RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CNOT1-222	ENST00000570139		Q8N9L7	120 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CNOT1-222	ENST00000570139	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CNOT1-222	ENST00000570139		A8MU10	97 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CNOT1-222	ENST00000570139	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNOT1-222	ENST00000570139	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNOT1-222	ENST00000570139	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CNOT1-222	ENST00000570139	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	CCK	P06307	115 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139		Q6JHZ5	121 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139		Q6ZQT0	140 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139		K7ERS5	55 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139		Q6Q795	121 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A1B0GV72	72 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	VPS25	Q9BRG1	176 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	RYR1	P21817	5038 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CNOT1-222	ENST00000570139	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	CRYGA	P11844	174 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	HAMP	P81172	84 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	HERC2	O95714	4834 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A1W2PNM2	257 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	MOBP	Q13875	183 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	NREP	Q16612	68 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CNOT1-222	ENST00000570139		Q5VSD8	79 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CNOT1-222	ENST00000570139	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A087WSZ3	146 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CNOT1-222	ENST00000570139		J3KT08	172 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CNOT1-222	ENST00000570139	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CNOT1-222	ENST00000570139	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CNOT1-222	ENST00000570139	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CNOT1-222	ENST00000570139	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CNOT1-222	ENST00000570139	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4	□□□□□ -1.77
CNOT1-222	ENST00000570139		Q5XG85	94 aa		4	□□□□□ -1.77
CNOT1-222	ENST00000570139	SPINK1	P00995	79 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CNOT1-222	ENST00000570139	MT-ATP8	P03928	68 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CNOT1-222	ENST00000570139		A8MWP4	228 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CNOT1-222	ENST00000570139	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A0G2JQZ4	141 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139		A6NED7	52 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	NDUFB1	O75438	58 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00313	P59037	77 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	HSPG2	P98160	4391 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139		A8MUU9	505 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	ATOX1	O00244	68 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	IGKV4-1	P06312	121 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139		Q96NJ1	140 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	PRR15	Q8IV56	129 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	FAT1	Q14517	4588 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139		K7EQZ3	153 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		3.9	□□□□□ -1.78
CNOT1-222	ENST00000570139	HCG22	E2RYF7	251 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CNOT1-222	ENST00000570139	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A087WVE0	104 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CNOT1-222	ENST00000570139	CASC2	Q6XLA1	102 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CNOT1-222	ENST00000570139	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		3.86	□□□□□ -1.79

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