RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380956.8

IRF4-201, Transcript of interferon regulatory factor 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IRF4, Length 5,331 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4-201ENST00000380956 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
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IRF4-201ENST00000380956 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.39■■□□□ 1.33
IRF4-201ENST00000380956 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
IRF4-201ENST00000380956 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.97■■□□□ 1.27
IRF4-201ENST00000380956 HRCP23327 699 aa22.93■■□□□ 1.26
IRF4-201ENST00000380956 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.72■■□□□ 1.23
IRF4-201ENST00000380956 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.69■■□□□ 1.22
IRF4-201ENST00000380956 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
IRF4-201ENST00000380956 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
IRF4-201ENST00000380956 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.63■■□□□ 1.21
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IRF4-201ENST00000380956 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
IRF4-201ENST00000380956 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.27■■□□□ 1.16
IRF4-201ENST00000380956 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
IRF4-201ENST00000380956 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
IRF4-201ENST00000380956 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
IRF4-201ENST00000380956 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.01■■□□□ 1.11
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IRF4-201ENST00000380956 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
IRF4-201ENST00000380956 APLP2Q06481 763 aa21.66■■□□□ 1.06
IRF4-201ENST00000380956 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.55■■□□□ 1.04
IRF4-201ENST00000380956 TRIM41Q8WV44 630 aa21.43■■□□□ 1.02
IRF4-201ENST00000380956 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
IRF4-201ENST00000380956 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.39■■□□□ 1.01
IRF4-201ENST00000380956 BCANQ96GW7 911 aa21.34■■□□□ 1.01
IRF4-201ENST00000380956 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
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IRF4-201ENST00000380956 BCL11AQ9H165 835 aa21.1■□□□□ 0.97
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IRF4-201ENST00000380956 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.66■□□□□ 0.9
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IRF4-201ENST00000380956 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.6■□□□□ 0.89
IRF4-201ENST00000380956 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
IRF4-201ENST00000380956 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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IRF4-201ENST00000380956 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
IRF4-201ENST00000380956 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
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IRF4-201ENST00000380956 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.01■□□□□ 0.79
IRF4-201ENST00000380956 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
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IRF4-201ENST00000380956 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
IRF4-201ENST00000380956 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.8■□□□□ 0.76
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IRF4-201ENST00000380956 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
IRF4-201ENST00000380956 ERICH6BQ5W0A0 696 aa19.78■□□□□ 0.76
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IRF4-201ENST00000380956 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
IRF4-201ENST00000380956 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
IRF4-201ENST00000380956 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
IRF4-201ENST00000380956 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
IRF4-201ENST00000380956 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
IRF4-201ENST00000380956 MRS2Q9HD23 443 aa19.52■□□□□ 0.71
IRF4-201ENST00000380956 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.49■□□□□ 0.71
IRF4-201ENST00000380956 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
IRF4-201ENST00000380956 TONSLQ96HA7 1378 aa19.43■□□□□ 0.7
IRF4-201ENST00000380956 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
IRF4-201ENST00000380956 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.38■□□□□ 0.69
IRF4-201ENST00000380956 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19.38■□□□□ 0.69
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