RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa11.5□□□□□ -0.57
CCSAP-203ENST00000366687 ZZEF1O43149 2961 aa11.5□□□□□ -0.57
CCSAP-203ENST00000366687 LRBAP50851 2863 aa11.49□□□□□ -0.57
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0A0MQY5 61 aa11.46□□□□□ -0.58
CCSAP-203ENST00000366687 PLAC4Q8WY50 150 aa11.43□□□□□ -0.58
CCSAP-203ENST00000366687 DCHS2Q6V1P9 2916 aa11.4□□□□□ -0.58
CCSAP-203ENST00000366687 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa11.36□□□□□ -0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ZANQ9Y493 2812 aa11.35□□□□□ -0.59
CCSAP-203ENST00000366687 VCANP13611 3396 aa11.34□□□□□ -0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TENM3Q9P273 2699 aa11.33□□□□□ -0.6
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa11.31□□□□□ -0.6
CCSAP-203ENST00000366687 H3BS24 57 aa11.3□□□□□ -0.6
CCSAP-203ENST00000366687 A8MUU9 505 aa11.28□□□□□ -0.6
CCSAP-203ENST00000366687 SZT2Q5T011 3432 aa11.27□□□□□ -0.6
CCSAP-203ENST00000366687 A8MU10 97 aa11.23□□□□□ -0.61
CCSAP-203ENST00000366687 A6NN06 94 aa11.17□□□□□ -0.62
CCSAP-203ENST00000366687 EYSQ5T1H1 3165 aa11.17□□□□□ -0.62
CCSAP-203ENST00000366687 COL6A3P12111 3177 aa11.15□□□□□ -0.63
CCSAP-203ENST00000366687 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa11.14□□□□□ -0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa11.13□□□□□ -0.63
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa11.11□□□□□ -0.63
CCSAP-203ENST00000366687 NF1P21359 2839 aa11.08□□□□□ -0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TENM1Q9UKZ4 2725 aa11.07□□□□□ -0.64
CCSAP-203ENST00000366687 FBN2P35556 2912 aa10.99□□□□□ -0.65
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa10.98□□□□□ -0.65
CCSAP-203ENST00000366687 DNAH14Q0VDD8 3507 aa10.96□□□□□ -0.65
CCSAP-203ENST00000366687 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
CCSAP-203ENST00000366687 TNP1P09430 55 aa10.88□□□□□ -0.67
CCSAP-203ENST00000366687 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CCSAP-203ENST00000366687 DMXL1Q9Y485 3027 aa10.85□□□□□ -0.67
CCSAP-203ENST00000366687 XP32Q5T750 250 aa10.84□□□□□ -0.67
CCSAP-203ENST00000366687 TENM2Q9NT68 2774 aa10.82□□□□□ -0.68
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa10.76□□□□□ -0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SPEGQ15772 3267 aa10.75□□□□□ -0.69
CCSAP-203ENST00000366687 MXRA5Q9NR99 2828 aa10.75□□□□□ -0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa10.74□□□□□ -0.69
CCSAP-203ENST00000366687 USP34Q70CQ2 3546 aa10.69□□□□□ -0.7
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFAF8A1L188 74 aa10.68□□□□□ -0.7
CCSAP-203ENST00000366687 TPRXLQ17RH7 258 aa10.68□□□□□ -0.7
CCSAP-203ENST00000366687 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa10.67□□□□□ -0.7
CCSAP-203ENST00000366687 PP632Q6XCG6 107 aa10.61□□□□□ -0.71
CCSAP-203ENST00000366687 TGP01266 2768 aa10.61□□□□□ -0.71
CCSAP-203ENST00000366687 LOC400499M0QZD8 3231 aa10.61□□□□□ -0.71
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP10-8P60410 259 aa10.55□□□□□ -0.72
CCSAP-203ENST00000366687 H0YAA0 97 aa10.54□□□□□ -0.72
CCSAP-203ENST00000366687 C10orf95Q9H7T3 257 aa10.54□□□□□ -0.72
CCSAP-203ENST00000366687 PDZD2O15018 2839 aa10.53□□□□□ -0.72
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa10.51□□□□□ -0.73
CCSAP-203ENST00000366687 MYO15AQ9UKN7 3530 aa10.51□□□□□ -0.73
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GVY2 172 aa10.5□□□□□ -0.73
CCSAP-203ENST00000366687 VWFP04275 2813 aa10.5□□□□□ -0.73
CCSAP-203ENST00000366687 DCHS1Q96JQ0 3298 aa10.38□□□□□ -0.75
CCSAP-203ENST00000366687 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CCSAP-203ENST00000366687 P0C880 135 aa10.36□□□□□ -0.75
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP10-10P60014 251 aa10.35□□□□□ -0.75
CCSAP-203ENST00000366687 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CCSAP-203ENST00000366687 PRO2289Q9P1D8 64 aa10.22□□□□□ -0.77
CCSAP-203ENST00000366687 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CCSAP-203ENST00000366687 RELNP78509 3460 aa10.1□□□□□ -0.79
CCSAP-203ENST00000366687 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa10.03□□□□□ -0.8
CCSAP-203ENST00000366687 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.95□□□□□ -0.82
CCSAP-203ENST00000366687 FBN3Q75N90 2809 aa9.9□□□□□ -0.82
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP12-2P59991 146 aa9.89□□□□□ -0.83
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa9.81□□□□□ -0.84
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP12-1P59990 96 aa9.79□□□□□ -0.84
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa9.79□□□□□ -0.84
CCSAP-203ENST00000366687 COL7A1Q02388 2944 aa9.73□□□□□ -0.85
CCSAP-203ENST00000366687 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa9.73□□□□□ -0.85
CCSAP-203ENST00000366687 ZFHX3Q15911 3703 aa9.69□□□□□ -0.86
CCSAP-203ENST00000366687 LAMA5O15230 3695 aa9.62□□□□□ -0.87
CCSAP-203ENST00000366687 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.61□□□□□ -0.87
CCSAP-203ENST00000366687 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.59□□□□□ -0.87
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.54□□□□□ -0.88
CCSAP-203ENST00000366687 MT1HL1P0DM35 61 aa9.44□□□□□ -0.9
CCSAP-203ENST00000366687 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.34□□□□□ -0.91
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa9.32□□□□□ -0.92
CCSAP-203ENST00000366687 MUC3AQ02505 3323 aa9.27□□□□□ -0.93
CCSAP-203ENST00000366687 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CCSAP-203ENST00000366687 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.21□□□□□ -0.93
CCSAP-203ENST00000366687 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.2□□□□□ -0.94
CCSAP-203ENST00000366687 DMDP11532 3685 aa9.2□□□□□ -0.94
CCSAP-203ENST00000366687 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa9.19□□□□□ -0.94
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.19□□□□□ -0.94
CCSAP-203ENST00000366687 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CCSAP-203ENST00000366687 CUBNO60494 3623 aa9.14□□□□□ -0.95
CCSAP-203ENST00000366687 SVEP1Q4LDE5 3571 aa9.06□□□□□ -0.96
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.02□□□□□ -0.97
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP10-12P60413 245 aa8.98□□□□□ -0.97
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP12-3P60328 96 aa8.76□□□□□ -1.01
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.74□□□□□ -1.01
CCSAP-203ENST00000366687 INE1O15225 51 aa8.74□□□□□ -1.01
CCSAP-203ENST00000366687 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCSAP-203ENST00000366687 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.64□□□□□ -1.03
CCSAP-203ENST00000366687 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CCSAP-203ENST00000366687 LCE3AQ5TA76 89 aa8.59□□□□□ -1.03
CCSAP-203ENST00000366687 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.51□□□□□ -1.05
CCSAP-203ENST00000366687 BSNQ9UPA5 3926 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms