RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-201ENST00000266546 LCE6AA0A183 80 aa7.07□□□□□ -1.28
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CLSTN3-201ENST00000266546 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-201ENST00000266546 HRES1P13985 223 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-201ENST00000266546 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-201ENST00000266546 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.05□□□□□ -1.28
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CLSTN3-201ENST00000266546 A0A0D9SG42 100 aa6.68□□□□□ -1.34
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CLSTN3-201ENST00000266546 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.43□□□□□ -1.38
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CLSTN3-201ENST00000266546 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.32□□□□□ -1.4
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CLSTN3-201ENST00000266546 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-201ENST00000266546 A8MUU9 505 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-201ENST00000266546 LUZP6Q538Z0 58 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-201ENST00000266546 H0YAA0 97 aa6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-201ENST00000266546 DNHD1Q96M86 4753 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-201ENST00000266546 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-201ENST00000266546 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.25□□□□□ -1.41
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CLSTN3-201ENST00000266546 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-201ENST00000266546 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
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CLSTN3-201ENST00000266546 NDUFAF8A1L188 74 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-201ENST00000266546 R4GN34 69 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-201ENST00000266546 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.18□□□□□ -1.42
CLSTN3-201ENST00000266546 KRTAP10-8P60410 259 aa6.18□□□□□ -1.42
CLSTN3-201ENST00000266546 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.15□□□□□ -1.43
CLSTN3-201ENST00000266546 M0QZ58 72 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-201ENST00000266546 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-201ENST00000266546 LYSTQ99698 3801 aa6.11□□□□□ -1.43
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CLSTN3-201ENST00000266546 A0A0A0MQY5 61 aa6.09□□□□□ -1.43
CLSTN3-201ENST00000266546 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-201ENST00000266546 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-201ENST00000266546 TPRXLQ17RH7 258 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-201ENST00000266546 DNAH2Q9P225 4427 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-201ENST00000266546 XP32Q5T750 250 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-201ENST00000266546 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-201ENST00000266546 PLAC4Q8WY50 150 aa5.97□□□□□ -1.45
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