RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1-208ENST00000586667 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.4□□□□□ -1.22
DNMT1-208ENST00000586667 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.39□□□□□ -1.23
DNMT1-208ENST00000586667 HERC1Q15751 4861 aa7.38□□□□□ -1.23
DNMT1-208ENST00000586667 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.37□□□□□ -1.23
DNMT1-208ENST00000586667 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.37□□□□□ -1.23
DNMT1-208ENST00000586667 MOBPQ13875 183 aa7.36□□□□□ -1.23
DNMT1-208ENST00000586667 ATXN8Q156A1 80 aa7.36□□□□□ -1.23
DNMT1-208ENST00000586667 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.35□□□□□ -1.23
DNMT1-208ENST00000586667 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.35□□□□□ -1.23
DNMT1-208ENST00000586667 DNAL4O96015 105 aa7.35□□□□□ -1.23
DNMT1-208ENST00000586667 FABP2P12104 132 aa7.35□□□□□ -1.23
DNMT1-208ENST00000586667 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.35□□□□□ -1.23
DNMT1-208ENST00000586667 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.34□□□□□ -1.23
DNMT1-208ENST00000586667 SNCGO76070 127 aa7.33□□□□□ -1.24
DNMT1-208ENST00000586667 Q8NBF4 154 aa7.33□□□□□ -1.24
DNMT1-208ENST00000586667 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.33□□□□□ -1.24
DNMT1-208ENST00000586667 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.33□□□□□ -1.24
DNMT1-208ENST00000586667 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.32□□□□□ -1.24
DNMT1-208ENST00000586667 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.32□□□□□ -1.24
DNMT1-208ENST00000586667 H3BMG7 143 aa7.31□□□□□ -1.24
DNMT1-208ENST00000586667 K7EP34 96 aa7.31□□□□□ -1.24
DNMT1-208ENST00000586667 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.31□□□□□ -1.24
DNMT1-208ENST00000586667 A0A0G2JQZ4 141 aa7.29□□□□□ -1.24
DNMT1-208ENST00000586667 C9JAW5 83 aa7.29□□□□□ -1.24
DNMT1-208ENST00000586667 J3QL48 77 aa7.29□□□□□ -1.24
DNMT1-208ENST00000586667 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DNMT1-208ENST00000586667 MTURNQ8N3F0 131 aa7.29□□□□□ -1.24
DNMT1-208ENST00000586667 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.28□□□□□ -1.24
DNMT1-208ENST00000586667 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.28□□□□□ -1.24
DNMT1-208ENST00000586667 PRO0461Q9UI25 63 aa7.28□□□□□ -1.24
DNMT1-208ENST00000586667 H3BQ85 93 aa7.27□□□□□ -1.25
DNMT1-208ENST00000586667 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.27□□□□□ -1.25
DNMT1-208ENST00000586667 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.27□□□□□ -1.25
DNMT1-208ENST00000586667 UBE2V1Q13404 147 aa7.27□□□□□ -1.25
DNMT1-208ENST00000586667 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.26□□□□□ -1.25
DNMT1-208ENST00000586667 F8WEM9 126 aa7.26□□□□□ -1.25
DNMT1-208ENST00000586667 GHRHP01286 108 aa7.26□□□□□ -1.25
DNMT1-208ENST00000586667 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
DNMT1-208ENST00000586667 IGFL1Q6UW32 110 aa7.26□□□□□ -1.25
DNMT1-208ENST00000586667 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.25□□□□□ -1.25
DNMT1-208ENST00000586667 A0A1B0GV72 72 aa7.24□□□□□ -1.25
DNMT1-208ENST00000586667 H3BT86 120 aa7.24□□□□□ -1.25
DNMT1-208ENST00000586667 Q6JHZ5 121 aa7.23□□□□□ -1.25
DNMT1-208ENST00000586667 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.22□□□□□ -1.25
DNMT1-208ENST00000586667 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.21□□□□□ -1.26
DNMT1-208ENST00000586667 A0A1B0GV90 55 aa7.21□□□□□ -1.26
DNMT1-208ENST00000586667 CD164Q04900 197 aa7.2□□□□□ -1.26
DNMT1-208ENST00000586667 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.2□□□□□ -1.26
DNMT1-208ENST00000586667 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.2□□□□□ -1.26
DNMT1-208ENST00000586667 A0A1W2PNM2 257 aa7.19□□□□□ -1.26
DNMT1-208ENST00000586667 SPINK1P00995 79 aa7.19□□□□□ -1.26
DNMT1-208ENST00000586667 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
DNMT1-208ENST00000586667 Q6Q795 121 aa7.18□□□□□ -1.26
DNMT1-208ENST00000586667 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.18□□□□□ -1.26
DNMT1-208ENST00000586667 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.16□□□□□ -1.26
DNMT1-208ENST00000586667 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
DNMT1-208ENST00000586667 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.15□□□□□ -1.26
DNMT1-208ENST00000586667 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.15□□□□□ -1.26
DNMT1-208ENST00000586667 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.15□□□□□ -1.26
DNMT1-208ENST00000586667 Q5XG85 94 aa7.15□□□□□ -1.26
DNMT1-208ENST00000586667 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.15□□□□□ -1.26
DNMT1-208ENST00000586667 Q6ZQT0 140 aa7.14□□□□□ -1.27
DNMT1-208ENST00000586667 TEN1Q86WV5 123 aa7.13□□□□□ -1.27
DNMT1-208ENST00000586667 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.13□□□□□ -1.27
DNMT1-208ENST00000586667 F8W1H4 67 aa7.12□□□□□ -1.27
DNMT1-208ENST00000586667 CCKP06307 115 aa7.12□□□□□ -1.27
DNMT1-208ENST00000586667 DSCR8Q96T75 97 aa7.12□□□□□ -1.27
DNMT1-208ENST00000586667 LIMD2Q9BT23 127 aa7.11□□□□□ -1.27
DNMT1-208ENST00000586667 A0A087WSZ3 146 aa7.1□□□□□ -1.27
DNMT1-208ENST00000586667 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.09□□□□□ -1.27
DNMT1-208ENST00000586667 ETDBQ3ZM63 59 aa7.08□□□□□ -1.28
DNMT1-208ENST00000586667 LPAP08519 4548 aa7.07□□□□□ -1.28
DNMT1-208ENST00000586667 PDE6GP18545 87 aa7.07□□□□□ -1.28
DNMT1-208ENST00000586667 C1orf195Q5TG92 126 aa7.07□□□□□ -1.28
DNMT1-208ENST00000586667 Q96NJ1 140 aa7.06□□□□□ -1.28
DNMT1-208ENST00000586667 VPS25Q9BRG1 176 aa7.06□□□□□ -1.28
DNMT1-208ENST00000586667 LRP2P98164 4655 aa7.05□□□□□ -1.28
DNMT1-208ENST00000586667 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
DNMT1-208ENST00000586667 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.04□□□□□ -1.28
DNMT1-208ENST00000586667 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.02□□□□□ -1.29
DNMT1-208ENST00000586667 PRR4Q16378 134 aa7.02□□□□□ -1.29
DNMT1-208ENST00000586667 A0A1B0GW54 56 aa7.01□□□□□ -1.29
DNMT1-208ENST00000586667 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.01□□□□□ -1.29
DNMT1-208ENST00000586667 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.01□□□□□ -1.29
DNMT1-208ENST00000586667 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7□□□□□ -1.29
DNMT1-208ENST00000586667 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.98□□□□□ -1.29
DNMT1-208ENST00000586667 TPRXLQ17RH7 258 aa6.97□□□□□ -1.29
DNMT1-208ENST00000586667 LINC00846Q9NV44 126 aa6.95□□□□□ -1.3
DNMT1-208ENST00000586667 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.94□□□□□ -1.3
DNMT1-208ENST00000586667 Q6ZVQ6 151 aa6.92□□□□□ -1.3
DNMT1-208ENST00000586667 SIGMAR1Q99720 223 aa6.92□□□□□ -1.3
DNMT1-208ENST00000586667 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.91□□□□□ -1.3
DNMT1-208ENST00000586667 IGKV4-1P06312 121 aa6.91□□□□□ -1.3
DNMT1-208ENST00000586667 MUC17Q685J3 4493 aa6.9□□□□□ -1.3
DNMT1-208ENST00000586667 NREPQ16612 68 aa6.89□□□□□ -1.31
DNMT1-208ENST00000586667 C9orf92A6NGG3 77 aa6.88□□□□□ -1.31
DNMT1-208ENST00000586667 DSCR10P59022 87 aa6.88□□□□□ -1.31
DNMT1-208ENST00000586667 J3KT08 172 aa6.87□□□□□ -1.31
DNMT1-208ENST00000586667 XP32Q5T750 250 aa6.87□□□□□ -1.31
DNMT1-208ENST00000586667 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.86□□□□□ -1.31
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