RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A087WWC5 75 aa0.86□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP0.86□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 SMIM4Q8WVI0 70 aa0.86□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00846Q9NV44 126 aa0.86□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 ASXL3Q9C0F0 2248 aa0.86□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 MAST1Q9Y2H9 1570 aa0.86□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa0.86□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 SLIT1O75093 1534 aa0.85□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 CLASP1Q7Z460 1538 aa0.85□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 SYCP2Q9BX26 1530 aa0.85□□□□□ -2.27
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RABGGTB-202ENST00000370826 S100A3P33764 101 aa0.85□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 TJP1Q07157 1748 aa0.85□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 C10orf113Q5VZT2 155 aa0.85□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 Q6ZRX8 168 aa0.85□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 SMIM11BQ8TCY0 68 aa0.85□□□□□ -2.27
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RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa0.85□□□□□ -2.27
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RABGGTB-202ENST00000370826 URB1O60287 2271 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 COX8AP10176 69 aa0.84□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP0.84□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL37P61927 97 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP0.84□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATA8Q6RVD6 105 aa0.84□□□□□ -2.27
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFHX3Q15911 3703 aa0.84□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A087WXM4 84 aa0.83□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa0.83□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1B0GUT8 65 aa0.83□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 H3BVH4 76 aa0.83□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 K7EIL1 84 aa0.83□□□□□ -2.28
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RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 PLAC4Q8WY50 150 aa0.83□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 C3P01024 1663 aa0.83□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 ABCC6O95255 1503 aa0.83□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 ERCC6L2Q5T890 1561 aa0.83□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa0.82□□□□□ -2.28
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RABGGTB-202ENST00000370826 C3orf79P0CE67 100 aa0.82□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 HAMPP81172 84 aa0.82□□□□□ -2.28
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RABGGTB-202ENST00000370826 TULP4Q9NRJ4 1543 aa0.82□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa0.82□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 JMJD1CQ15652 2540 aa0.82□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 NWD1Q149M9 1564 aa0.82□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa0.81□□□□□ -2.28
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RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV21A0A0B4J279 112 aa0.81□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1B0GU69 56 aa0.81□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
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RABGGTB-202ENST00000370826 UGGT1Q9NYU2 1555 aa0.8□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa0.8□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 NREPQ16612 68 aa0.8□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 DEFB112Q30KQ8 113 aa0.8□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa0.8□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 WFDC9Q8NEX5 89 aa0.8□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 GNG13Q9P2W3 67 aa0.8□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa0.8□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP0.8□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 ATXN8Q156A1 80 aa0.79□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.79□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM208BQ5VWN6 2430 aa0.79□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa0.78□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 LCE6AA0A183 80 aa0.78□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 GAFA1Q96PS6 74 aa0.78□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 FANCD2Q9BXW9 1451 aa0.78□□□□□ -2.28
RABGGTB-202ENST00000370826 C4AP0C0L4 1744 aa0.78□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 C4BP0C0L5 1744 aa0.78□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 PIN1P1O15428 100 aa0.77□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFB1O75438 58 aa0.77□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 SMIM5Q71RC9 77 aa0.77□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa0.77□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 CPS1P31327 1500 aa0.77□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa0.77□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 PLCE1Q9P212 2302 aa0.77□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.76□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 COX7BP24311 80 aa0.76□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 CACNA1EQ15878 2313 aa0.75□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP0.75□□□□□ -2.292e-10■■■■■ 78.7
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RABGGTB-202ENST00000370826 LINC01549A6NIU2 74 aa0.75□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFA4O00483 81 aa0.75□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 ENHOQ6UWT2 76 aa0.75□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.74□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 NOTCH1P46531 2555 aa0.74□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 I3L2K1 104 aa0.74□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 FXYD6P3P58550 94 aa0.74□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 C10orf95Q9H7T3 257 aa0.74□□□□□ -2.29
RABGGTB-202ENST00000370826 ADCY10Q96PN6 1610 aa0.74□□□□□ -2.29
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