RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 A0A087X002 238 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 CD164Q04900 197 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 LY6G6CO95867 125 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 Q5VV11 94 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa15.54■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 COA5Q86WW8 74 aa15.53■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 SPINK6Q6UWN8 80 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD13-201ENST00000392539 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXD13-201ENST00000392539 TGP01266 2768 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXD13-201ENST00000392539 DNAH6Q9C0G6 4158 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP10-2P60368 255 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXD13-201ENST00000392539 PMAIP1Q13794 54 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD13-201ENST00000392539 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD13-201ENST00000392539 C8orf87E5RJ46 101 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD13-201ENST00000392539 PRR15LQ9BU68 103 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD13-201ENST00000392539 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa15.39■□□□□ 0.05
HOXD13-201ENST00000392539 ALMS1Q8TCU4 4167 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD13-201ENST00000392539 Q75L30 129 aa15.36■□□□□ 0.05
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXD13-201ENST00000392539 Q5W150 140 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXD13-201ENST00000392539 DNAH11Q96DT5 4516 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXD13-201ENST00000392539 DNAH5Q8TE73 4624 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXD13-201ENST00000392539 Q6ZSA8 131 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXD13-201ENST00000392539 HRES1P13985 223 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXD13-201ENST00000392539 LINC00313P59037 77 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD13-201ENST00000392539 A8MU10 97 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP10-1P60331 282 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD13-201ENST00000392539 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD13-201ENST00000392539 SEC61GP60059 68 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD13-201ENST00000392539 SPAG11AQ6PDA7 123 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD13-201ENST00000392539 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD13-201ENST00000392539 A6NED7 52 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD13-201ENST00000392539 LCA10Q71F78 164 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD13-201ENST00000392539 FAM229AH3BQW9 127 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD13-201ENST00000392539 DNHD1Q96M86 4753 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD13-201ENST00000392539 PKD1P98161 4303 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD13-201ENST00000392539 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa15.12■□□□□ 0.01
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa15.11■□□□□ 0.01
HOXD13-201ENST00000392539 ACYP2P14621 99 aa15.09■□□□□ 0.01
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa15.05■□□□□ -0
HOXD13-201ENST00000392539 LRP1BQ9NZR2 4599 aa15.05■□□□□ -0
HOXD13-201ENST00000392539 SPTSSBQ8NFR3 76 aa15.04■□□□□ -0
HOXD13-201ENST00000392539 IGKV2-30P06310 120 aa15.03■□□□□ -0
HOXD13-201ENST00000392539 RETNLBQ9BQ08 111 aa15.02■□□□□ -0
HOXD13-201ENST00000392539 DMAC1Q96GE9 116 aa15.02□□□□□ -0.01
HOXD13-201ENST00000392539 FAT2Q9NYQ8 4349 aa15.01□□□□□ -0.01
HOXD13-201ENST00000392539 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa15□□□□□ -0.01
HOXD13-201ENST00000392539 PRR26Q8N8Z3 221 aa15□□□□□ -0.01
HOXD13-201ENST00000392539 C4orf48Q5BLP8 95 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXD13-201ENST00000392539 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXD13-201ENST00000392539 A6NN06 94 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXD13-201ENST00000392539 TYMSOSQ8TAI1 123 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD13-201ENST00000392539 HYDINQ4G0P3 5121 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXD13-201ENST00000392539 SPINK1P00995 79 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD13-201ENST00000392539 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD13-201ENST00000392539 SPINK7P58062 85 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXD13-201ENST00000392539 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXD13-201ENST00000392539 RPS29P62273 56 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXD13-201ENST00000392539 LINC00304Q8N9R0 145 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXD13-201ENST00000392539 C7orf65Q6ZTY9 151 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXD13-201ENST00000392539 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1B0GU69 56 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD13-201ENST00000392539 SACSQ9NZJ4 4579 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD13-201ENST00000392539 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXD13-201ENST00000392539 PKHD1P08F94 4074 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD13-201ENST00000392539 SPATA8Q6RVD6 105 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXD13-201ENST00000392539 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1B0GVY2 172 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXD13-201ENST00000392539 Q8N1X5 172 aa14.42□□□□□ -0.1
HOXD13-201ENST00000392539 A8MUU9 505 aa14.41□□□□□ -0.1
HOXD13-201ENST00000392539 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa14.41□□□□□ -0.1
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
HOXD13-201ENST00000392539 UQCR11O14957 56 aa14.4□□□□□ -0.1
HOXD13-201ENST00000392539 C9orf92A6NGG3 77 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXD13-201ENST00000392539 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXD13-201ENST00000392539 MIR22HGQ0VDD5 57 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD13-201ENST00000392539 APOBP04114 4563 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
HOXD13-201ENST00000392539 FAT1Q14517 4588 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXD13-201ENST00000392539 PRAC1Q96KF2 57 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXD13-201ENST00000392539 ADM2Q7Z4H4 148 aa14.1□□□□□ -0.15
HOXD13-201ENST00000392539 RYR2Q92736 4967 aa14.02□□□□□ -0.17
HOXD13-201ENST00000392539 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
HOXD13-201ENST00000392539 COX6B2Q6YFQ2 88 aa13.96□□□□□ -0.17
HOXD13-201ENST00000392539 LINC01554Q52M75 96 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP10-8P60410 259 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXD13-201ENST00000392539 H0YAA0 97 aa13.87□□□□□ -0.19
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1B0GU33 70 aa13.87□□□□□ -0.19
HOXD13-201ENST00000392539 FAT3Q8TDW7 4589 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXD13-201ENST00000392539 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXD13-201ENST00000392539 TNXBP22105 4242 aa13.8□□□□□ -0.2
HOXD13-201ENST00000392539 Q5VSD8 79 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXD13-201ENST00000392539 CSAG1Q6PB30 78 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXD13-201ENST00000392539 RPL37P61927 97 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
HOXD13-201ENST00000392539 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
HOXD13-201ENST00000392539 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms