RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.1□□□□□ -1.59
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.03□□□□□ -1.6
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.94□□□□□ -1.62
UBASH3B-201ENST00000284273 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.93□□□□□ -1.62
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.88□□□□□ -1.63
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.87□□□□□ -1.63
UBASH3B-201ENST00000284273 MT1HP80294 61 aa4.86□□□□□ -1.63
UBASH3B-201ENST00000284273 INE1O15225 51 aa4.85□□□□□ -1.63
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAH2Q9P225 4427 aa4.8□□□□□ -1.64
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAH10Q8IVF4 4471 aa4.8□□□□□ -1.64
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
UBASH3B-201ENST00000284273 FRAS1Q86XX4 4008 aa4.76□□□□□ -1.65
UBASH3B-201ENST00000284273 ANK2Q01484 3957 aa4.75□□□□□ -1.65
UBASH3B-201ENST00000284273 KMT2AQ03164 3969 aa4.74□□□□□ -1.65
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.73□□□□□ -1.65
UBASH3B-201ENST00000284273 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.72□□□□□ -1.65
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.71□□□□□ -1.66
UBASH3B-201ENST00000284273 SPRR2EP22531 72 aa4.7□□□□□ -1.66
UBASH3B-201ENST00000284273 SPRR2BP35325 72 aa4.7□□□□□ -1.66
UBASH3B-201ENST00000284273 SPRR2AP35326 72 aa4.7□□□□□ -1.66
UBASH3B-201ENST00000284273 MT2AP02795 61 aa4.69□□□□□ -1.66
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAH3Q8TD57 4116 aa4.68□□□□□ -1.66
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.67□□□□□ -1.66
UBASH3B-201ENST00000284273 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.66□□□□□ -1.66
UBASH3B-201ENST00000284273 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
UBASH3B-201ENST00000284273 MT1FP04733 61 aa4.64□□□□□ -1.67
UBASH3B-201ENST00000284273 LYSTQ99698 3801 aa4.61□□□□□ -1.67
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.6□□□□□ -1.67
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.56□□□□□ -1.68
UBASH3B-201ENST00000284273 STARD9Q9P2P6 4700 aa4.55□□□□□ -1.68
UBASH3B-201ENST00000284273 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.55□□□□□ -1.68
UBASH3B-201ENST00000284273 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.54□□□□□ -1.68
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.54□□□□□ -1.68
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.52□□□□□ -1.69
UBASH3B-201ENST00000284273 SPRR2DP22532 72 aa4.52□□□□□ -1.69
UBASH3B-201ENST00000284273 LCE3BQ5TA77 95 aa4.52□□□□□ -1.69
UBASH3B-201ENST00000284273 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
UBASH3B-201ENST00000284273 FAT1Q14517 4588 aa4.47□□□□□ -1.69
UBASH3B-201ENST00000284273 VPS13DQ5THJ4 4388 aa4.46□□□□□ -1.7
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.45□□□□□ -1.7
UBASH3B-201ENST00000284273 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
UBASH3B-201ENST00000284273 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.43□□□□□ -1.7
UBASH3B-201ENST00000284273 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.43□□□□□ -1.7
UBASH3B-201ENST00000284273 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.42□□□□□ -1.7
UBASH3B-201ENST00000284273 MT1GP13640 62 aa4.4□□□□□ -1.71
UBASH3B-201ENST00000284273 LCE2BO14633 110 aa4.39□□□□□ -1.71
UBASH3B-201ENST00000284273 DNHD1Q96M86 4753 aa4.38□□□□□ -1.71
UBASH3B-201ENST00000284273 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.34□□□□□ -1.71
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.29□□□□□ -1.72
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.29□□□□□ -1.72
UBASH3B-201ENST00000284273 RYR1P21817 5038 aa4.29□□□□□ -1.72
UBASH3B-201ENST00000284273 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
UBASH3B-201ENST00000284273 LPAP08519 4548 aa4.26□□□□□ -1.73
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.25□□□□□ -1.73
UBASH3B-201ENST00000284273 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.22□□□□□ -1.73
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP12-4P60329 112 aa4.22□□□□□ -1.73
UBASH3B-201ENST00000284273 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.2□□□□□ -1.74
UBASH3B-201ENST00000284273 MT4P47944 62 aa4.2□□□□□ -1.74
UBASH3B-201ENST00000284273 LCE2CQ5TA81 110 aa4.17□□□□□ -1.74
UBASH3B-201ENST00000284273 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.17□□□□□ -1.74
UBASH3B-201ENST00000284273 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
UBASH3B-201ENST00000284273 MT1XP80297 61 aa4.13□□□□□ -1.75
UBASH3B-201ENST00000284273 HSPG2P98160 4391 aa4.12□□□□□ -1.75
UBASH3B-201ENST00000284273 MYCBP2O75592 4640 aa4.11□□□□□ -1.75
UBASH3B-201ENST00000284273 PKHD1P08F94 4074 aa4.1□□□□□ -1.75
UBASH3B-201ENST00000284273 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
UBASH3B-201ENST00000284273 PKD1P98161 4303 aa4.07□□□□□ -1.76
UBASH3B-201ENST00000284273 RYR3Q15413 4870 aa4.06□□□□□ -1.76
UBASH3B-201ENST00000284273 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.06□□□□□ -1.76
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.06□□□□□ -1.76
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.04□□□□□ -1.76
UBASH3B-201ENST00000284273 MT1BP07438 61 aa4.03□□□□□ -1.76
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.99□□□□□ -1.77
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.99□□□□□ -1.77
UBASH3B-201ENST00000284273 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.97□□□□□ -1.77
UBASH3B-201ENST00000284273 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.95□□□□□ -1.78
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.95□□□□□ -1.78
UBASH3B-201ENST00000284273 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.9□□□□□ -1.78
UBASH3B-201ENST00000284273 LCE1DQ5T752 114 aa3.89□□□□□ -1.79
UBASH3B-201ENST00000284273 TNXBP22105 4242 aa3.88□□□□□ -1.79
UBASH3B-201ENST00000284273 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.87□□□□□ -1.79
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.86□□□□□ -1.79
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.86□□□□□ -1.79
UBASH3B-201ENST00000284273 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.82□□□□□ -1.8
UBASH3B-201ENST00000284273 LRP2P98164 4655 aa3.79□□□□□ -1.8
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.78□□□□□ -1.8
UBASH3B-201ENST00000284273 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
UBASH3B-201ENST00000284273 MT1LQ93083 61 aa3.74□□□□□ -1.81
UBASH3B-201ENST00000284273 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.72□□□□□ -1.81
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.72□□□□□ -1.81
UBASH3B-201ENST00000284273 MT1EP04732 61 aa3.72□□□□□ -1.81
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.71□□□□□ -1.82
UBASH3B-201ENST00000284273 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
UBASH3B-201ENST00000284273 PRM1P04553 51 aa3.69□□□□□ -1.82
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.68□□□□□ -1.82
UBASH3B-201ENST00000284273 MT1MQ8N339 61 aa3.66□□□□□ -1.82
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.65□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.9 ms