RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637887.1

ARID1B-231, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5

Gene ARID1B, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-231	ENST00000637887	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	LINC01006	Q8NI28	216 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	SPG11	Q96JI7	2443 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887		K7EQD1	137 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	IGLV1-51	P01701	117 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	MOBP	Q13875	183 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	CREBBP	Q92793	2442 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	USP24	Q9UPU5	2620 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	PRR15L	Q9BU68	103 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	FLNC	Q14315	2725 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887		H0YGX0	51 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	CELA1	Q9UNI1	258 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	COL12A1	Q99715	3063 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ARID1B-231	ENST00000637887	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		3.59	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	BPY2	O14599	106 aa		3.59	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	NDUFA1	O15239	70 aa		3.59	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	NDUFB1	O75438	58 aa		3.59	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887		Q9BRP9	147 aa		3.59	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		3.59	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	LRRK2	Q5S007	2527 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	REG3A	Q06141	175 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887		Q8N814	137 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	PTPN13	Q12923	2485 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887		Q6ZTI0	123 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	SORL1	Q92673	2214 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	LCE6A	A0A183	80 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	CRP	P02741	224 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	PDE6G	P18545	87 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	OCR1	Q9BZK8	76 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	PRO0255	Q9UI72	69 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	FBN2	P35556	2912 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	APC	P25054	2843 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	NCR3	O14931	201 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	RTL8C	O15255	209 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	LY6G6D	O95868	133 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	MUC7	Q8TAX7	377 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	FAM104A	Q969W3	186 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	LINC00167	Q96N53	147 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	ITPR3	Q14573	2671 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	VPS13C	Q709C8	3753 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887		H3BQ85	93 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	HAMP	P81172	84 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	COX7B2	Q8TF08	81 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ARID1B-231	ENST00000637887	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms