RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPLO60437 1756 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 UACAQ9BZF9 1416 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 PIK3C2BO00750 1634 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 BIRC6Q9NR09 4857 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A087WXM4 84 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMIM13P0DJ93 91 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 DEFB130BP0DP73 79 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 DEFB130AP0DP74 79 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 DMXL1Q9Y485 3027 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADIRFQ15847 76 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPRR2FQ96RM1 72 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-0.66□□□□□ -2.51
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLXNC1O60486 1568 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMARCA2P51531 1590 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 DIP2BQ9P265 1576 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 DEFB121Q5J5C9 76 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNHD1Q96M86 4753 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 WIZO95785 1651 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 LCE6AA0A183 80 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 MT1AP04731 61 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 S100A13Q99584 98 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 HIVEP1P15822 2718 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 TACC2O95359 2948 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 MT4P47944 62 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 RICTORQ6R327 1708 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 CUBNO60494 3623 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 IAPPP10997 89 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 MED14O60244 1454 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 HTTP42858 3142 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 C9orf92A6NGG3 77 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 LYNX1G3V0Z9 82 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZZEF1O43149 2961 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 CRIP1P50238 77 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRLHP81277 87 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 S4R3F8 94 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-487P-201ENST00000365430 ERVK-7P63135 1459 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 KALRNO60229 2985 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 DEPDC5O75140 1603 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 DEFB106AQ8N104 65 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 AKAP9Q99996 3911 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 C18orf32Q8TCD1 76 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAP3K1Q13233 1512 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 TJP1Q07157 1748 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 H3BVH4 76 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 ENHOQ6UWT2 76 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 KDM5DQ9BY66 1539 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC88BA6NC98 1476 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 LAMA1P25391 3075 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-487P-201ENST00000365430 DEFB110Q30KQ9 67 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNAH3Q8TD57 4116 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-487P-201ENST00000365430 MUC17Q685J3 4493 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-487P-201ENST00000365430 CD163L1Q9NR16 1453 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-487P-201ENST00000365430 ITSN1Q15811 1721 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-487P-201ENST00000365430 ABCC1P33527 1531 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-487P-201ENST00000365430 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBL5Q9BZL1 73 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-487P-201ENST00000365430 SACSQ9NZJ4 4579 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNAH11Q96DT5 4516 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-487P-201ENST00000365430 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-487P-201ENST00000365430 HILPDAQ9Y5L2 63 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-487P-201ENST00000365430 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms