RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 WFDC13Q8IUB5 93 aa0.75□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM167BQ9NRX6 74 aa0.75□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ABRACLQ9P1F3 81 aa0.75□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFHX4Q86UP3 3567 aa0.75□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF292O60281 2723 aa0.74□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 H0YAA0 97 aa0.74□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 LELP1Q5T871 98 aa0.74□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 IQGAP1P46940 1657 aa0.74□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 CEP350Q5VT06 3117 aa0.73□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 WNK2Q9Y3S1 2297 aa0.73□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 LMO7Q8WWI1 1683 aa0.73□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa0.73□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 MINOS1Q5TGZ0 78 aa0.73□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 KNL1Q8NG31 2342 aa0.73□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa0.73□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP0.72□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC01546A6NGU7 62 aa0.72□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 IAPPP10997 89 aa0.72□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 KLK9Q2XQG4 91 aa0.72□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 CELSR2Q9HCU4 2923 aa0.72□□□□□ -2.29
RABGGTB-205ENST00000462042 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa0.71□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP7AQ04656 1500 aa0.71□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.71□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 C6orf48Q9UBA6 75 aa0.71□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 EP400Q96L91 3159 aa0.71□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa0.7□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 PCNTO95613 3336 aa0.7□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 LOC730098B7Z3J9 87 aa0.7□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB109BQ30KR1 87 aa0.7□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00308Q8TCZ7 52 aa0.7□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 IGF2RP11717 2491 aa0.7□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.7□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.69□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 CHD9Q3L8U1 2897 aa0.69□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 AKAP6Q13023 2319 aa0.69□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 CSMD3Q7Z407 3707 aa0.69□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 TRPM2O94759 1503 aa0.69□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB130BP0DP73 79 aa0.68□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB130AP0DP74 79 aa0.68□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 BRCA2P51587 3418 aa0.68□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 VCANP13611 3396 aa0.68□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 DNHD1Q96M86 4753 aa0.67□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 SZT2Q5T011 3432 aa0.67□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 REV3LO60673 3130 aa0.67□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 CENPFP49454 3210 aa0.66□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 BSNQ9UPA5 3926 aa0.66□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCA2Q9BZC7 2435 aa0.66□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 RPS27P42677 84 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 DMDP11532 3685 aa0.66□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 SPTA1P02549 2419 aa0.66□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 CSPG4Q6UVK1 2322 aa0.65□□□□□ -2.3
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A0C4DFX4 3053 aa0.65□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 XIRP2A4UGR9 3374 aa0.65□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 LAMA3Q16787 3333 aa0.65□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 MUC3AQ02505 3323 aa0.64□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 H3BUA1 57 aa0.64□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 WT1-ASQ06250 92 aa0.64□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa0.64□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 NCOR1O75376 2440 aa0.63□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 UNC80Q8N2C7 3258 aa0.63□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 NFAT5O94916 1531 aa0.63□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 MYO15AQ9UKN7 3530 aa0.63□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 HTTP42858 3142 aa0.62□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 SPINK1P00995 79 aa0.62□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 SMIM2Q9BVW6 85 aa0.62□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 CLTCL1P53675 1640 aa0.62□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 CDH23Q9H251 3354 aa0.62□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAH14Q0VDD8 3507 aa0.62□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 EYSQ5T1H1 3165 aa0.62□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 PCNX1Q96RV3 2341 aa0.61□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 VWFP04275 2813 aa0.61□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 ASPMQ8IZT6 3477 aa0.61□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 COL6A3P12111 3177 aa0.61□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 TRANK1O15050 2925 aa0.61□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 TFF3Q07654 80 aa0.61□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 RELNP78509 3460 aa0.61□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 DSPP15924 2871 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 ATRQ13535 2644 aa0.6□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 FAT2Q9NYQ8 4349 aa0.6□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 LAMA5O15230 3695 aa0.6□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 USP34Q70CQ2 3546 aa0.6□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 CHD6Q8TD26 2715 aa0.59□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 H0YGG7 62 aa0.59□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB106AQ8N104 65 aa0.59□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 S4R3F8 94 aa0.59□□□□□ -2.31
RABGGTB-205ENST00000462042 TENM4Q6N022 2769 aa0.59□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 GCC2Q8IWJ2 1684 aa0.59□□□□□ -2.32
RABGGTB-205ENST00000462042 CSMD1Q96PZ7 3565 aa0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.9 ms