RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 KMT2AQ03164 3969 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP12-1P59990 96 aa8.44□□□□□ -1.06
TRPC1-201ENST00000273482 PP632Q6XCG6 107 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPC1-201ENST00000273482 TNP1P09430 55 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPC1-201ENST00000273482 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPC1-201ENST00000273482 LYSTQ99698 3801 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPC1-201ENST00000273482 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPC1-201ENST00000273482 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.34□□□□□ -1.07
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TRPC1-201ENST00000273482 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.33□□□□□ -1.08
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TRPC1-201ENST00000273482 INE1O15225 51 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPC1-201ENST00000273482 LCE3AQ5TA76 89 aa7.17□□□□□ -1.26
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TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.67□□□□□ -1.34
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TRPC1-201ENST00000273482 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.61□□□□□ -1.35
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TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPC1-201ENST00000273482 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPC1-201ENST00000273482 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
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TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.83□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 SPRR2EP22531 72 aa5.78□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 SPRR2BP35325 72 aa5.78□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 SPRR2AP35326 72 aa5.78□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.78□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.77□□□□□ -1.49
TRPC1-201ENST00000273482 MT1GP13640 62 aa5.77□□□□□ -1.49
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP12-4P60329 112 aa5.76□□□□□ -1.49
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