RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 KMT2AQ03164 3969 aa8.46□□□□□ -1.05
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP12-1P59990 96 aa8.44□□□□□ -1.06
TRPC1-201ENST00000273482 PP632Q6XCG6 107 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPC1-201ENST00000273482 TNP1P09430 55 aa8.38□□□□□ -1.07
TRPC1-201ENST00000273482 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TRPC1-201ENST00000273482 LYSTQ99698 3801 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPC1-201ENST00000273482 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.36□□□□□ -1.07
TRPC1-201ENST00000273482 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.34□□□□□ -1.07
TRPC1-201ENST00000273482 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPC1-201ENST00000273482 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPC1-201ENST00000273482 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPC1-201ENST00000273482 DNAH2Q9P225 4427 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPC1-201ENST00000273482 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.27□□□□□ -1.09
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.26□□□□□ -1.09
TRPC1-201ENST00000273482 RYR1P21817 5038 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPC1-201ENST00000273482 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP10-10P60014 251 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.18□□□□□ -1.1
TRPC1-201ENST00000273482 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.16□□□□□ -1.1
TRPC1-201ENST00000273482 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
TRPC1-201ENST00000273482 RYR3Q15413 4870 aa8.1□□□□□ -1.11
TRPC1-201ENST00000273482 MYCBP2O75592 4640 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPC1-201ENST00000273482 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.06□□□□□ -1.12
TRPC1-201ENST00000273482 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.04□□□□□ -1.12
TRPC1-201ENST00000273482 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPC1-201ENST00000273482 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.03□□□□□ -1.12
TRPC1-201ENST00000273482 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.01□□□□□ -1.13
TRPC1-201ENST00000273482 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
TRPC1-201ENST00000273482 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
TRPC1-201ENST00000273482 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPC1-201ENST00000273482 PKHD1P08F94 4074 aa7.91□□□□□ -1.14
TRPC1-201ENST00000273482 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.91□□□□□ -1.14
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPC1-201ENST00000273482 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.9□□□□□ -1.14
TRPC1-201ENST00000273482 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TRPC1-201ENST00000273482 RYR2Q92736 4967 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.7□□□□□ -1.18
TRPC1-201ENST00000273482 HERC2O95714 4834 aa7.67□□□□□ -1.18
TRPC1-201ENST00000273482 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
TRPC1-201ENST00000273482 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.59□□□□□ -1.19
TRPC1-201ENST00000273482 LRP2P98164 4655 aa7.57□□□□□ -1.2
TRPC1-201ENST00000273482 PKD1P98161 4303 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPC1-201ENST00000273482 HSPG2P98160 4391 aa7.53□□□□□ -1.2
TRPC1-201ENST00000273482 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TRPC1-201ENST00000273482 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPC1-201ENST00000273482 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPC1-201ENST00000273482 MT1HP80294 61 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPC1-201ENST00000273482 LPAP08519 4548 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPC1-201ENST00000273482 INE1O15225 51 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPC1-201ENST00000273482 LCE3AQ5TA76 89 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPC1-201ENST00000273482 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPC1-201ENST00000273482 MT2AP02795 61 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP10-12P60413 245 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP12-3P60328 96 aa7.06□□□□□ -1.28
TRPC1-201ENST00000273482 HERC1Q15751 4861 aa7.05□□□□□ -1.28
TRPC1-201ENST00000273482 MT1FP04733 61 aa7.05□□□□□ -1.28
TRPC1-201ENST00000273482 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.04□□□□□ -1.28
TRPC1-201ENST00000273482 TNXBP22105 4242 aa7.02□□□□□ -1.29
TRPC1-201ENST00000273482 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.93□□□□□ -1.3
TRPC1-201ENST00000273482 RNF213Q63HN8 5207 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPC1-201ENST00000273482 LCE2CQ5TA81 110 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPC1-201ENST00000273482 MUC2Q02817 5179 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPC1-201ENST00000273482 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.73□□□□□ -1.33
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPC1-201ENST00000273482 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPC1-201ENST00000273482 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.65□□□□□ -1.34
TRPC1-201ENST00000273482 MUC17Q685J3 4493 aa6.65□□□□□ -1.35
TRPC1-201ENST00000273482 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.65□□□□□ -1.35
TRPC1-201ENST00000273482 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPC1-201ENST00000273482 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.58□□□□□ -1.36
TRPC1-201ENST00000273482 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.55□□□□□ -1.36
TRPC1-201ENST00000273482 MT1BP07438 61 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.46□□□□□ -1.37
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TRPC1-201ENST00000273482 MT1XP80297 61 aa6.44□□□□□ -1.38
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP10-5P60370 271 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.38□□□□□ -1.39
TRPC1-201ENST00000273482 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.35□□□□□ -1.39
TRPC1-201ENST00000273482 LCE2BO14633 110 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPC1-201ENST00000273482 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPC1-201ENST00000273482 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
TRPC1-201ENST00000273482 USH2AO75445 5202 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.92□□□□□ -1.46
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.83□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 SPRR2EP22531 72 aa5.78□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 SPRR2BP35325 72 aa5.78□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 SPRR2AP35326 72 aa5.78□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.78□□□□□ -1.48
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.77□□□□□ -1.49
TRPC1-201ENST00000273482 MT1GP13640 62 aa5.77□□□□□ -1.49
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP12-4P60329 112 aa5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.9 ms