RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.19□□□□□ -0.94
NISCH-202ENST00000420808 NDUFS5O43920 106 aa9.18□□□□□ -0.94
NISCH-202ENST00000420808 BRK1Q8WUW1 75 aa9.18□□□□□ -0.94
NISCH-202ENST00000420808 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.18□□□□□ -0.94
NISCH-202ENST00000420808 PSPHP1O15172 72 aa9.17□□□□□ -0.94
NISCH-202ENST00000420808 CD164Q04900 197 aa9.14□□□□□ -0.95
NISCH-202ENST00000420808 H3BPC8 53 aa9.13□□□□□ -0.95
NISCH-202ENST00000420808 PKHD1P08F94 4074 aa9.13□□□□□ -0.95
NISCH-202ENST00000420808 PRO0628Q9UI54 55 aa9.13□□□□□ -0.95
NISCH-202ENST00000420808 CDK2AP2O75956 126 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-202ENST00000420808 Q1T7F1 81 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-202ENST00000420808 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-202ENST00000420808 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
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NISCH-202ENST00000420808 Q5W150 140 aa9.08□□□□□ -0.96
NISCH-202ENST00000420808 A8MUN3 132 aa9.08□□□□□ -0.96
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NISCH-202ENST00000420808 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.06□□□□□ -0.96
NISCH-202ENST00000420808 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.05□□□□□ -0.96
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NISCH-202ENST00000420808 Q5VV11 94 aa8.98□□□□□ -0.97
NISCH-202ENST00000420808 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.97□□□□□ -0.97
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.95□□□□□ -0.98
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NISCH-202ENST00000420808 PRR15LQ9BU68 103 aa8.93□□□□□ -0.98
NISCH-202ENST00000420808 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
NISCH-202ENST00000420808 FAT1Q14517 4588 aa8.91□□□□□ -0.98
NISCH-202ENST00000420808 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.91□□□□□ -0.98
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NISCH-202ENST00000420808 V9GYY9 64 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-202ENST00000420808 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8.86□□□□□ -0.99
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NISCH-202ENST00000420808 LIMD2Q9BT23 127 aa8.85□□□□□ -0.99
NISCH-202ENST00000420808 C8orf87E5RJ46 101 aa8.84□□□□□ -0.99
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NISCH-202ENST00000420808 LCA10Q71F78 164 aa8.77□□□□□ -1
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NISCH-202ENST00000420808 Q75L30 129 aa8.76□□□□□ -1.01
NISCH-202ENST00000420808 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.75□□□□□ -1.01
NISCH-202ENST00000420808 FAM229AH3BQW9 127 aa8.75□□□□□ -1.01
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NISCH-202ENST00000420808 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.72□□□□□ -1.01
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NISCH-202ENST00000420808 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.7□□□□□ -1.02
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NISCH-202ENST00000420808 RYR2Q92736 4967 aa8.67□□□□□ -1.02
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NISCH-202ENST00000420808 SPINK1P00995 79 aa8.65□□□□□ -1.02
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NISCH-202ENST00000420808 PMAIP1Q13794 54 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-202ENST00000420808 C9orf92A6NGG3 77 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-202ENST00000420808 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NISCH-202ENST00000420808 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NISCH-202ENST00000420808 A0A1B0GVY2 172 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-202ENST00000420808 Q8N1X5 172 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-202ENST00000420808 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-202ENST00000420808 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-202ENST00000420808 A6NN06 94 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-202ENST00000420808 A0A1B0GU69 56 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-202ENST00000420808 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.45□□□□□ -1.06
NISCH-202ENST00000420808 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
NISCH-202ENST00000420808 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
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NISCH-202ENST00000420808 RYR3Q15413 4870 aa8.44□□□□□ -1.06
NISCH-202ENST00000420808 MYCBP2O75592 4640 aa8.44□□□□□ -1.06
NISCH-202ENST00000420808 HSPG2P98160 4391 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-202ENST00000420808 A8MUU9 505 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-202ENST00000420808 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-202ENST00000420808 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.37□□□□□ -1.07
NISCH-202ENST00000420808 SEC61GP60059 68 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-202ENST00000420808 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
NISCH-202ENST00000420808 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-202ENST00000420808 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.3□□□□□ -1.08
NISCH-202ENST00000420808 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.29□□□□□ -1.08
NISCH-202ENST00000420808 RYR1P21817 5038 aa8.28□□□□□ -1.08
NISCH-202ENST00000420808 UQCR11O14957 56 aa8.27□□□□□ -1.08
NISCH-202ENST00000420808 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.26□□□□□ -1.09
NISCH-202ENST00000420808 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.26□□□□□ -1.09
NISCH-202ENST00000420808 PRAC1Q96KF2 57 aa8.22□□□□□ -1.09
NISCH-202ENST00000420808 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.21□□□□□ -1.1
NISCH-202ENST00000420808 Q5VSD8 79 aa8.2□□□□□ -1.1
NISCH-202ENST00000420808 LPAP08519 4548 aa8.2□□□□□ -1.1
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