RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP10-12P60413 245 aa4.57□□□□□ -1.68
ZNF548-202ENST00000366197 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF548-202ENST00000366197 RYR1P21817 5038 aa4.51□□□□□ -1.69
ZNF548-202ENST00000366197 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
ZNF548-202ENST00000366197 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.45□□□□□ -1.7
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP12-3P60328 96 aa4.45□□□□□ -1.7
ZNF548-202ENST00000366197 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.45□□□□□ -1.7
ZNF548-202ENST00000366197 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
ZNF548-202ENST00000366197 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.43□□□□□ -1.7
ZNF548-202ENST00000366197 FAT1Q14517 4588 aa4.4□□□□□ -1.7
ZNF548-202ENST00000366197 DNAH10Q8IVF4 4471 aa4.39□□□□□ -1.71
ZNF548-202ENST00000366197 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.37□□□□□ -1.71
ZNF548-202ENST00000366197 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.37□□□□□ -1.71
ZNF548-202ENST00000366197 RYR3Q15413 4870 aa4.37□□□□□ -1.71
ZNF548-202ENST00000366197 STARD9Q9P2P6 4700 aa4.37□□□□□ -1.71
ZNF548-202ENST00000366197 VPS13DQ5THJ4 4388 aa4.35□□□□□ -1.71
ZNF548-202ENST00000366197 LCE3AQ5TA76 89 aa4.35□□□□□ -1.71
ZNF548-202ENST00000366197 ANK2Q01484 3957 aa4.32□□□□□ -1.72
ZNF548-202ENST00000366197 INE1O15225 51 aa4.31□□□□□ -1.72
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.29□□□□□ -1.72
ZNF548-202ENST00000366197 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.28□□□□□ -1.72
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.28□□□□□ -1.72
ZNF548-202ENST00000366197 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.26□□□□□ -1.73
ZNF548-202ENST00000366197 MT1HP80294 61 aa4.25□□□□□ -1.73
ZNF548-202ENST00000366197 HERC2O95714 4834 aa4.23□□□□□ -1.73
ZNF548-202ENST00000366197 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.23□□□□□ -1.73
ZNF548-202ENST00000366197 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.23□□□□□ -1.73
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.22□□□□□ -1.73
ZNF548-202ENST00000366197 RYR2Q92736 4967 aa4.18□□□□□ -1.74
ZNF548-202ENST00000366197 MT2AP02795 61 aa4.18□□□□□ -1.74
ZNF548-202ENST00000366197 HYDINQ4G0P3 5121 aa4.17□□□□□ -1.74
ZNF548-202ENST00000366197 DNAH2Q9P225 4427 aa4.17□□□□□ -1.74
ZNF548-202ENST00000366197 LYSTQ99698 3801 aa4.15□□□□□ -1.74
ZNF548-202ENST00000366197 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
ZNF548-202ENST00000366197 KMT2AQ03164 3969 aa4.14□□□□□ -1.75
ZNF548-202ENST00000366197 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.13□□□□□ -1.75
ZNF548-202ENST00000366197 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.13□□□□□ -1.75
ZNF548-202ENST00000366197 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.12□□□□□ -1.75
ZNF548-202ENST00000366197 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP10-5P60370 271 aa4.11□□□□□ -1.75
ZNF548-202ENST00000366197 MT1FP04733 61 aa4.08□□□□□ -1.76
ZNF548-202ENST00000366197 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.08□□□□□ -1.76
ZNF548-202ENST00000366197 DNAH3Q8TD57 4116 aa4.07□□□□□ -1.76
ZNF548-202ENST00000366197 MYCBP2O75592 4640 aa4.07□□□□□ -1.76
ZNF548-202ENST00000366197 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.04□□□□□ -1.76
ZNF548-202ENST00000366197 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
ZNF548-202ENST00000366197 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.02□□□□□ -1.77
ZNF548-202ENST00000366197 SPRR2FQ96RM1 72 aa4□□□□□ -1.77
ZNF548-202ENST00000366197 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.99□□□□□ -1.77
ZNF548-202ENST00000366197 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ZNF548-202ENST00000366197 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.98□□□□□ -1.77
ZNF548-202ENST00000366197 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.96□□□□□ -1.78
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ZNF548-202ENST00000366197 HERC1Q15751 4861 aa3.95□□□□□ -1.78
ZNF548-202ENST00000366197 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.94□□□□□ -1.78
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.93□□□□□ -1.78
ZNF548-202ENST00000366197 LRP2P98164 4655 aa3.91□□□□□ -1.78
ZNF548-202ENST00000366197 HSPG2P98160 4391 aa3.9□□□□□ -1.78
ZNF548-202ENST00000366197 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.87□□□□□ -1.79
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.86□□□□□ -1.79
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.85□□□□□ -1.79
ZNF548-202ENST00000366197 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.85□□□□□ -1.79
ZNF548-202ENST00000366197 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.83□□□□□ -1.8
ZNF548-202ENST00000366197 PKHD1P08F94 4074 aa3.82□□□□□ -1.8
ZNF548-202ENST00000366197 PKD1P98161 4303 aa3.8□□□□□ -1.8
ZNF548-202ENST00000366197 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.78□□□□□ -1.8
ZNF548-202ENST00000366197 LCE2CQ5TA81 110 aa3.77□□□□□ -1.81
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.77□□□□□ -1.81
ZNF548-202ENST00000366197 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.74□□□□□ -1.81
ZNF548-202ENST00000366197 SPRR2EP22531 72 aa3.74□□□□□ -1.81
ZNF548-202ENST00000366197 SPRR2BP35325 72 aa3.74□□□□□ -1.81
ZNF548-202ENST00000366197 SPRR2AP35326 72 aa3.74□□□□□ -1.81
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.74□□□□□ -1.81
ZNF548-202ENST00000366197 MT1XP80297 61 aa3.72□□□□□ -1.81
ZNF548-202ENST00000366197 MT1BP07438 61 aa3.71□□□□□ -1.82
ZNF548-202ENST00000366197 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.7□□□□□ -1.82
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.68□□□□□ -1.82
ZNF548-202ENST00000366197 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
ZNF548-202ENST00000366197 LPAP08519 4548 aa3.65□□□□□ -1.83
ZNF548-202ENST00000366197 RNF213Q63HN8 5207 aa3.64□□□□□ -1.83
ZNF548-202ENST00000366197 SPRR2DP22532 72 aa3.62□□□□□ -1.83
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.61□□□□□ -1.83
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.61□□□□□ -1.83
ZNF548-202ENST00000366197 MT1GP13640 62 aa3.61□□□□□ -1.83
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.6□□□□□ -1.83
ZNF548-202ENST00000366197 LCE2BO14633 110 aa3.6□□□□□ -1.83
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.58□□□□□ -1.84
ZNF548-202ENST00000366197 LCE3BQ5TA77 95 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP12-4P60329 112 aa3.57□□□□□ -1.84
ZNF548-202ENST00000366197 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.56□□□□□ -1.84
ZNF548-202ENST00000366197 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ZNF548-202ENST00000366197 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
ZNF548-202ENST00000366197 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.49□□□□□ -1.85
ZNF548-202ENST00000366197 TNXBP22105 4242 aa3.47□□□□□ -1.85
ZNF548-202ENST00000366197 MUC17Q685J3 4493 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.45□□□□□ -1.86
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.8 ms