RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518681.5

MIB2-231, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene MIB2, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-231	ENST00000518681	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		11.23	□□□□□ -0.61
MIB2-231	ENST00000518681	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MIB2-231	ENST00000518681	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		11.22	□□□□□ -0.61
MIB2-231	ENST00000518681	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MIB2-231	ENST00000518681	LINC00483	Q53H64	154 aa		11.2	□□□□□ -0.62
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF861P	O60384	105 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MIB2-231	ENST00000518681	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
MIB2-231	ENST00000518681		V9GYY9	64 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MIB2-231	ENST00000518681		A6NED7	52 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MIB2-231	ENST00000518681		Q5W150	140 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MIB2-231	ENST00000518681	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MIB2-231	ENST00000518681	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		11.15	□□□□□ -0.63
MIB2-231	ENST00000518681	LIMD2	Q9BT23	127 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MIB2-231	ENST00000518681	PMAIP1	Q13794	54 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MIB2-231	ENST00000518681	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MIB2-231	ENST00000518681	HRES1	P13985	223 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MIB2-231	ENST00000518681		Q6ZR54	194 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MIB2-231	ENST00000518681	LY6G6C	O95867	125 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MIB2-231	ENST00000518681	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MIB2-231	ENST00000518681	LCA10	Q71F78	164 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MIB2-231	ENST00000518681	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MIB2-231	ENST00000518681	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MIB2-231	ENST00000518681	DNHD1	Q96M86	4753 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MIB2-231	ENST00000518681	IGLV7-43	P04211	117 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MIB2-231	ENST00000518681	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP10-2	P60368	255 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MIB2-231	ENST00000518681	SPINK7	P58062	85 aa		11	□□□□□ -0.65
MIB2-231	ENST00000518681	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		11	□□□□□ -0.65
MIB2-231	ENST00000518681		Q75L30	129 aa		11	□□□□□ -0.65
MIB2-231	ENST00000518681	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MIB2-231	ENST00000518681	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		10.98	□□□□□ -0.65
MIB2-231	ENST00000518681	SEC61G	P60059	68 aa		10.93	□□□□□ -0.66
MIB2-231	ENST00000518681	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		10.93	□□□□□ -0.66
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		10.9	□□□□□ -0.66
MIB2-231	ENST00000518681	LINC00313	P59037	77 aa		10.89	□□□□□ -0.67
MIB2-231	ENST00000518681	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		10.89	□□□□□ -0.67
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		10.89	□□□□□ -0.67
MIB2-231	ENST00000518681	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		10.84	□□□□□ -0.67
MIB2-231	ENST00000518681	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MIB2-231	ENST00000518681	IGKV2-30	P06310	120 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP10-1	P60331	282 aa		10.83	□□□□□ -0.68
MIB2-231	ENST00000518681	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MIB2-231	ENST00000518681	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MIB2-231	ENST00000518681	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MIB2-231	ENST00000518681	ACYP2	P14621	99 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MIB2-231	ENST00000518681	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MIB2-231	ENST00000518681	C8orf87	E5RJ46	101 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MIB2-231	ENST00000518681		A6NN06	94 aa		10.75	□□□□□ -0.69
MIB2-231	ENST00000518681	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		10.74	□□□□□ -0.69
MIB2-231	ENST00000518681	FAM229A	H3BQW9	127 aa		10.73	□□□□□ -0.69
MIB2-231	ENST00000518681	PKD1	P98161	4303 aa		10.72	□□□□□ -0.69
MIB2-231	ENST00000518681	DMAC1	Q96GE9	116 aa		10.71	□□□□□ -0.7
MIB2-231	ENST00000518681	SPINK1	P00995	79 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MIB2-231	ENST00000518681	PKHD1	P08F94	4074 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MIB2-231	ENST00000518681	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MIB2-231	ENST00000518681		A0A1B0GU69	56 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MIB2-231	ENST00000518681	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MIB2-231	ENST00000518681	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MIB2-231	ENST00000518681	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MIB2-231	ENST00000518681		Q8N1X5	172 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MIB2-231	ENST00000518681	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MIB2-231	ENST00000518681	PRAC1	Q96KF2	57 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MIB2-231	ENST00000518681	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
MIB2-231	ENST00000518681	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		10.58	□□□□□ -0.72
MIB2-231	ENST00000518681		Q6ZSA8	131 aa		10.58	□□□□□ -0.72
MIB2-231	ENST00000518681	C9orf92	A6NGG3	77 aa		10.52	□□□□□ -0.73
MIB2-231	ENST00000518681	FAT1	Q14517	4588 aa		10.52	□□□□□ -0.73
MIB2-231	ENST00000518681	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		10.46	□□□□□ -0.74
MIB2-231	ENST00000518681	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MIB2-231	ENST00000518681	UQCR11	O14957	56 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MIB2-231	ENST00000518681	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
MIB2-231	ENST00000518681	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MIB2-231	ENST00000518681	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MIB2-231	ENST00000518681	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MIB2-231	ENST00000518681	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
MIB2-231	ENST00000518681	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
MIB2-231	ENST00000518681	CSAG1	Q6PB30	78 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MIB2-231	ENST00000518681	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MIB2-231	ENST00000518681		H0YAA0	97 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MIB2-231	ENST00000518681	MYCBP2	O75592	4640 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MIB2-231	ENST00000518681		A8MUU9	505 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MIB2-231	ENST00000518681	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MIB2-231	ENST00000518681	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MIB2-231	ENST00000518681	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MIB2-231	ENST00000518681		A0A1B0GU33	70 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MIB2-231	ENST00000518681	LINC01554	Q52M75	96 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MIB2-231	ENST00000518681	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
MIB2-231	ENST00000518681	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
MIB2-231	ENST00000518681	CRIPT	Q9P021	101 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MIB2-231	ENST00000518681	HSPG2	P98160	4391 aa		9.97	□□□□□ -0.81
MIB2-231	ENST00000518681	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		9.95	□□□□□ -0.82
MIB2-231	ENST00000518681		A0A1B0GVY2	172 aa		9.94	□□□□□ -0.82
MIB2-231	ENST00000518681	RYR2	Q92736	4967 aa		9.91	□□□□□ -0.82
MIB2-231	ENST00000518681	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		9.89	□□□□□ -0.83
MIB2-231	ENST00000518681	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		9.88	□□□□□ -0.83
MIB2-231	ENST00000518681		A0A0D9SG42	100 aa		9.83	□□□□□ -0.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.4 ms