RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C NUP159P40477 1460 aa11.86□□□□□ -0.51
SPE3YPR069C ITT1Q04638 464 aa11.84□□□□□ -0.51
SPE3YPR069C VPS15P22219 1454 aa11.83□□□□□ -0.52
SPE3YPR069C VTH1P40438 1549 aa11.82□□□□□ -0.52
SPE3YPR069C VTH2P40890 1549 aa11.82□□□□□ -0.52
SPE3YPR069C TSC11P40061 1430 aa11.8□□□□□ -0.52
SPE3YPR069C IRC20Q06554 1556 aa11.75□□□□□ -0.53
SPE3YPR069C MMS1Q06211 1407 aa11.75□□□□□ -0.53
SPE3YPR069C DRS2P39524 1355 aa11.74□□□□□ -0.53
SPE3YPR069C MYO4P32492 1471 aa11.73□□□□□ -0.53
SPE3YPR069C DNF2Q12675 1612 aa11.68□□□□□ -0.54
SPE3YPR069C SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SPE3YPR069C ABP1P15891 592 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SPE3YPR069C SPO14P36126 1683 aa11.65□□□□□ -0.54
SPE3YPR069C SNT2P53127 1403 aa11.64□□□□□ -0.55
SPE3YPR069C NUP170P38181 1502 aa11.62□□□□□ -0.55
SPE3YPR069C YTA7P40340 1379 aa11.58□□□□□ -0.56
SPE3YPR069C ULS1Q08562 1619 aa11.58□□□□□ -0.56
SPE3YPR069C MLP2P40457 1679 aa11.57□□□□□ -0.56
SPE3YPR069C PDR12Q02785 1511 aa11.55□□□□□ -0.56
SPE3YPR069C YFR006WP43590 535 aa11.54□□□□□ -0.56
SPE3YPR069C DOP1Q03921 1698 aa11.52□□□□□ -0.56
SPE3YPR069C STH1P32597 1359 aa11.51□□□□□ -0.57
SPE3YPR069C MET10P39692 1035 aa11.49□□□□□ -0.57
SPE3YPR069C GDB1Q06625 1536 aa11.45□□□□□ -0.58
SPE3YPR069C TRM3Q07527 1436 aa11.42□□□□□ -0.58
SPE3YPR069C YOR093CQ12275 1648 aa11.4□□□□□ -0.58
SPE3YPR069C IQG1Q12280 1495 aa11.39□□□□□ -0.59
SPE3YPR069C BUD3P25558 1636 aa11.38□□□□□ -0.59
SPE3YPR069C PDR10P51533 1564 aa11.38□□□□□ -0.59
SPE3YPR069C RTT106P40161 455 aa11.35□□□□□ -0.59
SPE3YPR069C CHC1P22137 1653 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
SPE3YPR069C PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
SPE3YPR069C NUP157P40064 1391 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
SPE3YPR069C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SPE3YPR069C ARO1P08566 1588 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SPE3YPR069C DNF3Q12674 1656 aa11.21□□□□□ -0.61
SPE3YPR069C YBT1P32386 1661 aa11.19□□□□□ -0.62
SPE3YPR069C CAT8P39113 1433 aa11.12□□□□□ -0.63
SPE3YPR069C TAF7Q05021 590 aa11.12□□□□□ -0.63
SPE3YPR069C TY3B-GQ99315 1547 aa11.09□□□□□ -0.63
SPE3YPR069C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SPE3YPR069C GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SPE3YPR069C YSP2Q06681 1438 aa11.02□□□□□ -0.64
SPE3YPR069C USO1P25386 1790 aa11.01□□□□□ -0.65
SPE3YPR069C YAP3P38749 330 aa10.99□□□□□ -0.65
SPE3YPR069C IFH1P39520 1085 aa10.99□□□□□ -0.65
SPE3YPR069C BNR1P40450 1375 aa10.96□□□□□ -0.65
SPE3YPR069C CKB1P43639 278 aa10.88□□□□□ -0.67
SPE3YPR069C MAK10Q02197 733 aa10.88□□□□□ -0.67
SPE3YPR069C HAP1P0CE41 1502 aa10.88□□□□□ -0.67
SPE3YPR069C URN1Q06525 465 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SPE3YPR069C TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SPE3YPR069C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
SPE3YPR069C IML1P47170 1584 aa10.82□□□□□ -0.68
SPE3YPR069C SRB8P25648 1427 aa10.8□□□□□ -0.68
SPE3YPR069C VMR1P38735 1592 aa10.72□□□□□ -0.69
SPE3YPR069C IPL1P38991 367 aa10.71□□□□□ -0.69
SPE3YPR069C YMR196WQ04336 1088 aa10.67□□□□□ -0.7
SPE3YPR069C BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SPE3YPR069C THI12P42883 340 aa10.61□□□□□ -0.71
SPE3YPR069C THI5P43534 340 aa10.61□□□□□ -0.71
SPE3YPR069C THI11P47183 340 aa10.61□□□□□ -0.71
SPE3YPR069C THI13Q07748 340 aa10.61□□□□□ -0.71
SPE3YPR069C TYS1P36421 394 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
SPE3YPR069C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
SPE3YPR069C FAP1P53971 965 aa10.52□□□□□ -0.73
SPE3YPR069C GCN2P15442 1659 aa10.5□□□□□ -0.73
SPE3YPR069C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
SPE3YPR069C IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SPE3YPR069C PDR11P40550 1411 aa10.41□□□□□ -0.74
SPE3YPR069C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
SPE3YPR069C NUP192P47054 1683 aa10.4□□□□□ -0.74
SPE3YPR069C BCK1Q01389 1478 aa10.36□□□□□ -0.75
SPE3YPR069C PTP3P40048 928 aa10.35□□□□□ -0.75
SPE3YPR069C KRE5P22023 1365 aa10.35□□□□□ -0.75
SPE3YPR069C GLN1P32288 370 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
SPE3YPR069C SSM4P40318 1319 aa10.33□□□□□ -0.76
SPE3YPR069C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
SPE3YPR069C YNR029CP53729 429 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
SPE3YPR069C RIA1P53893 1110 aa10.29□□□□□ -0.76
SPE3YPR069C YRF1-2P40105 1681 aa10.28□□□□□ -0.76
SPE3YPR069C MRX12P47084 519 aa10.28□□□□□ -0.76
SPE3YPR069C APP1P53933 587 aa10.28□□□□□ -0.76
SPE3YPR069C RAV1P47104 1357 aa10.25□□□□□ -0.77
SPE3YPR069C RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SPE3YPR069C REB1P21538 810 aa10.18□□□□□ -0.78
SPE3YPR069C TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
SPE3YPR069C TY4B-HP0C2J7 1802 aa10.17□□□□□ -0.78
SPE3YPR069C TY4B-JP47024 1803 aa10.17□□□□□ -0.78
SPE3YPR069C ALD4P46367 519 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
SPE3YPR069C CAB1Q04430 367 aa10.16□□□□□ -0.78
SPE3YPR069C YMR074CQ04773 145 aa10.16□□□□□ -0.78
SPE3YPR069C RAD9P14737 1309 aa10.15□□□□□ -0.78
SPE3YPR069C RTC1Q08281 1341 aa10.15□□□□□ -0.78
SPE3YPR069C PAF1P38351 445 aa10.13□□□□□ -0.79
SPE3YPR069C ENT1Q12518 454 aa10.13□□□□□ -0.79
SPE3YPR069C PRI1P10363 409 aa10.11□□□□□ -0.79
SPE3YPR069C ENV9Q08651 330 aa10.11□□□□□ -0.79
SPE3YPR069C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.1 ms