RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640769.1

RTTN-222, Transcript of rotatin, human

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RTTN, Length 8,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTTN-222	ENST00000640769	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RTTN-222	ENST00000640769	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RTTN-222	ENST00000640769	USP24	Q9UPU5	2620 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RTTN-222	ENST00000640769	KRTAP10-3	P60369	221 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RTTN-222	ENST00000640769	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RTTN-222	ENST00000640769		Q6ZR54	194 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RTTN-222	ENST00000640769	PANO1	I0J062	215 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RTTN-222	ENST00000640769	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
RTTN-222	ENST00000640769		A8MUU9	505 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RTTN-222	ENST00000640769	REV3L	O60673	3130 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RTTN-222	ENST00000640769	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RTTN-222	ENST00000640769		Q5VSD8	79 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RTTN-222	ENST00000640769	C5orf42	Q9H799	3197 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RTTN-222	ENST00000640769	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RTTN-222	ENST00000640769	CEP350	Q5VT06	3117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RTTN-222	ENST00000640769	CFAP54	Q96N23	3096 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RTTN-222	ENST00000640769	SPRR1A	P35321	89 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RTTN-222	ENST00000640769	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RTTN-222	ENST00000640769	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RTTN-222	ENST00000640769	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RTTN-222	ENST00000640769	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RTTN-222	ENST00000640769	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RTTN-222	ENST00000640769		A0A087X002	238 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RTTN-222	ENST00000640769	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RTTN-222	ENST00000640769	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RTTN-222	ENST00000640769	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		5	□□□□□ -1.61
RTTN-222	ENST00000640769	AKAP13	Q12802	2813 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RTTN-222	ENST00000640769		A0A0C4DFX4	3053 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RTTN-222	ENST00000640769	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RTTN-222	ENST00000640769	TNP1	P09430	55 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTTN-222	ENST00000640769	SPRR1B	P22528	89 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RTTN-222	ENST00000640769	CENPE	Q02224	2701 aa		4.96	□□□□□ -1.61
RTTN-222	ENST00000640769	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RTTN-222	ENST00000640769	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RTTN-222	ENST00000640769	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RTTN-222	ENST00000640769	EP400	Q96L91	3159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RTTN-222	ENST00000640769	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RTTN-222	ENST00000640769	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTTN-222	ENST00000640769	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RTTN-222	ENST00000640769	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RTTN-222	ENST00000640769	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTTN-222	ENST00000640769	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTTN-222	ENST00000640769	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTTN-222	ENST00000640769	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTTN-222	ENST00000640769	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTTN-222	ENST00000640769	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTTN-222	ENST00000640769		P0C880	135 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTTN-222	ENST00000640769	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTTN-222	ENST00000640769	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTTN-222	ENST00000640769	CHD6	Q8TD26	2715 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RTTN-222	ENST00000640769	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RTTN-222	ENST00000640769	LCE6A	A0A183	80 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RTTN-222	ENST00000640769	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTTN-222	ENST00000640769	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RTTN-222	ENST00000640769	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTTN-222	ENST00000640769	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RTTN-222	ENST00000640769		H0YAA0	97 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RTTN-222	ENST00000640769	TRIO	O75962	3097 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTTN-222	ENST00000640769	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RTTN-222	ENST00000640769	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RTTN-222	ENST00000640769	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RTTN-222	ENST00000640769	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RTTN-222	ENST00000640769	MGA	Q8IWI9	3026 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RTTN-222	ENST00000640769	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RTTN-222	ENST00000640769		A0A1B0GVY2	172 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RTTN-222	ENST00000640769	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RTTN-222	ENST00000640769	APC	P25054	2843 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RTTN-222	ENST00000640769	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RTTN-222	ENST00000640769	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RTTN-222	ENST00000640769	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RTTN-222	ENST00000640769	ATR	Q13535	2644 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RTTN-222	ENST00000640769	KALRN	O60229	2985 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTTN-222	ENST00000640769	CDH23	Q9H251	3354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTTN-222	ENST00000640769	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTTN-222	ENST00000640769	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RTTN-222	ENST00000640769	BRCA2	P51587	3418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RTTN-222	ENST00000640769	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTTN-222	ENST00000640769		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RTTN-222	ENST00000640769	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTTN-222	ENST00000640769	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RTTN-222	ENST00000640769	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RTTN-222	ENST00000640769	FRY	Q5TBA9	3013 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RTTN-222	ENST00000640769	HTT	P42858	3142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTTN-222	ENST00000640769	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTTN-222	ENST00000640769	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RTTN-222	ENST00000640769	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RTTN-222	ENST00000640769	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTTN-222	ENST00000640769	LRBA	P50851	2863 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RTTN-222	ENST00000640769	MAST4	O15021	2626 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTTN-222	ENST00000640769	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RTTN-222	ENST00000640769	LAMA3	Q16787	3333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RTTN-222	ENST00000640769	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTTN-222	ENST00000640769	ITPR1	Q14643	2758 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTTN-222	ENST00000640769	SZT2	Q5T011	3432 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RTTN-222	ENST00000640769	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTTN-222	ENST00000640769	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTTN-222	ENST00000640769	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RTTN-222	ENST00000640769	COL6A3	P12111	3177 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RTTN-222	ENST00000640769	TRANK1	O15050	2925 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RTTN-222	ENST00000640769	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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