.14□□□□□ -1.43
CTIF-202ENST00000382998 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.14□□□□□ -1.43
CTIF-202ENST00000382998 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.14□□□□□ -1.43
CTIF-202ENST00000382998 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CTIF-202ENST00000382998 MYCBP2O75592 4640 aa6.09□□□□□ -1.43
CTIF-202ENST00000382998 RYR2Q92736 4967 aa6.08□□□□□ -1.44
CTIF-202ENST00000382998 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.04□□□□□ -1.44
CTIF-202ENST00000382998 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.02□□□□□ -1.45
CTIF-202ENST00000382998 HERC2O95714 4834 aa6.01□□□□□ -1.45
CTIF-202ENST00000382998 PKHD1P08F94 4074 aa5.99□□□□□ -1.45
CTIF-202ENST00000382998 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.98□□□□□ -1.45
CTIF-202ENST00000382998 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CTIF-202ENST00000382998 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.91□□□□□ -1.46
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.87□□□□□ -1.47
CTIF-202ENST00000382998 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CTIF-202ENST00000382998 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
CTIF-202ENST00000382998 HSPG2P98160 4391 aa5.75□□□□□ -1.49
CTIF-202ENST00000382998 PKD1P98161 4303 aa5.75□□□□□ -1.49
CTIF-202ENST00000382998 MT1HP80294 61 aa5.7□□□□□ -1.5
CTIF-202ENST00000382998 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.69□□□□□ -1.5
CTIF-202ENST00000382998 LRP2P98164 4655 aa5.67□□□□□ -1.5
CTIF-202ENST00000382998 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.63□□□□□ -1.51
CTIF-202ENST00000382998 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.61□□□□□ -1.51
CTIF-202ENST00000382998 LCE3AQ5TA76 89 aa5.56□□□□□ -1.52
CTIF-202ENST00000382998 MT2AP02795 61 aa5.54□□□□□ -1.52
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP12-3P60328 96 aa5.53□□□□□ -1.52
CTIF-202ENST00000382998 HERC1Q15751 4861 aa5.51□□□□□ -1.53
CTIF-202ENST00000382998 LPAP08519 4548 aa5.47□□□□□ -1.53
CTIF-202ENST00000382998 MT1FP04733 61 aa5.45□□□□□ -1.54
CTIF-202ENST00000382998 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.44□□□□□ -1.54
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP10-12P60413 245 aa5.43□□□□□ -1.54
CTIF-202ENST00000382998 TNXBP22105 4242 aa5.41□□□□□ -1.54
CTIF-202ENST00000382998 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.37□□□□□ -1.55
CTIF-202ENST00000382998 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.34□□□□□ -1.55
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP10-5P60370 271 aa5.33□□□□□ -1.56
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.33□□□□□ -1.56
CTIF-202ENST00000382998 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.31□□□□□ -1.56
CTIF-202ENST00000382998 RNF213Q63HN8 5207 aa5.25□□□□□ -1.57
CTIF-202ENST00000382998 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.24□□□□□ -1.57
CTIF-202ENST00000382998 LCE2CQ5TA81 110 aa5.21□□□□□ -1.58
CTIF-202ENST00000382998 MUC2Q02817 5179 aa5.15□□□□□ -1.58
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.14□□□□□ -1.59
CTIF-202ENST00000382998 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.13□□□□□ -1.59
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.12□□□□□ -1.59
CTIF-202ENST00000382998 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.09□□□□□ -1.59
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP12-4P60329 112 aa5.08□□□□□ -1.6
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.08□□□□□ -1.6
CTIF-202ENST00000382998 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.07□□□□□ -1.6
CTIF-202ENST00000382998 MUC17Q685J3 4493 aa5.04□□□□□ -1.6
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.01□□□□□ -1.61
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.99□□□□□ -1.61
CTIF-202ENST00000382998 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.98□□□□□ -1.61
CTIF-202ENST00000382998 MT1BP07438 61 aa4.94□□□□□ -1.62
CTIF-202ENST00000382998 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.91□□□□□ -1.62
CTIF-202ENST00000382998 LCE2BO14633 110 aa4.9□□□□□ -1.62
CTIF-202ENST00000382998 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CTIF-202ENST00000382998 MT1XP80297 61 aa4.86□□□□□ -1.63
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.85□□□□□ -1.63
CTIF-202ENST00000382998 SPRR2EP22531 72 aa4.84□□□□□ -1.63
CTIF-202ENST00000382998 SPRR2BP35325 72 aa4.84□□□□□ -1.63
CTIF-202ENST00000382998 SPRR2AP35326 72 aa4.84□□□□□ -1.63
CTIF-202ENST00000382998 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.79□□□□□ -1.64
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.79□□□□□ -1.64
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.76□□□□□ -1.65
CTIF-202ENST00000382998 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CTIF-202ENST00000382998 SPRR2DP22532 72 aa4.66□□□□□ -1.66
CTIF-202ENST00000382998 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.61□□□□□ -1.67
CTIF-202ENST00000382998 MT3P25713 68 aa4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms