RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521038.5

PHF20L1-217, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, human

TSL 5

Gene PHF20L1, Length 427 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20L1-217	ENST00000521038	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PHF20L1-217	ENST00000521038	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PHF20L1-217	ENST00000521038	RTL8C	O15255	209 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PHF20L1-217	ENST00000521038	REG3G	Q6UW15	175 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGFL1	Q6UW32	110 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PHF20L1-217	ENST00000521038		X6R8D5	127 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PHF20L1-217	ENST00000521038	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PHF20L1-217	ENST00000521038		A0A087WSZ3	146 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PHF20L1-217	ENST00000521038	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PHF20L1-217	ENST00000521038	FRY	Q5TBA9	3013 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	3.71	□□□□□ -1.82	8e-11	■■■■■ 40.5
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	C15orf56	Q8N910	161 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	CACNA1H	O95180	2353 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	SORL1	Q92673	2214 aa		3.71	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038		A0A096LPF7	62 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038		A0A1B0GU69	56 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	CDK2AP2	O75956	126 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRB1	P04280	392 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		3.7	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRIO	O75962	3097 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038		A8MU10	97 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	SPINK7	P58062	85 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	HRES1	P13985	223 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	DEFB123	Q8N688	67 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	VCAN	P13611	3396 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	LAMA3	Q16787	3333 aa		3.68	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		3.67	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	USP34	Q70CQ2	3546 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	DMAC1	Q96GE9	116 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	CDH23	Q9H251	3354 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	CFAP54	Q96N23	3096 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	CEP290	O15078	2479 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	ACACA	Q13085	2346 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	KALRN	O60229	2985 aa		3.65	□□□□□ -1.82
PHF20L1-217	ENST00000521038	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038		A0A1B0GVX0	72 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	C14orf177	Q52M58	125 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		3.63	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	KRTAP10-9	P60411	292 aa		3.63	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.63	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	PCOTH	Q58A44	107 aa		3.63	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	FRYL	O94915	3013 aa		3.63	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		3.63	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		3.62	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		3.62	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	AKAP6	Q13023	2319 aa		3.61	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		3.61	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	INAFM1	C9JVW0	142 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	DEFB135	Q30KP9	77 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038		K7ERS5	55 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	HTN3	P15516	51 aa		3.59	□□□□□ -1.83
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		3.59	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	CREBBP	Q92793	2442 aa		3.59	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		3.59	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZFHX3	Q15911	3703 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	MGA	Q8IWI9	3026 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	ROMO1	P60602	79 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	NCOR1	O75376	2440 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	SPTA1	P02549	2419 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	CSAG1	Q6PB30	78 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGLV7-43	P04211	117 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		3.56	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	SPEG	Q15772	3267 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF861P	O60384	105 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	LY6G6C	O95867	125 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	LINC00483	Q53H64	154 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038		Q96NJ1	140 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		3.53	□□□□□ -1.84
PHF20L1-217	ENST00000521038	FAM168B	A1KXE4	195 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRLH	P81277	87 aa		3.52	□□□□□ -1.85

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