RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HYDINQ4G0P3 5121 aa12.95□□□□□ -0.34
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 H3BPC8 53 aa12.95□□□□□ -0.34
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa12.91□□□□□ -0.34
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRR15LQ9BU68 103 aa12.91□□□□□ -0.34
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ALMS1Q8TCU4 4167 aa12.91□□□□□ -0.34
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LIMD2Q9BT23 127 aa12.89□□□□□ -0.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa12.89□□□□□ -0.35
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa12.68□□□□□ -0.38
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa12.65□□□□□ -0.38
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPAG11AQ6PDA7 123 aa12.65□□□□□ -0.38
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa12.6□□□□□ -0.39
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa12.59□□□□□ -0.39
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A6NN06 94 aa12.56□□□□□ -0.4
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PKHD1P08F94 4074 aa12.55□□□□□ -0.4
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRAC1Q96KF2 57 aa12.1□□□□□ -0.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A1B0GU69 56 aa12.06□□□□□ -0.48
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADM2Q7Z4H4 148 aa12.04□□□□□ -0.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C9orf92A6NGG3 77 aa12.02□□□□□ -0.49
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPATA8Q6RVD6 105 aa11.97□□□□□ -0.49
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UQCR11O14957 56 aa11.88□□□□□ -0.51
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 Q8N1X5 172 aa11.83□□□□□ -0.52
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa11.8□□□□□ -0.52
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RYR3Q15413 4870 aa11.8□□□□□ -0.52
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A8MUU9 505 aa11.79□□□□□ -0.52
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LINC01554Q52M75 96 aa11.78□□□□□ -0.52
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HSPG2P98160 4391 aa11.77□□□□□ -0.53
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 Q5VSD8 79 aa11.75□□□□□ -0.53
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TNXBP22105 4242 aa11.69□□□□□ -0.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAT3Q8TDW7 4589 aa11.68□□□□□ -0.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CSAG1Q6PB30 78 aa11.66□□□□□ -0.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP10-8P60410 259 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RYR1P21817 5038 aa11.62□□□□□ -0.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa11.56□□□□□ -0.56
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIAA1109Q2LD37 5005 aa11.55□□□□□ -0.56
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