RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RGPD5Q99666 1765 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AKAP6Q13023 2319 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H3BVH4 76 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NDUFA4O00483 81 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DEFA5Q01523 94 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NWD1Q149M9 1564 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 VWFP04275 2813 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MDN1Q9NU22 5596 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LCE6AA0A183 80 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COX6B2Q6YFQ2 88 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KMT2DO14686 5537 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RYR2Q92736 4967 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HYDINQ4G0P3 5121 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ABCA13Q86UQ4 5058 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RYR3Q15413 4870 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC88BA6NC98 1476 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TIAM2Q8IVF5 1701 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDCD5O14737 125 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRM1P04553 51 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UGGT2Q9NYU1 1516 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD163L1Q9NR16 1453 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NCOR2Q9Y618 2525 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OTOGQ6ZRI0 2925 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MUC5ACP98088 5654 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SSPOA2VEC9 5147 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGF2RP11717 2491 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A0C4DFX4 3053 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYO5CQ9NQX4 1742 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HERC1Q15751 4861 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CFAP43Q8NDM7 1665 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COL6A5A8TX70 2615 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAT4Q6V0I7 4981 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IQGAP3Q86VI3 1631 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAST4O15021 2626 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNHD1Q96M86 4753 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NESP48681 1621 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SCN11AQ9UI33 1791 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTPN13Q12923 2485 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WDFY4Q6ZS81 3184 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ABCA2Q9BZC7 2435 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF213Q63HN8 5207 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RICTORQ6R327 1708 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BIRC6Q9NR09 4857 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHD8Q9HCK8 2581 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCNTO95613 3336 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TENM4Q6N022 2769 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CEP350Q5VT06 3117 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRO3102Q9H379 93 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HILPDAQ9Y5L2 63 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLCH1Q4KWH8 1693 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LMTK2Q8IWU2 1503 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DUOX2Q9NRD8 1548 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NCOR1O75376 2440 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHD6Q8TD26 2715 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 M0R2T5 61 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HECTD1Q9ULT8 2610 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PDZD2O15018 2839 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYO18BQ8IUG5 2567 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KALRNO60229 2985 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BSNQ9UPA5 3926 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ITPR3Q14573 2671 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C3orf79P0CE67 100 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LINC00158P58513 81 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C4AP0C0L4 1744 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C4BP0C0L5 1744 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPG5Q9HCE0 2579 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ENHOQ6UWT2 76 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFHX4Q86UP3 3567 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HMCN2Q8NDA2 5059 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HERC2O95714 4834 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WNK2Q9Y3S1 2297 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZANQ9Y493 2812 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATXN8Q156A1 80 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GNG13Q9P2W3 67 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPTBN4Q9H254 2564 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa0.36□□□□□ -2.35
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