RNA–Protein interactions for RNA: snR46

snR46, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR46, Length 197 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR46	snR46	DAN4	P47179	1161 aa		5.45	□□□□□ -1.54
snR46	snR46	PTC4	P38089	393 aa		5.43	□□□□□ -1.54
snR46	snR46	PRE3	P38624	215 aa		5.43	□□□□□ -1.54
snR46	snR46	RCR1	P38212	213 aa		5.42	□□□□□ -1.54
snR46	snR46	YEL023C	P39992	682 aa		5.41	□□□□□ -1.54
snR46	snR46	VRP1	P37370	817 aa		5.36	□□□□□ -1.55
snR46	snR46	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
snR46	snR46	PML39	Q03760	334 aa		5.34	□□□□□ -1.55
snR46	snR46	XDJ1	P39102	459 aa		5.33	□□□□□ -1.56
snR46	snR46	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
snR46	snR46	MIF2	P35201	549 aa		5.3	□□□□□ -1.56
snR46	snR46	ATH1	P48016	1211 aa		5.28	□□□□□ -1.56
snR46	snR46	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
snR46	snR46	YDR344C	Q05510	147 aa		5.26	□□□□□ -1.57
snR46	snR46	GUT1	P32190	709 aa		5.24	□□□□□ -1.57
snR46	snR46	PEX29	Q03370	554 aa		5.24	□□□□□ -1.57
snR46	snR46	MID1	P41821	548 aa		5.23	□□□□□ -1.57
snR46	snR46	ARH1	P48360	493 aa		5.22	□□□□□ -1.57
snR46	snR46	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
snR46	snR46	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
snR46	snR46	SPT23	P35210	1082 aa		5.19	□□□□□ -1.58
snR46	snR46	EDS1	P38073	919 aa		5.17	□□□□□ -1.58
snR46	snR46	HAP5	Q02516	242 aa		5.15	□□□□□ -1.59
snR46	snR46	MPH3	P0CE00	602 aa		5.13	□□□□□ -1.59
snR46	snR46	COQ8	P27697	501 aa		5.13	□□□□□ -1.59
snR46	snR46	RAM2	P29703	316 aa		5.13	□□□□□ -1.59
snR46	snR46	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
snR46	snR46	AI4	P03878	556 aa		5.12	□□□□□ -1.59
snR46	snR46	SOL3	P38858	249 aa		5.11	□□□□□ -1.59
snR46	snR46	NST1	P53935	1240 aa		5.1	□□□□□ -1.59
snR46	snR46	BNI4	P53858	892 aa		5.09	□□□□□ -1.59
snR46	snR46	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
snR46	snR46	NMA111	P53920	997 aa		5.06	□□□□□ -1.6
snR46	snR46	MPC54	Q08550	464 aa		5.06	□□□□□ -1.6
snR46	snR46	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
snR46	snR46	YGR273C	P53329	174 aa		5.04	□□□□□ -1.6
snR46	snR46	SRC1	Q03707	834 aa		5.03	□□□□□ -1.6
snR46	snR46	DPL1	Q05567	589 aa		5.01	□□□□□ -1.61
snR46	snR46	RAS1	P01119	309 aa		5	□□□□□ -1.61
snR46	snR46	SLI15	P38283	698 aa		5	□□□□□ -1.61
snR46	snR46	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
snR46	snR46	GYP1	Q08484	637 aa		4.99	□□□□□ -1.61
snR46	snR46	RGA2	Q06407	1009 aa		4.98	□□□□□ -1.61
snR46	snR46	RGA1	P39083	1007 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR46	snR46	ISU2	Q12056	156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR46	snR46	YPR015C	Q12531	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR46	snR46	TRK1	P12685	1235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR46	snR46	KEX1	P09620	729 aa		4.91	□□□□□ -1.62
snR46	snR46	AMS1	P22855	1083 aa		4.91	□□□□□ -1.62
snR46	snR46	CDC73	Q06697	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
snR46	snR46	RAM1	P22007	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR46	snR46	SAS4	Q04003	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
snR46	snR46	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
snR46	snR46	PDR1	P12383	1068 aa		4.87	□□□□□ -1.63
snR46	snR46	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
snR46	snR46	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
snR46	snR46	VHR2	P40041	505 aa		4.84	□□□□□ -1.63
snR46	snR46	RAD54	P32863	898 aa		4.82	□□□□□ -1.64
snR46	snR46	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
snR46	snR46	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
snR46	snR46	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
snR46	snR46	PEX21	P50091	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
snR46	snR46	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
snR46	snR46	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
snR46	snR46	ERG12	P07277	443 aa		4.79	□□□□□ -1.64
snR46	snR46	SDH2	P21801	266 aa		4.79	□□□□□ -1.64
snR46	snR46	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
snR46	snR46	KIC1	P38692	1080 aa		4.78	□□□□□ -1.64
snR46	snR46	YRR1	Q12172	810 aa		4.78	□□□□□ -1.64
snR46	snR46	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
snR46	snR46	GCR2	Q01722	534 aa		4.77	□□□□□ -1.65
snR46	snR46	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
snR46	snR46	YPL062W	Q02781	134 aa		4.75	□□□□□ -1.65
snR46	snR46	NPL4	P33755	580 aa		4.74	□□□□□ -1.65
snR46	snR46	IFH1	P39520	1085 aa		4.73	□□□□□ -1.65
snR46	snR46	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
snR46	snR46	BRE2	P43132	505 aa		4.72	□□□□□ -1.65
snR46	snR46	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
snR46	snR46	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
snR46	snR46	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
snR46	snR46	ISM1	P48526	1002 aa		4.7	□□□□□ -1.66
snR46	snR46	NUD1	P32336	851 aa		4.69	□□□□□ -1.66
snR46	snR46	STR2	P47164	639 aa		4.69	□□□□□ -1.66
snR46	snR46	CSC1	Q06538	782 aa		4.69	□□□□□ -1.66
snR46	snR46	TFB4	Q12004	338 aa		4.69	□□□□□ -1.66
snR46	snR46	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
snR46	snR46	CST6	P40535	587 aa		4.67	□□□□□ -1.66
snR46	snR46	CLA4	P48562	842 aa		4.67	□□□□□ -1.66
snR46	snR46	YDR090C	Q03193	310 aa		4.67	□□□□□ -1.66
snR46	snR46	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	LAM6	Q08001	693 aa		4.63	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	RRN7	P40992	514 aa		4.62	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	CDC4	P07834	779 aa		4.61	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	SEC2	P17065	759 aa		4.61	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	MET22	P32179	357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	BDP1	P46678	594 aa		4.6	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	TY1A-DR4	O74302	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR46	snR46	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.2 ms