RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SZT2Q5T011 3432 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRM-201ENST00000332175 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRM-201ENST00000332175 LRBAP50851 2863 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRM-201ENST00000332175 VCANP13611 3396 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRM-201ENST00000332175 TACC2O95359 2948 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRM-201ENST00000332175 ATMQ13315 3056 aa11.89□□□□□ -0.51
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PTPRM-201ENST00000332175 CSMD1Q96PZ7 3565 aa10.42□□□□□ -0.74
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PTPRM-201ENST00000332175 ZFHX3Q15911 3703 aa10.15□□□□□ -0.78
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PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP10-12P60413 245 aa10.04□□□□□ -0.8
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PTPRM-201ENST00000332175 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
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PTPRM-201ENST00000332175 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 KRTAP12-3P60328 96 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-201ENST00000332175 CUBNO60494 3623 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-201ENST00000332175 LCE3AQ5TA76 89 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-201ENST00000332175 COL7A1Q02388 2944 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRM-201ENST00000332175 INE1O15225 51 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRM-201ENST00000332175 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-201ENST00000332175 MUC3AQ02505 3323 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-201ENST00000332175 BSNQ9UPA5 3926 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-201ENST00000332175 VPS13CQ709C8 3753 aa9.4□□□□□ -0.9
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