RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.93□□□□□ -1.46
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A087WSZ3 146 aa5.93□□□□□ -1.46
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 J3QR89 54 aa5.92□□□□□ -1.46
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MYCBP2O75592 4640 aa5.91□□□□□ -1.46
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q5XG85 94 aa5.9□□□□□ -1.46
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ACYP1P07311 99 aa5.88□□□□□ -1.47
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NREPQ16612 68 aa5.87□□□□□ -1.47
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.87□□□□□ -1.47
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UBL5Q9BZL1 73 aa5.87□□□□□ -1.47
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.87□□□□□ -1.47
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.86□□□□□ -1.47
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.85□□□□□ -1.47
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SIGMAR1Q99720 223 aa5.84□□□□□ -1.47
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.84□□□□□ -1.47
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A0A0MQY5 61 aa5.83□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 J3KT08 172 aa5.83□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 K7ERU9 68 aa5.83□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRR4Q16378 134 aa5.83□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C1orf195Q5TG92 126 aa5.82□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TNXBP22105 4242 aa5.81□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGKV4-1P06312 121 aa5.81□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q6ZVQ6 151 aa5.81□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00846Q9NV44 126 aa5.81□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BPY2O14599 106 aa5.8□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NDUFB1O75438 58 aa5.79□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.79□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.78□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.78□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q96NJ1 140 aa5.78□□□□□ -1.48
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.77□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A8MWP4 228 aa5.75□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CXCL6P80162 114 aa5.74□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.73□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A1B0GVX0 72 aa5.73□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00643Q86TS7 51 aa5.73□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C8orf87E5RJ46 101 aa5.72□□□□□ -1.49
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TPRXLQ17RH7 258 aa5.71□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C9orf92A6NGG3 77 aa5.7□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00313P59037 77 aa5.7□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SEC61GP60059 68 aa5.7□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRR15Q8IV56 129 aa5.7□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.69□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 K7EQZ3 153 aa5.69□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DSCR10P59022 87 aa5.69□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.68□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q8N9L7 120 aa5.67□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.66□□□□□ -1.5
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 hDV103S1A0JD37 113 aa5.63□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HCG22E2RYF7 251 aa5.63□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CASC2Q6XLA1 102 aa5.63□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.62□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.62□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.62□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HERC1Q15751 4861 aa5.61□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.6□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IMUPQ9GZP8 106 aa5.6□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NDUFS5O43920 106 aa5.59□□□□□ -1.51
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MT-ATP8P03928 68 aa5.58□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q75L30 129 aa5.58□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.57□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.57□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A087WVE0 104 aa5.56□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.56□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A8MUU9 505 aa5.55□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SCGB1A1P11684 91 aa5.54□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.53□□□□□ -1.52
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.52□□□□□ -1.53
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.5□□□□□ -1.53
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.5□□□□□ -1.53
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCOTHQ58A44 107 aa5.49□□□□□ -1.53
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.49□□□□□ -1.53
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.47□□□□□ -1.53
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UQCRQO14949 82 aa5.46□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LPAP08519 4548 aa5.46□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATOX1O00244 68 aa5.45□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.44□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRP2P98164 4655 aa5.44□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MP68P56378 58 aa5.42□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OCR1Q9BZK8 76 aa5.41□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H0Y9P7 68 aa5.4□□□□□ -1.54
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGKV2-30P06310 120 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C5orf47Q569G3 176 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q5W150 140 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.39□□□□□ -1.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.37□□□□□ -1.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPINK7P58062 85 aa5.37□□□□□ -1.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.36□□□□□ -1.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H3BPC8 53 aa5.36□□□□□ -1.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SERP2Q8N6R1 65 aa5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms