RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CCSAP-204ENST00000483092 A0A087X002 238 aa9.81□□□□□ -0.84
CCSAP-204ENST00000483092 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.81□□□□□ -0.84
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GU69 56 aa9.8□□□□□ -0.84
CCSAP-204ENST00000483092 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GVX0 72 aa9.78□□□□□ -0.84
CCSAP-204ENST00000483092 H3BS24 57 aa9.77□□□□□ -0.85
CCSAP-204ENST00000483092 NUPR2A6NF83 97 aa9.76□□□□□ -0.85
CCSAP-204ENST00000483092 ACYP2P14621 99 aa9.76□□□□□ -0.85
CCSAP-204ENST00000483092 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa9.74□□□□□ -0.85
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01554Q52M75 96 aa9.74□□□□□ -0.85
CCSAP-204ENST00000483092 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.72□□□□□ -0.85
CCSAP-204ENST00000483092 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
CCSAP-204ENST00000483092 Q5W150 140 aa9.7□□□□□ -0.86
CCSAP-204ENST00000483092 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.7□□□□□ -0.86
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZR54 194 aa9.7□□□□□ -0.86
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CCSAP-204ENST00000483092 SPINK1P00995 79 aa9.69□□□□□ -0.86
CCSAP-204ENST00000483092 SPRR1BP22528 89 aa9.69□□□□□ -0.86
CCSAP-204ENST00000483092 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.68□□□□□ -0.86
CCSAP-204ENST00000483092 A0A087WTM6 91 aa9.68□□□□□ -0.86
CCSAP-204ENST00000483092 LY6G6CO95867 125 aa9.67□□□□□ -0.86
CCSAP-204ENST00000483092 Q96NJ1 140 aa9.67□□□□□ -0.86
CCSAP-204ENST00000483092 KMT2AQ03164 3969 aa9.66□□□□□ -0.86
CCSAP-204ENST00000483092 RTL8CO15255 209 aa9.66□□□□□ -0.86
CCSAP-204ENST00000483092 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.66□□□□□ -0.86
CCSAP-204ENST00000483092 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CCSAP-204ENST00000483092 CSAG1Q6PB30 78 aa9.64□□□□□ -0.87
CCSAP-204ENST00000483092 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.62□□□□□ -0.87
CCSAP-204ENST00000483092 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.62□□□□□ -0.87
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa9.61□□□□□ -0.87
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV2-30P06310 120 aa9.61□□□□□ -0.87
CCSAP-204ENST00000483092 UQCR11O14957 56 aa9.61□□□□□ -0.87
CCSAP-204ENST00000483092 DNHD1Q96M86 4753 aa9.6□□□□□ -0.87
CCSAP-204ENST00000483092 FBN3Q75N90 2809 aa9.6□□□□□ -0.87
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.6□□□□□ -0.87
CCSAP-204ENST00000483092 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.57□□□□□ -0.88
CCSAP-204ENST00000483092 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.54□□□□□ -0.88
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.53□□□□□ -0.88
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CCSAP-204ENST00000483092 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.52□□□□□ -0.89
CCSAP-204ENST00000483092 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.5□□□□□ -0.89
CCSAP-204ENST00000483092 DNAH2Q9P225 4427 aa9.49□□□□□ -0.89
CCSAP-204ENST00000483092 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CCSAP-204ENST00000483092 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.47□□□□□ -0.89
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.46□□□□□ -0.89
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF861PO60384 105 aa9.46□□□□□ -0.9
CCSAP-204ENST00000483092 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.45□□□□□ -0.9
CCSAP-204ENST00000483092 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CCSAP-204ENST00000483092 DMAC1Q96GE9 116 aa9.45□□□□□ -0.9
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP10-2P60368 255 aa9.44□□□□□ -0.9
CCSAP-204ENST00000483092 FAM229AH3BQW9 127 aa9.42□□□□□ -0.9
CCSAP-204ENST00000483092 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.4□□□□□ -0.9
CCSAP-204ENST00000483092 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.4□□□□□ -0.91
CCSAP-204ENST00000483092 CRIPTQ9P021 101 aa9.39□□□□□ -0.91
CCSAP-204ENST00000483092 Q8N1X5 172 aa9.39□□□□□ -0.91
CCSAP-204ENST00000483092 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.38□□□□□ -0.91
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV7-43P04211 117 aa9.37□□□□□ -0.91
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00483Q53H64 154 aa9.35□□□□□ -0.91
CCSAP-204ENST00000483092 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.34□□□□□ -0.91
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.29□□□□□ -0.92
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP10-1P60331 282 aa9.28□□□□□ -0.92
CCSAP-204ENST00000483092 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.25□□□□□ -0.93
CCSAP-204ENST00000483092 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.2□□□□□ -0.94
CCSAP-204ENST00000483092 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.2□□□□□ -0.94
CCSAP-204ENST00000483092 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.19□□□□□ -0.94
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.16□□□□□ -0.94
CCSAP-204ENST00000483092 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.15□□□□□ -0.94
CCSAP-204ENST00000483092 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.95
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa9.1□□□□□ -0.95
CCSAP-204ENST00000483092 K7ERS5 55 aa9.09□□□□□ -0.95
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GU33 70 aa9.08□□□□□ -0.96
CCSAP-204ENST00000483092 ROMO1P60602 79 aa9.08□□□□□ -0.96
CCSAP-204ENST00000483092 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.07□□□□□ -0.96
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZSA8 131 aa9.07□□□□□ -0.96
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.07□□□□□ -0.96
CCSAP-204ENST00000483092 H0YAA0 97 aa9.05□□□□□ -0.96
CCSAP-204ENST00000483092 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.05□□□□□ -0.96
CCSAP-204ENST00000483092 PKHD1P08F94 4074 aa9.03□□□□□ -0.96
CCSAP-204ENST00000483092 SPINT4Q6UDR6 99 aa9.01□□□□□ -0.97
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9□□□□□ -0.97
CCSAP-204ENST00000483092 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9□□□□□ -0.97
CCSAP-204ENST00000483092 A8MUU9 505 aa9□□□□□ -0.97
CCSAP-204ENST00000483092 PKD1P98161 4303 aa8.99□□□□□ -0.97
CCSAP-204ENST00000483092 C9orf92A6NGG3 77 aa8.99□□□□□ -0.97
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.96□□□□□ -0.98
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0D9SG42 100 aa8.94□□□□□ -0.98
CCSAP-204ENST00000483092 FAT1Q14517 4588 aa8.9□□□□□ -0.98
CCSAP-204ENST00000483092 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.9□□□□□ -0.98
CCSAP-204ENST00000483092 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.82□□□□□ -1
CCSAP-204ENST00000483092 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
CCSAP-204ENST00000483092 P0C880 135 aa8.79□□□□□ -1
CCSAP-204ENST00000483092 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.75□□□□□ -1.01
CCSAP-204ENST00000483092 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.74□□□□□ -1.01
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFAF8A1L188 74 aa8.73□□□□□ -1.01
CCSAP-204ENST00000483092 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCSAP-204ENST00000483092 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.66□□□□□ -1.02
CCSAP-204ENST00000483092 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GVY2 172 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.3 ms