RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 PMAIP1Q13794 54 aa5.86□□□□□ -1.47
TTPAL-202ENST00000372904 PRO0628Q9UI54 55 aa5.86□□□□□ -1.47
TTPAL-202ENST00000372904 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.85□□□□□ -1.47
TTPAL-202ENST00000372904 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.85□□□□□ -1.47
TTPAL-202ENST00000372904 A8MUN3 132 aa5.84□□□□□ -1.48
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.82□□□□□ -1.48
TTPAL-202ENST00000372904 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.82□□□□□ -1.48
TTPAL-202ENST00000372904 STAB2Q8WWQ8 2551 aa5.82□□□□□ -1.48
TTPAL-202ENST00000372904 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
TTPAL-202ENST00000372904 HRES1P13985 223 aa5.81□□□□□ -1.48
TTPAL-202ENST00000372904 Q5W150 140 aa5.8□□□□□ -1.48
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TTPAL-202ENST00000372904 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.72□□□□□ -1.49
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TTPAL-202ENST00000372904 Q5XG85 94 aa5.66□□□□□ -1.5
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TTPAL-202ENST00000372904 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.57□□□□□ -1.52
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TTPAL-202ENST00000372904 A0A0D9SG42 100 aa5.55□□□□□ -1.52
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TTPAL-202ENST00000372904 Q5VV11 94 aa5.54□□□□□ -1.52
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TTPAL-202ENST00000372904 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.51□□□□□ -1.53
TTPAL-202ENST00000372904 LINC01554Q52M75 96 aa5.51□□□□□ -1.53
TTPAL-202ENST00000372904 TGP01266 2768 aa5.5□□□□□ -1.53
TTPAL-202ENST00000372904 A0A1B0GU33 70 aa5.49□□□□□ -1.53
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TTPAL-202ENST00000372904 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
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TTPAL-202ENST00000372904 FBN3Q75N90 2809 aa5.38□□□□□ -1.55
TTPAL-202ENST00000372904 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.36□□□□□ -1.55
TTPAL-202ENST00000372904 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.36□□□□□ -1.55
TTPAL-202ENST00000372904 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.36□□□□□ -1.55
TTPAL-202ENST00000372904 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
TTPAL-202ENST00000372904 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
TTPAL-202ENST00000372904 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
TTPAL-202ENST00000372904 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.35□□□□□ -1.55
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP10-8P60410 259 aa5.34□□□□□ -1.56
TTPAL-202ENST00000372904 KMT2AQ03164 3969 aa5.33□□□□□ -1.56
TTPAL-202ENST00000372904 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.32□□□□□ -1.56
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TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.29□□□□□ -1.56
TTPAL-202ENST00000372904 COL7A1Q02388 2944 aa5.29□□□□□ -1.56
TTPAL-202ENST00000372904 A0A0A0MQY5 61 aa5.29□□□□□ -1.56
TTPAL-202ENST00000372904 R4GN34 69 aa5.29□□□□□ -1.56
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TTPAL-202ENST00000372904 DNAH2Q9P225 4427 aa5.26□□□□□ -1.57
TTPAL-202ENST00000372904 A8MU10 97 aa5.25□□□□□ -1.57
TTPAL-202ENST00000372904 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
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TTPAL-202ENST00000372904 DNHD1Q96M86 4753 aa5.22□□□□□ -1.57
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TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
TTPAL-202ENST00000372904 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.19□□□□□ -1.58
TTPAL-202ENST00000372904 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.18□□□□□ -1.58
TTPAL-202ENST00000372904 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.17□□□□□ -1.58
TTPAL-202ENST00000372904 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.14□□□□□ -1.59
TTPAL-202ENST00000372904 ROMO1P60602 79 aa5.12□□□□□ -1.59
TTPAL-202ENST00000372904 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.11□□□□□ -1.59
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