RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNHG12Q9BXW3 62 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 S4R3F8 94 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP32Q8NFA0 1604 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 WIZO95785 1651 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-1.23□□□□□ -2.61
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RNU6-552P-201ENST00000362869 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACACBO00763 2458 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPS8Q8N3P4 1428 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 NWD1Q149M9 1564 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 H0YAA0 97 aa-1.25□□□□□ -2.61
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RNU6-552P-201ENST00000362869 LCE6AA0A183 80 aa-1.26□□□□□ -2.61
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RNU6-552P-201ENST00000362869 RABAC1Q9UI14 185 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLIN4Q96Q06 1357 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 PEG3Q9GZU2 1588 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEPDC5O75140 1603 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 NESP48681 1621 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBR1Q8IWV7 1749 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 RYR3Q15413 4870 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-1.28□□□□□ -2.61
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RNU6-552P-201ENST00000362869 PYY3Q5JQD4 70 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIOO75962 3097 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 LTN1O94822 1766 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0C4DFX4 3053 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 MT1HP80294 61 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00643Q86TS7 51 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 LAMA3Q16787 3333 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 NCOA2Q15596 1464 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACYP1P07311 99 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFI6P09912 130 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEFB130BP0DP73 79 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEFB130AP0DP74 79 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEFB110Q30KQ9 67 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 SACSQ9NZJ4 4579 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
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RNU6-552P-201ENST00000362869 DEFA5Q01523 94 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAH8Q96JB1 4490 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 RELNP78509 3460 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 IAPPP10997 89 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
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RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF213Q63HN8 5207 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
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RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 DIP2BQ9P265 1576 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 AKAP12Q02952 1782 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 UMAD1C9J7I0 102 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 K7EP34 96 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNHD1Q96M86 4753 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 FRYQ5TBA9 3013 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-1.34□□□□□ -2.62
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RNU6-552P-201ENST00000362869 Q9H521 79 aa-1.36□□□□□ -2.63
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RNU6-552P-201ENST00000362869 DEFB1P60022 68 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-552P-201ENST00000362869 V9GYS6 101 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCC3O15438 1527 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-552P-201ENST00000362869 C5orf42Q9H799 3197 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-552P-201ENST00000362869 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-1.4□□□□□ -2.63
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RNU6-552P-201ENST00000362869 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 NREPQ16612 68 aa-1.41□□□□□ -2.64
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RNU6-552P-201ENST00000362869 KIF14Q15058 1648 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 BPTFQ12830 3046 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 TDRG1Q3Y452 100 aa-1.45□□□□□ -2.64
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