RNA–Protein interactions for RNA: YGL079W

KXD1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene KXD1, Length 657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KXD1	YGL079W	IRC3	Q06683	689 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	ARG1	P22768	420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	RTS3	P53289	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	ORM2	Q06144	216 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	SLX4	Q12098	748 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	RGT2	Q12300	763 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	DSS4	P32601	143 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	BEM3	P32873	1128 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	EXO1	P39875	702 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	YJL043W	P47053	257 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
KXD1	YGL079W	PSF3	Q12146	194 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	URA3	P03962	267 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	MAD2	P40958	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	STP1	Q00947	519 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	PCL8	Q08966	492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	HOS1	Q12214	470 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	GSY2	P27472	705 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	TOM20	P35180	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	APD1	P38281	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	YIL092W	P40497	633 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	TDA10	P42938	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	BST1	P43571	1029 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	YNR071C	P53757	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	WAR1	Q03631	944 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	BET2	P20133	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	MRPL9	P31334	269 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	OPT1	P40897	799 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	NMD5	P46970	1048 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	YJR008W	P47085	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	DIN7	Q12086	430 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	AAC1	P04710	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	PHO3	P24031	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KXD1	YGL079W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	BSP1	Q06604	576 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	NUR1	Q12066	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	CDC5	P32562	705 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	STB5	P38699	743 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	GSM1	P42950	618 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	SNO3	P43544	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	SAE2	P46946	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	YNL034W	P53963	612 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	MPS1	P54199	764 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	RSC9	Q03124	581 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	CBP3	P21560	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	TGL1	P34163	548 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	SDH8	P38345	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	SAW1	P39735	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	YNL092W	P53934	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	CRT10	Q08226	957 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	GEP3	Q08622	556 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	CIR2	Q08822	631 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	SDS22	P36047	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	TAF5	P38129	798 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	COS12	P53053	380 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	TGL2	P54857	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	SND1	Q04007	877 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	TRI1	Q05024	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	ENT2	Q05785	613 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	HRD3	Q05787	833 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	GDA1	P32621	518 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	SWE1	P32944	819 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	VFA1	P40080	203 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	IMA5	P40884	581 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	IDS2	P46958	469 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	PEX8	P53248	589 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	VPS72	Q03388	795 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	CYK3	Q07533	885 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KXD1	YGL079W	ADH4	P10127	382 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KXD1	YGL079W	YLF2	P38746	405 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KXD1	YGL079W	SWD1	P39706	426 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KXD1	YGL079W	ASK10	P48361	1146 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KXD1	YGL079W	TRS31	Q03337	283 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KXD1	YGL079W	RAD33	Q04231	177 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KXD1	YGL079W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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