RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 NAV2Q8IVL1 2488 aa1.69□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 FAM208BQ5VWN6 2430 aa1.69□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 DMXL1Q9Y485 3027 aa1.69□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa1.68□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 DEFB108AA8MXU0 73 aa1.68□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 H0YGG7 62 aa1.68□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 INE1O15225 51 aa1.68□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 CD52P31358 61 aa1.68□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 COX6A2Q02221 97 aa1.68□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 KLK9Q2XQG4 91 aa1.68□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa1.68□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 RTTNQ86VV8 2226 aa1.68□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 VPS13AQ96RL7 3174 aa1.68□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 IGF2RP11717 2491 aa1.67□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 PLCE1Q9P212 2302 aa1.67□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZRX8 168 aa1.67□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 DSPP15924 2871 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa1.66□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 NBEAQ8NFP9 2946 aa1.66□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 K7EQZ3 153 aa1.66□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 STATHP02808 62 aa1.66□□□□□ -2.14
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PTPRM-204ENST00000577468 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 MYO18BQ8IUG5 2567 aa1.66□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 ALMS1Q8TCU4 4167 aa1.66□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 FRYQ5TBA9 3013 aa1.66□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 KNL1Q8NG31 2342 aa1.66□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 ASXL3Q9C0F0 2248 aa1.66□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 DCHS1Q96JQ0 3298 aa1.65□□□□□ -2.14
PTPRM-204ENST00000577468 G3V318 75 aa1.65□□□□□ -2.15
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PTPRM-204ENST00000577468 ITPR1Q14643 2758 aa1.65□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 AKAP13Q12802 2813 aa1.65□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 IGSF10Q6WRI0 2623 aa1.65□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 HECTD1Q9ULT8 2610 aa1.65□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa1.64□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 MYO15AQ9UKN7 3530 aa1.64□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa1.64□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 ZZEF1O43149 2961 aa1.64□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa1.64□□□□□ -2.15
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PTPRM-204ENST00000577468 MINOS1Q5TGZ0 78 aa1.64□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 DEFB124Q8NES8 71 aa1.64□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 CRIPTQ9P021 101 aa1.64□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 TENM4Q6N022 2769 aa1.63□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa1.63□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 PCOTHQ58A44 107 aa1.63□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 DEFB119Q8N690 84 aa1.63□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 C6orf48Q9UBA6 75 aa1.63□□□□□ -2.15
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PTPRM-204ENST00000577468 J3QKU1 62 aa1.62□□□□□ -2.15
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PTPRM-204ENST00000577468 SPEGQ15772 3267 aa1.61□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 C10orf99Q6UWK7 81 aa1.61□□□□□ -2.15
PTPRM-204ENST00000577468 KAAG1Q9UBP8 84 aa1.61□□□□□ -2.15
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PTPRM-204ENST00000577468 MYO9AB2RTY4 2548 aa1.61□□□□□ -2.15
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PTPRM-204ENST00000577468 TEX15Q9BXT5 2789 aa1.6□□□□□ -2.15
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PTPRM-204ENST00000577468 ITPR3Q14573 2671 aa1.59□□□□□ -2.15
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PTPRM-204ENST00000577468 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa1.58□□□□□ -2.16
PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP1.58□□□□□ -2.16
PTPRM-204ENST00000577468 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa1.58□□□□□ -2.16
PTPRM-204ENST00000577468 FREM2Q5SZK8 3169 aa1.58□□□□□ -2.16
PTPRM-204ENST00000577468 ABCA2Q9BZC7 2435 aa1.58□□□□□ -2.16
PTPRM-204ENST00000577468 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.58□□□□□ -2.16
PTPRM-204ENST00000577468 ABCA1O95477 2261 aa1.57□□□□□ -2.16
PTPRM-204ENST00000577468 FLNCQ14315 2725 aa1.57□□□□□ -2.16
PTPRM-204ENST00000577468 A8MTW9 85 aa1.57□□□□□ -2.16
PTPRM-204ENST00000577468 USMG5Q96IX5 58 aa1.57□□□□□ -2.16
PTPRM-204ENST00000577468 LOC400499M0QZD8 3231 aa1.56□□□□□ -2.16
PTPRM-204ENST00000577468 LRRK2Q5S007 2527 aa1.56□□□□□ -2.16
PTPRM-204ENST00000577468 H0YAA0 97 aa1.56□□□□□ -2.16
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