RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380956.8

IRF4-201, Transcript of interferon regulatory factor 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IRF4, Length 5,331 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4-201ENST00000380956 FRYQ5TBA9 3013 aa8.97□□□□□ -0.97
IRF4-201ENST00000380956 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.97□□□□□ -0.97
IRF4-201ENST00000380956 TRANK1O15050 2925 aa8.97□□□□□ -0.97
IRF4-201ENST00000380956 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.97□□□□□ -0.97
IRF4-201ENST00000380956 MGAQ8IWI9 3026 aa8.96□□□□□ -0.97
IRF4-201ENST00000380956 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.95□□□□□ -0.98
IRF4-201ENST00000380956 K7EIL1 84 aa8.94□□□□□ -0.98
IRF4-201ENST00000380956 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.93□□□□□ -0.98
IRF4-201ENST00000380956 Q5W150 140 aa8.92□□□□□ -0.98
IRF4-201ENST00000380956 C9orf92A6NGG3 77 aa8.92□□□□□ -0.98
IRF4-201ENST00000380956 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.92□□□□□ -0.98
IRF4-201ENST00000380956 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
IRF4-201ENST00000380956 CHD6Q8TD26 2715 aa8.9□□□□□ -0.99
IRF4-201ENST00000380956 KRTAP10-3P60369 221 aa8.89□□□□□ -0.99
IRF4-201ENST00000380956 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.88□□□□□ -0.99
IRF4-201ENST00000380956 IGLV7-43P04211 117 aa8.88□□□□□ -0.99
IRF4-201ENST00000380956 Q6ZR54 194 aa8.87□□□□□ -0.99
IRF4-201ENST00000380956 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
IRF4-201ENST00000380956 KALRNO60229 2985 aa8.86□□□□□ -0.99
IRF4-201ENST00000380956 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
IRF4-201ENST00000380956 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.84□□□□□ -0.99
IRF4-201ENST00000380956 KRTAP10-11P60412 298 aa8.83□□□□□ -1
IRF4-201ENST00000380956 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.82□□□□□ -1
IRF4-201ENST00000380956 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.82□□□□□ -1
IRF4-201ENST00000380956 CDH23Q9H251 3354 aa8.8□□□□□ -1
IRF4-201ENST00000380956 SPRR1BP22528 89 aa8.8□□□□□ -1
IRF4-201ENST00000380956 ROMO1P60602 79 aa8.8□□□□□ -1
IRF4-201ENST00000380956 VCANP13611 3396 aa8.79□□□□□ -1
IRF4-201ENST00000380956 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
IRF4-201ENST00000380956 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.78□□□□□ -1
IRF4-201ENST00000380956 ATRQ13535 2644 aa8.78□□□□□ -1
IRF4-201ENST00000380956 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
IRF4-201ENST00000380956 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.76□□□□□ -1.01
IRF4-201ENST00000380956 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.76□□□□□ -1.01
IRF4-201ENST00000380956 CENPEQ02224 2701 aa8.75□□□□□ -1.01
IRF4-201ENST00000380956 NDUFAF8A1L188 74 aa8.75□□□□□ -1.01
IRF4-201ENST00000380956 ITPR1Q14643 2758 aa8.74□□□□□ -1.01
IRF4-201ENST00000380956 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.73□□□□□ -1.01
IRF4-201ENST00000380956 A0A087WTM6 91 aa8.72□□□□□ -1.01
IRF4-201ENST00000380956 REV3LO60673 3130 aa8.72□□□□□ -1.01
IRF4-201ENST00000380956 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
IRF4-201ENST00000380956 LAMA1P25391 3075 aa8.7□□□□□ -1.02
IRF4-201ENST00000380956 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
IRF4-201ENST00000380956 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.69□□□□□ -1.02
IRF4-201ENST00000380956 A0A087X002 238 aa8.69□□□□□ -1.02
IRF4-201ENST00000380956 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.69□□□□□ -1.02
IRF4-201ENST00000380956 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
IRF4-201ENST00000380956 FRYLO94915 3013 aa8.65□□□□□ -1.02
IRF4-201ENST00000380956 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.65□□□□□ -1.03
IRF4-201ENST00000380956 LINC00483Q53H64 154 aa8.65□□□□□ -1.03
IRF4-201ENST00000380956 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.6□□□□□ -1.03
IRF4-201ENST00000380956 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.6□□□□□ -1.03
IRF4-201ENST00000380956 NOTCH1P46531 2555 aa8.59□□□□□ -1.03
IRF4-201ENST00000380956 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.59□□□□□ -1.03
IRF4-201ENST00000380956 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
IRF4-201ENST00000380956 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.59□□□□□ -1.04
IRF4-201ENST00000380956 A8MUU9 505 aa8.58□□□□□ -1.04
IRF4-201ENST00000380956 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
IRF4-201ENST00000380956 ITPR3Q14573 2671 aa8.58□□□□□ -1.04
IRF4-201ENST00000380956 SPEGQ15772 3267 aa8.57□□□□□ -1.04
IRF4-201ENST00000380956 MAST4O15021 2626 aa8.57□□□□□ -1.04
IRF4-201ENST00000380956 TACC2O95359 2948 aa8.56□□□□□ -1.04
IRF4-201ENST00000380956 SZT2Q5T011 3432 aa8.56□□□□□ -1.04
IRF4-201ENST00000380956 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.56□□□□□ -1.04
IRF4-201ENST00000380956 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.55□□□□□ -1.04
IRF4-201ENST00000380956 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.54□□□□□ -1.04
IRF4-201ENST00000380956 PANO1I0J062 215 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF4-201ENST00000380956 LRBAP50851 2863 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF4-201ENST00000380956 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF4-201ENST00000380956 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF4-201ENST00000380956 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF4-201ENST00000380956 ZZEF1O43149 2961 aa8.47□□□□□ -1.05
IRF4-201ENST00000380956 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.47□□□□□ -1.05
IRF4-201ENST00000380956 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.47□□□□□ -1.05
IRF4-201ENST00000380956 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
IRF4-201ENST00000380956 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.45□□□□□ -1.06
IRF4-201ENST00000380956 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.45□□□□□ -1.06
IRF4-201ENST00000380956 COL6A5A8TX70 2615 aa8.45□□□□□ -1.06
IRF4-201ENST00000380956 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.42□□□□□ -1.06
IRF4-201ENST00000380956 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.41□□□□□ -1.06
IRF4-201ENST00000380956 S4R3F8 94 aa8.41□□□□□ -1.06
IRF4-201ENST00000380956 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.4□□□□□ -1.06
IRF4-201ENST00000380956 COL6A3P12111 3177 aa8.39□□□□□ -1.07
IRF4-201ENST00000380956 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.39□□□□□ -1.07
IRF4-201ENST00000380956 STAB1Q9NY15 2570 aa8.37□□□□□ -1.07
IRF4-201ENST00000380956 APCP25054 2843 aa8.31□□□□□ -1.08
IRF4-201ENST00000380956 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.3□□□□□ -1.08
IRF4-201ENST00000380956 R4GN34 69 aa8.29□□□□□ -1.08
IRF4-201ENST00000380956 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
IRF4-201ENST00000380956 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.28□□□□□ -1.08
IRF4-201ENST00000380956 Q6ZSA8 131 aa8.27□□□□□ -1.09
IRF4-201ENST00000380956 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
IRF4-201ENST00000380956 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.27□□□□□ -1.09
IRF4-201ENST00000380956 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
IRF4-201ENST00000380956 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.26□□□□□ -1.09
IRF4-201ENST00000380956 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
IRF4-201ENST00000380956 COL12A1Q99715 3063 aa8.24□□□□□ -1.09
IRF4-201ENST00000380956 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
IRF4-201ENST00000380956 ATMQ13315 3056 aa8.23□□□□□ -1.09
IRF4-201ENST00000380956 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 142.2 ms